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利用物种特异性PCR技术快速鉴定南瓜实蝇 被引量:2
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作者 黄振 侯有明 +1 位作者 郭琼霞 陈韶萍 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期215-220,共6页
【目的】快速鉴定我国进境植物检疫性害虫南瓜实蝇Bactrocera tau(Walker),防止该虫传入扩散。【方法】基于物种特异性PCR(SS-PCR)技术,选取20种形态近似的常见实蝇,将南瓜实蝇作为阳性对照,提取基因组DNA模板,选用mt DNA COⅠ序列,检... 【目的】快速鉴定我国进境植物检疫性害虫南瓜实蝇Bactrocera tau(Walker),防止该虫传入扩散。【方法】基于物种特异性PCR(SS-PCR)技术,选取20种形态近似的常见实蝇,将南瓜实蝇作为阳性对照,提取基因组DNA模板,选用mt DNA COⅠ序列,检查同源系列,设计筛选1对可快速准确鉴定南瓜实蝇的种特异性引物NF404和NR610,并进行PCR检测和验证,建立一种利用种特异性引物的快速鉴定方法。【结果】南瓜实蝇在207 bp的位置扩增出一条清晰且单一的目标条带,其余果实蝇未见条带。将截获的南瓜实蝇与其同亚属的近缘种具条实蝇、瓜实蝇的不同虫态和成虫部分虫体组织的虫样,采用本实验室建立的SS-PCR鉴定方法进行验证,结果一致。【结论】建立的南瓜实蝇的SS-PCR鉴定方法种特异性和稳定性强,能快速鉴定目标种类,解决口岸进境果蔬中截获实蝇幼虫、蛹等不同虫态和残体难于快速鉴定问题。 展开更多
关键词 南瓜实蝇 mt DNA COI 异性引物 物种异性pcr(ss-pcr) 快速鉴定
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芝麻物种特异性定性PCR方法的建立 被引量:3
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作者 王庆平 王成 +5 位作者 兰青阔 陈锐 赵新 沈晓玲 王永 檀建新 《天津农业科学》 CAS 2017年第5期9-13,共5页
为鉴别食品中芝麻成分的真实性,建立了一套芝麻物种特异性定性PCR方法。根据Sesamum indicum 2S albumin-like序列,设计了3对芝麻物种特异性定性PCR引物,并对引物的特异性、最适反应浓度和最适退火温度进行了筛选和优化,建立了芝麻物种... 为鉴别食品中芝麻成分的真实性,建立了一套芝麻物种特异性定性PCR方法。根据Sesamum indicum 2S albumin-like序列,设计了3对芝麻物种特异性定性PCR引物,并对引物的特异性、最适反应浓度和最适退火温度进行了筛选和优化,建立了芝麻物种特异性定性PCR检测方法。进一步对方法的灵敏度、检出限和对芝麻加工品的适用性进行了测试。结果显示,引物sesame-1F/1R的特异性最好,最优反应条件为引物浓度0.4μmol·L^(-1),退火温度60℃;该方法能够检测出芝麻质量分数为0.1%的样品,且对于芝麻油、芝麻酱2种性状的加工样品均有很好的扩增。该方法能够鉴别食品中芝麻成分,为食品质量安全监管提供了有力的技术支撑。 展开更多
关键词 芝麻 物种异性序列 定性pcr检验
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基于物种特异性PCR对海鳗鱼糜掺假检测技术的研究 被引量:3
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作者 潘海云 赵文秀 +2 位作者 汪之和 施文正 赵勇 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2012年第13期325-326,387,共3页
