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牛环曲病毒云南株纤突蛋白基因分子特征及进化分析
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作者 耿娟 曲伟杰 +10 位作者 张晓梅 魏志杰 钟德凯 王鑫文 李文贵 张双玲 李金存 张振兴 张以芳 郑锦玲 宋建领 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第11期4943-4955,共13页
【目的】了解牛环曲病毒(Bovine torovirus,BToV)在云南部分地区牛群中的流行及其S基因遗传进化情况。【方法】采集云南省内13个地区15个牛场不同年龄牛的粪便样品655份,利用RT-PCR方法检测BToV,并对其中6株BToV阳性样品进行S基因扩增... 【目的】了解牛环曲病毒(Bovine torovirus,BToV)在云南部分地区牛群中的流行及其S基因遗传进化情况。【方法】采集云南省内13个地区15个牛场不同年龄牛的粪便样品655份,利用RT-PCR方法检测BToV,并对其中6株BToV阳性样品进行S基因扩增、克隆、测序及遗传进化分析。【结果】RT-PCR检测结果显示,655份牛粪便样品检出71份BToV阳性,总阳性率为10.8%;其中腹泻样品阳性率为21.2%(59/278),非腹泻样品阳性率为3.2%(12/377);1周龄、1周龄~1月龄、1~6月龄和1岁及上样品的阳性率分别为15.0%(3/20)、17.7%(20/113)、14.0%(45/321)和1.5%(3/201)。相似性分析结果显示,6条BToV S基因序列相似性为96.0%~99.8%,且与原始毒株Breda1的相似性为94.7%~96.0%,与国内流行毒株的相似性为95.2%~99.7%。遗传进化分析结果显示,6条S基因均与原始毒株Breda1不在同一大分支,与国内四川、河南毒株及土耳其毒株形成一个大分支,表明云南省BToV毒株与目前国内流行毒株一致,亲缘关系近。氨基酸突变位点分析结果显示,S基因存在少量独特的氨基酸突变位点。重组分析结果显示,BTOV-China/YN03-2021、BTOV-China/YN01-2021和BTOV-China/YN06-2022为重组序列,其中重组序列BTOV-China/YN06-2022得分最高,重组区域为1438~1609 bp区间,主要亲本为BTOV-China/YN05-2021;重组序列BTOV-China/YN03-2021,重组区域位于1668~3569 bp区域,主要亲本为土耳其毒株BToV-HT2-TUR(MG957146.1);重组序列BTOV-China/YN01-2021,重组区域位于261~2552 bp,主要亲本为土耳其毒株BToV-HT2-TUR(MG957146.1)。基因选择压力分析结果显示,BToV S基因的进化方式主要以中性选择为主,但同时也存在净化选择和正向选择的压力影响。【结论】本研究揭示了BToV已存在于云南省部分地区牛群体中且防控形势较严峻,可为中国研究BToV流行病学和BToV S基因遗传进化关系提供参考,同时也为云南地区制定BToV感染的防控措施提供理论依据。 展开更多
关键词 牛环病毒(btov) S基因 分子特征 进化分析
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牛环曲病毒河南分离株的遗传进化分析 被引量:10
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作者 师志海 徐照学 +1 位作者 兰亚莉 王文佳 《动物医学进展》 北大核心 2019年第10期28-31,共4页
2018年在河南地区规模化牛场进行犊牛腹泻流行病学调查时,在粪便样品中检测到4株牛环曲病毒,分别命名BToV/CH/HN-1、BToV/CH/HN-2、BToV/CH/HN-3和BToV/CH/HN-4。对4个毒株的M基因进行克隆、测序与分析,结果表明,4个BToV毒株之间的基因... 2018年在河南地区规模化牛场进行犊牛腹泻流行病学调查时,在粪便样品中检测到4株牛环曲病毒,分别命名BToV/CH/HN-1、BToV/CH/HN-2、BToV/CH/HN-3和BToV/CH/HN-4。对4个毒株的M基因进行克隆、测序与分析,结果表明,4个BToV毒株之间的基因核酸序列同源性为97.4%~100%,与欧洲BToV代表株同源性最高(95.6%~99.5%)。遗传进化分析表明,4个毒株均属于欧洲谱系的牛源进化分支。提示我国牛群中存在环曲病毒感染,丰富了牛环曲病毒的流行病学资料,可为制定综合防控措施提供参考依据。 展开更多
关键词 牛环病毒 序列分析 遗传进化分析
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牛环曲病毒TaqMan荧光定量RT-PCR方法的建立与应用 被引量:6
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作者 李昊 赵龙 +1 位作者 汤承 岳华 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第12期1298-1303,共6页
