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线粒体假基因用作分子化石推算两个榕小蜂姐妹种的分化时间(英文)
1
作者
娄文静
滕文佳
+4 位作者
刘海洋
李子
肖金花
魏重远
黄大卫
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第5期548-553,共6页
线粒体假基因(nuclear mitochondrial pseudogenes,NUMTs)是指由生物体的线粒体基因组转移至核基因组内的DNA片段。由于其独立进化的特点,NUMTs在用于系统发育分析时是一把双刃剑。我们用基于PCR扩增的方法研究了对叶榕Ficus hispida上...
线粒体假基因(nuclear mitochondrial pseudogenes,NUMTs)是指由生物体的线粒体基因组转移至核基因组内的DNA片段。由于其独立进化的特点,NUMTs在用于系统发育分析时是一把双刃剑。我们用基于PCR扩增的方法研究了对叶榕Ficus hispida上两姐妹种榕小蜂Philotrypesis pilosa和Philotrypesis sp.中起源于线粒体Nad1-12S片段的NUMTs。该两姐妹种榕小蜂由同域物种形成过程产生,它们生活在同一生态环境里(即同一榕果内),因此可以用作很好的模型来研究在相同生态环境里物种的行为学及遗传学细微差异的进化。这些深入研究都依赖于对两个物种分化时间的正确估算。通过对所获取的NUMTs进行进化分析,我们发现:1)这些NUMTs都是最近引入核基因组事件;2)NUMTs引入事件发生在物种分化之前。由于这些NUMTs引入核内时间尚短,其碱基替换速率与线粒体基因相似,而节肢动物线粒体基因的平均碱基替换速率约为2.3×10-8替换/位点·年。根据这些进化历史特征可帮助我们将这两个姐妹种榕小蜂的分化时间追溯至0.40-0.48百万年以前。结果提示,一些线粒体假基因可以很好的用作分子化石来推断一些重要进化事件如物种形成。
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关键词
榕小蜂
线粒体DNA
线粒体假基因
净化选择
物种分化时间
分子化石
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题名
线粒体假基因用作分子化石推算两个榕小蜂姐妹种的分化时间(英文)
1
作者
娄文静
滕文佳
刘海洋
李子
肖金花
魏重远
黄大卫
机构
河北大学生命科学学院
中国科学院动物研究所
出处
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第5期548-553,共6页
基金
国家自然科学基金项目(31210103912)
中国科学院重大创新项目(KSCX2-EW-Z-2)
文摘
线粒体假基因(nuclear mitochondrial pseudogenes,NUMTs)是指由生物体的线粒体基因组转移至核基因组内的DNA片段。由于其独立进化的特点,NUMTs在用于系统发育分析时是一把双刃剑。我们用基于PCR扩增的方法研究了对叶榕Ficus hispida上两姐妹种榕小蜂Philotrypesis pilosa和Philotrypesis sp.中起源于线粒体Nad1-12S片段的NUMTs。该两姐妹种榕小蜂由同域物种形成过程产生,它们生活在同一生态环境里(即同一榕果内),因此可以用作很好的模型来研究在相同生态环境里物种的行为学及遗传学细微差异的进化。这些深入研究都依赖于对两个物种分化时间的正确估算。通过对所获取的NUMTs进行进化分析,我们发现:1)这些NUMTs都是最近引入核基因组事件;2)NUMTs引入事件发生在物种分化之前。由于这些NUMTs引入核内时间尚短,其碱基替换速率与线粒体基因相似,而节肢动物线粒体基因的平均碱基替换速率约为2.3×10-8替换/位点·年。根据这些进化历史特征可帮助我们将这两个姐妹种榕小蜂的分化时间追溯至0.40-0.48百万年以前。结果提示,一些线粒体假基因可以很好的用作分子化石来推断一些重要进化事件如物种形成。
关键词
榕小蜂
线粒体DNA
线粒体假基因
净化选择
物种分化时间
分子化石
Keywords
Fig wasp
nuclear mitochondrial pseudogene （NUMT）
purifying selection
mitochondrial DNA
speciation timing
＇ fossil＇ marker
分类号
Q969 [生物学—昆虫学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
线粒体假基因用作分子化石推算两个榕小蜂姐妹种的分化时间(英文)
娄文静
滕文佳
刘海洋
李子
肖金花
魏重远
黄大卫
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
0
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