为了对海鳗鱼糜掺假进行定性研究,从GenBank数据库下载海鳗及其他物种的线粒体12S rRNA,并通过BioEdit 7.0软件对该基因碱基序列进行比对。在此基础上,综合考虑引物设计原则,设计出关于海鳗的特异性引物。对引物的特异性、灵敏性以及主... 为了对海鳗鱼糜掺假进行定性研究,从GenBank数据库下载海鳗及其他物种的线粒体12S rRNA,并通过BioEdit 7.0软件对该基因碱基序列进行比对。在此基础上,综合考虑引物设计原则,设计出关于海鳗的特异性引物。对引物的特异性、灵敏性以及主要加工过程进行实验,结果表明所设计的引物对海鳗DNA具有很强的特异性,灵敏性达到0.1%,加工过程也不影响检测过程,从而满足了对于海鳗鱼糜掺假的检测要求。 展开更多
关键词 海鳗 pcr 物种异性
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鳕鱼物种特异性鉴定的PCR方法研究 被引量:7
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作者 尹伟力 方绍庆 +2 位作者 耿金培 许红岩 栾晶 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2011年第2期19-24,共6页
为了建立可对鳕鱼DNA进行特异性检测的PCR方法,应用在出口贸易中的鳕鱼疑似样品和保护执法工作中难以检查辨认的鳕鱼产品的物种鉴定,从GenBank数据库下载7个鳕属及其他5种鱼类的mtDNA细胞氧化酶Ⅱ(COXⅡ)基因序列,并用DNA Star7.0软件... 为了建立可对鳕鱼DNA进行特异性检测的PCR方法,应用在出口贸易中的鳕鱼疑似样品和保护执法工作中难以检查辨认的鳕鱼产品的物种鉴定,从GenBank数据库下载7个鳕属及其他5种鱼类的mtDNA细胞氧化酶Ⅱ(COXⅡ)基因序列,并用DNA Star7.0软件对上述不同鳕鱼的该基因碱基序列进行比较。在此基础上,综合考虑了设计引物的基本原则,选择了鳕鱼与其他鱼类碱基序列上差异位点较多的两个片段,设计出PCR引物。用该引物分别对从7种鳕鱼和5种非鳕鱼的肌肉、脏器组织中提取的DNA进行PCR扩增。结果表明,所设计的引物对鳕鱼DNA具有特异性,从而达到了对该物种进行特异性检测鉴定的目的。 展开更多
关键词 鳕鱼 pcr 物种异性鉴定
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基于物种特异性PCR技术检测鼻疽诺卡菌和巴西诺卡菌的初步研究
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作者 李芳 隗明 +7 位作者 徐帅 岳苑 邱小彤 韩李超 陈胜林 刘雪萍 任明辉 李振军 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第12期1045-1050,共6页
目的建立一种可以鉴别鼻疽诺卡菌和巴西诺卡菌的双重物种特异性PCR(species-specific Polymerase Chain Reaction,SS-PCR)诊断方法。方法基于鼻疽诺卡菌和巴西诺卡菌物种特异基因NFA_41530和O3I_RS18895分别设计特异性引物,通过优化反... 目的建立一种可以鉴别鼻疽诺卡菌和巴西诺卡菌的双重物种特异性PCR(species-specific Polymerase Chain Reaction,SS-PCR)诊断方法。方法基于鼻疽诺卡菌和巴西诺卡菌物种特异基因NFA_41530和O3I_RS18895分别设计特异性引物,通过优化反应条件和体系,建立快速准确的双重SS-PCR。对95株鼻疽诺卡菌、13株巴西诺卡菌和42株非目标菌株进行扩增,分析该方法的特异性和灵敏度,并通过模拟痰样本验证方法的准确性,预估其在临床诊断的价值。结果鼻疽诺卡菌和巴西诺卡菌质检分别扩增出一条清晰且单一的目标条带,其余42株非目标菌株均未扩增,表明该方法具有很好的特异性。该方法对鼻疽诺卡菌、巴西诺卡菌的检测下限分别为1.3×10^(4)copies/μL、2.4×10^(4)copies/μL,灵敏度较高。使用20个健康人的痰液模拟痰样本,检测符合率为100%。结论基于NFA_41530和O3I_RS18895基因建立的双重SS-PCR方法特异性强、灵敏度较高,是一种可以同时鉴定鼻疽诺卡菌和巴西诺卡菌的简便、快速、可靠、经济的方法。 展开更多
关键词 鼻疽诺卡菌 巴西诺卡菌 物种异性pcr 细菌鉴定
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一种检测近缘物种混合样品的新方法 被引量:1
