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AMSS-PCR在肺癌突变基因检测中的价值研究被引量：1: 1; 作者金柯谢绚 +6 位作者潘越江王科喜陈柏深吴多光沈卓坚王铭辉张惠忠《中国肺癌杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第11期815-820,共6页; 背景与目的肺癌驱动基因检测具有重要意义,目前检测方法多样,临床适用性有差异。本研究旨在比较基于扩增阻碍突变系统-聚合酶链反应(Amplification Refractory Mutation System-polymerase chain reaction,ARMS-PCR)技术的试剂盒与一代... 展开更多; 关键词一代测序突变位点特异扩增法扩增阻碍突变系统实时定量聚合酶链式反应肺癌突变基因检测; 在线阅读下载PDF 职称材料

江浙地区菱品种遗传多样性的SLAF-seq分析: 2; 作者袁晔刘睿 +5 位作者王凌云沈盟叶雪莲权新华王瑞森姚祥坦《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2023年第8期1773-1781,共9页; 利用SLAF-seq技术对江浙地区17个主要的栽培菱品种和1个野生菱种质进行高通量测序,获得445594个SLAF标签,鉴定到多态性SLAF标签95931个。通过序列分析,获得269338个SNP标记,并基于这些SNP构建18份菱样品的遗传发育树及进行群体结构分析... 展开更多; 关键词菱遗传多样性特异性位点扩增片段测序单核苷酸多态性; 在线阅读下载PDF 职称材料

贵阳花溪古茶树遗传进化的SNP分析被引量：19: 3; 作者陈立杰张素勤 +6 位作者尹杰宋勤飞牛素贞赵基英陈丹萍王胜威耿广东《西南大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期33-40,共8页; 试验采用SNP(单核苷酸多态性)技术对贵阳花溪古茶树资源的遗传多样性、群体结构和遗传进化进行了分析.结果表明,利用生物信息学分析古茶树样品的重测序数据,获得了1656258个SLAF标签,古茶树样品平均测序深度为24.21x,其中多态性的SLAF... 展开更多; 关键词古茶树特异位点扩增片段测序(slaf-seq) SNP 进化树 PCA 遗传结构; 在线阅读下载PDF 职称材料

野生大豆抗胞囊线虫QTL定位被引量：7: 4; 作者袁翠平齐广勋 +5 位作者李玉秋刘晓冬王英男王玉民赵洪锟董英山《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期887-893,共7页; 大豆胞囊线虫病(soybean cyst nematode,SCN)是大豆生产上的重要病害,野生大豆是拓宽大豆抗病育种遗传基础的重要种质资源。为发掘野生大豆优异基因资源,利用SLAF-seq技术,以杂交组合"绥农14×ZYD03685"的亲本、126个F2... 展开更多; 关键词野生大豆大豆胞囊线虫 QTL slaf-seq(特异位点扩增片段测序); 在线阅读下载PDF 职称材料

