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一种新的RNA二级结构特征序列表示及相似性分析
被引量：
1
1
作者
梁成
骆嘉伟
李仁发
《计算机应用研究》
CSCD
北大核心
2011年第3期969-971,979,共4页
针对目前不同的RNA二级结构可能对应相同特征序列的问题,提出了一种新的RNA二级结构特征序列表示法,根据不同的RNA二级结构的子结构类型,分别给出相应的字符表示并由此得到新的特征序列。利用Lempel-Ziv复杂度对两组RNA二级结构进行了...
针对目前不同的RNA二级结构可能对应相同特征序列的问题,提出了一种新的RNA二级结构特征序列表示法,根据不同的RNA二级结构的子结构类型,分别给出相应的字符表示并由此得到新的特征序列。利用Lempel-Ziv复杂度对两组RNA二级结构进行了相似性分析,实验结果表明了该表示法可以有效地提取RNA二级结构的结构信息,避免了不同RNA二级结构可能对应相同特征序列的问题。
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关键词
RNA二级结构
特征序列表示
相似性分析
Lempel-Ziv复杂度
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职称材料
题名
一种新的RNA二级结构特征序列表示及相似性分析
被引量：
1
1
作者
梁成
骆嘉伟
李仁发
机构
湖南大学计算机与通信学院
出处
《计算机应用研究》
CSCD
北大核心
2011年第3期969-971,979,共4页
基金
国家自然科学基金资助项目(60873184)
文摘
针对目前不同的RNA二级结构可能对应相同特征序列的问题,提出了一种新的RNA二级结构特征序列表示法,根据不同的RNA二级结构的子结构类型,分别给出相应的字符表示并由此得到新的特征序列。利用Lempel-Ziv复杂度对两组RNA二级结构进行了相似性分析,实验结果表明了该表示法可以有效地提取RNA二级结构的结构信息,避免了不同RNA二级结构可能对应相同特征序列的问题。
关键词
RNA二级结构
特征序列表示
相似性分析
Lempel-Ziv复杂度
Keywords
RNA secondary structure
representation for characteristic sequence
analysis of similarity
Lempel-Ziv complexity
分类号
TP391 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一种新的RNA二级结构特征序列表示及相似性分析
梁成
骆嘉伟
李仁发
《计算机应用研究》
CSCD
北大核心
2011
1
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