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烟草HrBP的研究与应用
被引量：
1
1
作者
陈卓
于丹丹
+7 位作者
郭勤
刘家驹
王贞超
李向阳
毕亮
胡德禹
杨松
宋宝安
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第9期59-68,共10页
旨在进一步发掘HrBP在新农药创制和抗病品种选育等方面的价值,采用BLAST和Clustal X2软件对HrBP进行序列同源性分析,发现其序列较保守;采用PSIPRED Protein Structure Prediction在线服务器进行烟草HrBP二级结构预测,采用UCLDepartment ...
旨在进一步发掘HrBP在新农药创制和抗病品种选育等方面的价值,采用BLAST和Clustal X2软件对HrBP进行序列同源性分析,发现其序列较保守;采用PSIPRED Protein Structure Prediction在线服务器进行烟草HrBP二级结构预测,采用UCLDepartment of Computer Science进行HrBP跨膜结构预测,发现两种可能存在的跨膜方式;采用SWISS-MODEL、Phyre和CPH进行HrBP空间结构预测,发现以膜蛋白为模板进行模建的蛋白具有相似的空间结构;建立基于Real-time PCR的HrBP mRNA定量分析方法,其相关系数为0.999 6;通过ProtScale方法分析HrBP抗原指数,并获得序列特异性较高的多肽,采用9-氟甲氧羰基固相合成法制备多肽,并由此制备多克隆抗体,采用Indirect-ELISA和Western blotting测定其效价和特异性,表明多克隆抗体可特异识别烟草HrBP。采用DIBA和Western blotting试验研究多克隆抗体对常见植物的抗原识别特性,发现多克隆抗体对这些植物的HrBP均有一定识别能力。此外,采用Real-time PCR和Indirect-ELISA等方法进行烟草各组织部位HrBP的表达量的研究,发现HrBP在各组织部位存在差异表达。
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关键词
Harpin结合蛋白
生物信息学分析
基因克隆
表达
多克隆抗体制备
烟草组织差异表达
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职称材料
题名
烟草HrBP的研究与应用
被引量：
1
1
作者
陈卓
于丹丹
郭勤
刘家驹
王贞超
李向阳
毕亮
胡德禹
杨松
宋宝安
机构
贵州大学绿色农药与农业生物工程国家重点实验室培育基地
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第9期59-68,共10页
基金
国家重点基础研究发展计划项目("973"计划)(2010CB-126105)
贵州省教育厅自然科学研究项目重点项目[黔科教(2009)0132号]
+2 种基金
贵州省优秀科技教育人才省长专项资金项目[黔省专合字(2009)104号]
贵州省科技成果重点推广计划项目[黔科合成字(2010)5034]
贵州省科技厅农业攻关项目[黔科合NY字(2011)3052号]
文摘
旨在进一步发掘HrBP在新农药创制和抗病品种选育等方面的价值,采用BLAST和Clustal X2软件对HrBP进行序列同源性分析,发现其序列较保守;采用PSIPRED Protein Structure Prediction在线服务器进行烟草HrBP二级结构预测,采用UCLDepartment of Computer Science进行HrBP跨膜结构预测,发现两种可能存在的跨膜方式;采用SWISS-MODEL、Phyre和CPH进行HrBP空间结构预测,发现以膜蛋白为模板进行模建的蛋白具有相似的空间结构;建立基于Real-time PCR的HrBP mRNA定量分析方法,其相关系数为0.999 6;通过ProtScale方法分析HrBP抗原指数,并获得序列特异性较高的多肽,采用9-氟甲氧羰基固相合成法制备多肽,并由此制备多克隆抗体,采用Indirect-ELISA和Western blotting测定其效价和特异性,表明多克隆抗体可特异识别烟草HrBP。采用DIBA和Western blotting试验研究多克隆抗体对常见植物的抗原识别特性,发现多克隆抗体对这些植物的HrBP均有一定识别能力。此外,采用Real-time PCR和Indirect-ELISA等方法进行烟草各组织部位HrBP的表达量的研究,发现HrBP在各组织部位存在差异表达。
关键词
Harpin结合蛋白
生物信息学分析
基因克隆
表达
多克隆抗体制备
烟草组织差异表达
Keywords
Harpin binding protein （ HrBP ） Bioinfromatics analysis Gene cloning and expression Polyclonal antibody preparation Differentially expression in tobacco issues
分类号
S572 [农业科学—烟草工业]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
烟草HrBP的研究与应用
陈卓
于丹丹
郭勤
刘家驹
王贞超
李向阳
毕亮
胡德禹
杨松
宋宝安
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
1
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