题名AMSS-PCR在肺癌突变基因检测中的价值研究被引量：1: 1; 作者金柯谢绚潘越江王科喜陈柏深吴多光沈卓坚王铭辉张惠忠; 机构中山大学孙逸仙纪念医院胸外科; 出处《中国肺癌杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第11期815-820,共6页; 文摘背景与目的肺癌驱动基因检测具有重要意义,目前检测方法多样,临床适用性有差异。本研究旨在比较基于扩增阻碍突变系统-聚合酶链反应(Amplification Refractory Mutation System-polymerase chain reaction,ARMS-PCR)技术的试剂盒与一代测序及ARMS-qPCR检测肺癌突变基因的敏感性和特异性,探究突变位点特异扩增法(Amplification Mutation Specific System, AMSS)-PCR技术在肺癌突变基因检测中的应用价值。方法对前期已行ARMS-PCR检测的肿瘤标本进行一代测序及试剂盒检测,比较各种方法的检测结果,并对检测结果进行统计学分析。结果本研究共收集了309例肺癌标本。试剂盒与一代测序符合率97.41%,ARMS-PCR的符合率97.73%。试剂盒与一代测序、试剂盒与实时定量聚合酶链反应(quantitative real-time polymerase chain reaction, qPCR)、qPCR与一代测序一致性检验的Kappa值分别为0.946、0.953、0.913。试剂盒以一代测序为参照的受试者工作特征曲线(receiver operatingcharacteristiccurve,ROC)曲线下面积为0.976,以qPCR为参照的ROC曲线下面积为0.975。结论 AMSSqPCR技术能够有效检测肺癌突变基因,具有较好的临床应用价值。; 关键词一代测序突变位点特异扩增法扩增阻碍突变系统实时定量聚合酶链式反应肺癌突变基因检测; Keywords Sanger sequencing Amplification Mutation Specific System Amplification Refractory Mutation Sys- tem Quantitative real-time polymerase chain reaction Lung cancer gene mutation detection; 分类号 R734.2 [医药卫生—肿瘤] R730.43 [医药卫生—肿瘤]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名江浙地区菱品种遗传多样性的SLAF-seq分析: 2; 作者袁晔刘睿王凌云沈盟叶雪莲权新华王瑞森姚祥坦; 机构嘉兴市农业科学研究院浙江大学蔬菜研究所金华市农业科学研究院(浙江省农业机械研究院)浙江省特色水生蔬菜育种与栽培重点实验室; 出处《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2023年第8期1773-1781,共9页; 基金浙江省农业(蔬菜)新品种选育重大科技专项(2016C02051-8-1) 嘉兴市科技计划项目(2021AZ10013)。; 文摘利用SLAF-seq技术对江浙地区17个主要的栽培菱品种和1个野生菱种质进行高通量测序,获得445594个SLAF标签,鉴定到多态性SLAF标签95931个。通过序列分析,获得269338个SNP标记,并基于这些SNP构建18份菱样品的遗传发育树及进行群体结构分析。结果表明,SLAF-seq技术能高效地开发出大量可用于群体遗传分析的SNP标记,基于SNP标记构建的进化树能较好地区分不同类型的菱品种。该结果对开展菱种质资源鉴定和菱种质遗传演化研究具有重要参考价值。; 关键词菱遗传多样性特异性位点扩增片段测序单核苷酸多态性; Keywords Trapa L. genetic diversity specific-locus amplified fragment sequencing single nucleotide polymorphism; 分类号 S645.4 [农业科学—蔬菜学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名贵阳花溪古茶树遗传进化的SNP分析被引量：19: 3; 作者陈立杰张素勤尹杰宋勤飞牛素贞赵基英陈丹萍王胜威耿广东; 机构贵州大学资产经营办公室贵州大学农学院贵州大学茶学院贵阳市花溪区农业局; 出处《西南大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期33-40,共8页; 基金中央财政农业生产发展基金(黔财农[2015]240号) 贵州省农业攻关项目(黔科合支撑[2016]2603号,黔科合支撑[2018]2330号); 文摘试验采用SNP(单核苷酸多态性)技术对贵阳花溪古茶树资源的遗传多样性、群体结构和遗传进化进行了分析.结果表明,利用生物信息学分析古茶树样品的重测序数据,获得了1656258个SLAF标签,古茶树样品平均测序深度为24.21x,其中多态性的SLAF标签有462897个,共得到283376个高一致性的群体SNP标记.从基于SNP标记获得的进化树可以看出,来自相近地方的古茶树在进化树上基本上处于相近位置,但是花溪古茶树存在着广泛的遗传变异,主成分分析(PCA)获得了与进化树一致的结果.群体结构分析可清晰地把古茶树资源分为乔木型和灌木型2个类群.乔木型古茶树位于进化树下部,而灌木型古茶树处于进化树上部,表明茶树是由乔木型向灌木型进化的.; 关键词古茶树特异位点扩增片段测序(slaf-seq) SNP 进化树 PCA 遗传结构; Keywords ancient Camellia sinensis specific-locus amplified fragment sequencing(slaf-seq) SNP(single nucleotide polymorphism) phylogenetic tree PCA genetic structure; 分类号 S571.1 [农业科学—茶叶生产加工]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名野生大豆抗胞囊线虫QTL定位被引量：7: 4; 作者袁翠平齐广勋李玉秋刘晓冬王英男王玉民赵洪锟董英山; 机构吉林省农业科学院; 出处《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期887-893,共7页; 基金吉林省科技发展计划国际科技合作项目(20170414009GH) 吉林省农业科学结余经费(统筹部分)项目(y81990401); 文摘大豆胞囊线虫病(soybean cyst nematode,SCN)是大豆生产上的重要病害,野生大豆是拓宽大豆抗病育种遗传基础的重要种质资源。为发掘野生大豆优异基因资源,利用SLAF-seq技术,以杂交组合"绥农14×ZYD03685"的亲本、126个F2单株及其衍生的F2:3家系为试验材料,进行了SLAF标签的开发、遗传图谱的绘制和QTL分析。共获得7783个SLAF标签用于遗传图谱绘制,遗传图谱总长度为2664.2 cM,20个连锁群的平均长度为133.21 cM。两个SCN抗性QTL(qSCN-1和qSCN-2)分别位于Chromosome 18(Chr 18)的4.25~4.31 Mb和13.50~13.81 Mb,分别解释了22.96%和10.96%的抗性(胞囊指数)变异,QTL区段内分别包含了6个和14个基因。qSCN-2区段未见有前人关于SCN抗性QTL的报道,为新的QTL。本研究为SCN抗性机制解析和利用ZYD03685进行SCN抗病分子育种提供了参考。; 关键词野生大豆大豆胞囊线虫 QTL slaf-seq(特异位点扩增片段测序); Keywords wild soybean soybean cyst nematode QTL slaf-seq; 分类号 S326 [农业科学—作物遗传育种]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	AMSS-PCR在肺癌突变基因检测中的价值研究	金柯谢绚潘越江王科喜陈柏深吴多光沈卓坚王铭辉张惠忠	《中国肺癌杂志》 CAS CSCD 北大核心	2018	1	在线阅读下载PDF 职称材料
2	江浙地区菱品种遗传多样性的SLAF-seq分析	袁晔刘睿王凌云沈盟叶雪莲权新华王瑞森姚祥坦	《浙江农业学报》 CSCD 北大核心	2023	0	在线阅读下载PDF 职称材料
3	贵阳花溪古茶树遗传进化的SNP分析	陈立杰张素勤尹杰宋勤飞牛素贞赵基英陈丹萍王胜威耿广东	《西南大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心	2019	19	在线阅读下载PDF 职称材料
4	野生大豆抗胞囊线虫QTL定位	袁翠平齐广勋李玉秋刘晓冬王英男王玉民赵洪锟董英山	《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心	2019	7	在线阅读下载PDF 职称材料