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中国人群乙型肝炎病毒基因型间重组的鉴定
被引量：
4
1
作者
潘登
周彬
+1 位作者
杨洁
侯金林
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第10期1436-1442,共7页
目的分析中国乙肝病毒(HBV)的基因型间重组情况,寻找新的重组体。方法下载GenBank中所有来自中国的人HBV全基因组序列,运用片段分型法分析筛选HBV疑似重组序列,并利用生物信息学软件Simplot鉴定重组事件及重组断点。结果1642条人全长HB...
目的分析中国乙肝病毒(HBV)的基因型间重组情况,寻找新的重组体。方法下载GenBank中所有来自中国的人HBV全基因组序列,运用片段分型法分析筛选HBV疑似重组序列,并利用生物信息学软件Simplot鉴定重组事件及重组断点。结果1642条人全长HBV序列中发现755条重组序列,共31种重组体。其中B/C重组体22种676条重组序列;C/D重组体5种75条重组序列;A/C重组体3种3条重组序列;C/I重组体1种1条重组序列。排除已有文献报道的重组类型,总共发现4种共4条重组序列。结论在GenBank所有的来自中国地区的HBV全基因组序列中发现31种重组体,其中4种重组体为首次发现,并且C基因型参与中国地区所有的基因型间重组。
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关键词
乙型肝炎病毒
基因型间重组
片段分型法
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职称材料
题名
中国人群乙型肝炎病毒基因型间重组的鉴定
被引量：
4
1
作者
潘登
周彬
杨洁
侯金林
机构
南方医科大学南方医院感染内科暨肝病中心
出处
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第10期1436-1442,共7页
基金
国家自然科学基金(30872245)~~
文摘
目的分析中国乙肝病毒(HBV)的基因型间重组情况,寻找新的重组体。方法下载GenBank中所有来自中国的人HBV全基因组序列,运用片段分型法分析筛选HBV疑似重组序列,并利用生物信息学软件Simplot鉴定重组事件及重组断点。结果1642条人全长HBV序列中发现755条重组序列,共31种重组体。其中B/C重组体22种676条重组序列;C/D重组体5种75条重组序列;A/C重组体3种3条重组序列;C/I重组体1种1条重组序列。排除已有文献报道的重组类型,总共发现4种共4条重组序列。结论在GenBank所有的来自中国地区的HBV全基因组序列中发现31种重组体,其中4种重组体为首次发现,并且C基因型参与中国地区所有的基因型间重组。
关键词
乙型肝炎病毒
基因型间重组
片段分型法
Keywords
hepatitis B virus
intergenotype recombination
fragment-typing
分类号
R512.62 [医药卫生—内科学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
中国人群乙型肝炎病毒基因型间重组的鉴定
潘登
周彬
杨洁
侯金林
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
4
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