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作者 贾秀双 王静 梁兴国 《中国海洋大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期46-52,共7页
结合双重PCR(Duplex PCR,dPCR)和扩增产物熔点的测定,建立了一种定量分析近缘物种混合样品中各物种相对含量的新方法。即针对混合样品中2种物种的DNA序列,各自设计高特异性引物,使2种物种的DNA同时进行PCR扩增而互不干扰,且扩增产物的... 结合双重PCR(Duplex PCR,dPCR)和扩增产物熔点的测定,建立了一种定量分析近缘物种混合样品中各物种相对含量的新方法。即针对混合样品中2种物种的DNA序列,各自设计高特异性引物,使2种物种的DNA同时进行PCR扩增而互不干扰,且扩增产物的熔点有足够的差别(>1℃);然后进行PCR扩增并测得不同温度下PCR产物同荧光染料结合后的荧光值;该荧光值对温度进行微分所得微分曲线上会产生2个峰(在两物种各自PCR产物熔点温度处),根据这2个峰的峰高比值同其相对含量的关系,即可完成对各物种含量的定量分析。本研究以长鳍和黄鳍金枪鱼的混合样品为例,对此方法的可行性进行了验证。结果表明,2种成分的含量比与对应峰值比之间线性关系良好;当混合样品中含有10%以上长鳍金枪鱼或5%以上黄鳍金枪鱼时,能够进行较准确的定量检测,证明了本方法切实可行。这一新方法解决了在混合样品中难以准确定量物种的难题,在食品安全和基因诊断领域有广泛的应用前景。 展开更多
关键词 双重异性pcr 熔点 混合样品 定量分析 物种鉴定
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水鹿的分子鉴定 被引量:4
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作者 查代明 邢秀梅 杨福合 《特产研究》 2010年第1期4-6,14,共4页
本试验根据线粒体D-loop区序列,设计了针对水鹿的特异性扩增引物,通过聚合酶链反应得到296bp的特异性片段,而猪、牛、羊、鸡等常见动物和其他鹿科动物均无此条带,并通过DNA测序法对扩增结果进行了验证。结果证明,该方法可靠、特异、通... 本试验根据线粒体D-loop区序列,设计了针对水鹿的特异性扩增引物,通过聚合酶链反应得到296bp的特异性片段,而猪、牛、羊、鸡等常见动物和其他鹿科动物均无此条带,并通过DNA测序法对扩增结果进行了验证。结果证明,该方法可靠、特异、通用、简单,可作为水鹿的一种有效的鉴定方法,在水鹿的保护工作中具有一定的作用。 展开更多
关键词 分子鉴定 水鹿 物种异性pcr 线粒体DNA D—loop区
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马铃薯成分微滴数字聚合酶链式反应定量检测方法建立 被引量:3
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作者 刘二龙 魏霜 +1 位作者 关丽军 李志勇 《粮食与油脂》 北大核心 2021年第3期120-123,共4页
基于微滴式数字聚合酶链式反应(droplet digital polymerase chain reaction,ddPCR)技术建立了定量分析马铃薯成分的检测方法。选取马铃薯的单拷贝光诱导组织特异性ST-LS1(light-inducible tissue-specific)基因作为目标基因,建立了马铃... 基于微滴式数字聚合酶链式反应(droplet digital polymerase chain reaction,ddPCR)技术建立了定量分析马铃薯成分的检测方法。选取马铃薯的单拷贝光诱导组织特异性ST-LS1(light-inducible tissue-specific)基因作为目标基因,建立了马铃薯ST-LS1基因拷贝数浓度与马铃薯样品质量之间的线性关系;然后采用模拟样品验证该方法的准确性和适用性。结果表明:所设计的STLS1基因引物及探针具有良好的特异性,可对质量分数为5%及以上的马铃薯成分进行准确定量。此方法适用于市场监管中掺假鉴别及定量检测。 展开更多
关键词 马铃薯 微滴数字pcr 异性 物种鉴定 定量
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