牛环曲病毒(BToV)是国内新发现的致牛腹泻的病原。为建立检测BToV的TaqMan荧光定量RT-PCR方法,本研究根据GenBank中BToV的膜蛋白(M基因编码)基因序列设计引物和TaqMan探针,通过反应条件和体系优化,建立了检测BToV的TaqMan荧光定量RT-PC... 牛环曲病毒(BToV)是国内新发现的致牛腹泻的病原。为建立检测BToV的TaqMan荧光定量RT-PCR方法,本研究根据GenBank中BToV的膜蛋白(M基因编码)基因序列设计引物和TaqMan探针,通过反应条件和体系优化,建立了检测BToV的TaqMan荧光定量RT-PCR方法。结果显示:该方法在2.34×10^(1)拷贝/μL~2.34×10^(8)·拷贝/μL与Ct值呈良好的线性关系,相关系数R^(2)值为0.9998,扩增效率为98.04%;该方法仅能检测出BToV核酸,而不能检出其他牛常见相关病原核酸;对BToV重组质粒标准品的最低检测限为23.4拷贝/μL;批内变异系数CV为0.25%~1.34%,批间变异系数CV为1.35%~3.41%;该方法对39份临床腹泻犊牛粪便样品的检出率(71.8%)明显高于文献报道的SYBR Green荧光定量RT-PCR(61.5%)和套式RT-PCR(59.0%)。且3种方法之间的阳性符合率均为100%。对2019年11月~2020年12月采自河南、云南和四川的144份肉牛、奶牛、牦牛腹泻粪便样品中BToV的检出率为18.75%(27/144),场阳性率为84.62%(11/13)。综上所述,本研究首次建立了基于BToVM基因的TaqMan荧光定量RT-PCR方法。所建方法的特异性强、灵敏度高、重复性和稳定性好,为国内BToV的检测和流行病学调查提供了更为精确的方法。 展开更多
关键词 牛环病毒 TaqMan荧光定量RT-PCR 犊牛腹泻 检测
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牛环曲病毒研究进展 被引量:3
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作者 赵龙 李昊 +1 位作者 汤承 岳华 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第10期2753-2761,共9页
牛环曲病毒(bovine torovirus,BToV)是套式病毒目(Nidovirales)托巴套氏病毒科(Tobaniviridae)环曲病毒属(Torovirus)的成员,是重要的牛腹泻病原。该病毒对呼吸道和消化道具有双重组织嗜性,也是一种可能的呼吸道致病因子。BToV已经在中... 牛环曲病毒(bovine torovirus,BToV)是套式病毒目(Nidovirales)托巴套氏病毒科(Tobaniviridae)环曲病毒属(Torovirus)的成员,是重要的牛腹泻病原。该病毒对呼吸道和消化道具有双重组织嗜性,也是一种可能的呼吸道致病因子。BToV已经在中国、美国、日本等17个国家检出,具有广泛的地域分布。该病毒在国内是新发病毒,本文就BToV的分子生物学特性、流行概况、所致疾病的临床症状与病理变化、检测方法等研究进展做一综述,以期为BToV的研究提供参考。 展开更多
关键词 牛环病毒 牛腹泻 病原学 流行病学 检测
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云南省部分地区牛环曲病毒检测及其HE基因多态性分析
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作者 双玲 李金存 +7 位作者 班福泽 曲伟杰 王鑫文 张振兴 宋建领 柴俊 郑锦玲 张小苗 《中国动物检疫》 CAS 2024年第12期25-33,共9页
为了解云南省牛环曲病毒(BToV)的流行特点及遗传进化情况,2021-2023年在红河、大理、曲靖、楚雄等9个市13个县(区)15个牛场采集了655份粪便样品进行BToV核酸检测,并对部分BToV阳性样品进行了HE基因序列分析。核酸检测结果显示:BToV总阳... 为了解云南省牛环曲病毒(BToV)的流行特点及遗传进化情况,2021-2023年在红河、大理、曲靖、楚雄等9个市13个县(区)15个牛场采集了655份粪便样品进行BToV核酸检测,并对部分BToV阳性样品进行了HE基因序列分析。核酸检测结果显示:BToV总阳性率为10.8%(71/655);扩增得到6条完整的BToV HE基因序列,分属于BToVⅡ型和BToVⅢ型,与40条参考序列的核苷酸同源性为69.1%~99.8%;基因重组分析结果显示:存在2个重组现象,其亲本均为BToVⅡ型毒株和青藏高原藏羚羊源毒株,重组区域位于凝集素结构域R;基因选择压力分析结果显示:BToVHE基因在宿主机体和生存环境中的进化趋势以中性选择为主。结果表明:云南省牛场存在BToV感染;流行毒株中存在重组毒株,其可能由国内奶牛BToV毒株重组而来,且出现跨物种重组现象,该重组事件可能对病毒与受体结合过程产生影响。 展开更多
关键词 牛环病毒 检测诊断 HE基因 多态性
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牛环曲病毒云南流行株N基因序列分析
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作者 吴绍伟 申爱华 +4 位作者 余世祥 陶灿松 李维超 高亮 张以芳 《畜禽业》 2024年第6期19-23,共5页
为深入了解云南省牛环曲病毒(bovine torovirus,BToV)的流行现状及遗传进化趋势,2021年3月—2023年6月采集云南省9市15个养牛场不同年龄段的655份牛粪便样品,进行BToV RT-PCR检测,并对其中具有代表性的6份样品进行N基因测序分析。结果显... 为深入了解云南省牛环曲病毒(bovine torovirus,BToV)的流行现状及遗传进化趋势,2021年3月—2023年6月采集云南省9市15个养牛场不同年龄段的655份牛粪便样品,进行BToV RT-PCR检测,并对其中具有代表性的6份样品进行N基因测序分析。结果显示:BToV阳性检出率为10.84%(71/655);扩增得到6条完整的N基因序列,其同源性在98.4%~100%,与国内外参考毒株相比发现,6个毒株N基因与我国四川、黑龙江毒株同源性高,亲缘关系较近,可能是由引种、调运或动物产品交易传播而来;发现2个毒株发生氨基酸突变,可能是由于云南独特的气候和不同的饲养条件造成的。结果表明:牛环曲病毒在云南存在范围较广,须密切注意监测、加强检疫,同时加快疫苗研发。 展开更多
关键词 牛环病毒 流行病学调查 遗传进化趋势 N基因
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