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怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A基因克隆和功能分析
被引量：
1
1
作者
尹明华
曾淑琴
+3 位作者
曾荧
张彩霞
张慧博
张丽佳
《种子》
北大核心
2022年第3期45-51,共7页
通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选到怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A基因的核心片段,利用RT-PCR技术克隆怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A基因,并采用生物信息学方法、转基因瞬时表达和实时定量PCR进行序列分析、亚细胞定位和...
通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选到怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A基因的核心片段,利用RT-PCR技术克隆怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A基因,并采用生物信息学方法、转基因瞬时表达和实时定量PCR进行序列分析、亚细胞定位和器官表达分析。结果表明,怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A基因cDNA总长度为858 bp,G+C含量为49.53%;怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A由285个氨基酸组成,分子量31437.53 Da,等电点5.77,为亲水性蛋白;二级结构由α-螺旋(28.77%)、β-片层(16.14%)、无规则卷曲(55.09%)构成;三级结构为单体;预测怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A主要存在细胞核、线粒体、叶绿体和细胞质中;怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A在进化上与硬粒小麦、节节麦、乌拉尔图小麦、大麦、二穗短柄草的亲缘关系较近,尤其是与硬粒小麦未命名蛋白产物(VAH 15508.1)在进化上具有最高的亲缘关系。通过烟草叶片亚细胞定位分析表明,烟草病毒增殖蛋白2 A定位于细胞质和细胞核中。实时定量PCR结果显示,烟草病毒增殖蛋白2 A基因在怀玉山三叶青2个栽培种中的表达存在器官特异性,怀玉2号和怀玉1号均在叶中表达量最高。
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关键词
怀玉山三叶青
烟草病毒增殖蛋白2
A
基因克隆
亚细胞定位
表达分析
在线阅读
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职称材料
怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2A-like基因克隆及其功能分析
被引量：
1
2
作者
夏瑾华
李丹丹
+4 位作者
李然
刘贤泥
刘子捷
罗冰
欧丽佳
《江苏农业科学》
北大核心
2023年第2期36-43,共8页
通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选得到怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2A-like基因的核心片段,利用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)技术克隆怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2A-like基因,并对其进行序列分析、亚细胞定位和器官表达分析...
通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选得到怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2A-like基因的核心片段,利用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)技术克隆怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2A-like基因,并对其进行序列分析、亚细胞定位和器官表达分析。结果表明,怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2A-like基因cDNA总长度为828 bp,G+C含量为46.50%;怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2A-like由275个氨基酸组成,分子量为30728.97 u,等电点为5.39,为疏水性蛋白;二级结构由α-螺旋(28.36%)、β-片层(20.73%)、无规则卷曲(50.91%)构成;三级结构为单体跨膜蛋白;预测怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2A-like主要存在液泡膜中;怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2A-like与葡萄烟草病毒增殖蛋白2A(GenBank:XP_034708140.1、XP_002279170.2)的同源性最高,同源性达到86.79%。通过烟草叶片亚细胞定位分析表明,烟草病毒增殖蛋白2A-like定位于细胞质和细胞核中。实时定量PCR结果显示,烟草病毒增殖蛋白2A-like基因在怀玉山三叶青2个栽培种中的表达存在器官特异性,怀玉2号和怀玉1号均在叶中表达量最高。怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2A-like具有典型烟草病毒增殖蛋白2A的结构特征,氨基酸序列及核酸序列与同源物种相似度较高,进化上较为保守,且可降低植株的光合作用效率。
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关键词
怀玉山三叶青
烟草病毒增殖蛋白2
A-like
基因克隆
表达分析
亚细胞定位
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职称材料
题名
怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A基因克隆和功能分析
被引量：
1
1
作者
尹明华
曾淑琴
曾荧
张彩霞
张慧博
张丽佳
机构
上饶师范学院生命科学学院
上饶农业技术创新研究院
上饶市药食同源植物资源保护与利用重点实验室
上饶市三叶青保育与利用技术创新中心
出处
《种子》
北大核心
2022年第3期45-51,共7页
基金
国家自然科学基金(31960079)
江西省科技厅重点研发计划一般项目(20192 BBGL 70050
+4 种基金
20202 BBG 73010)
江西省教育厅科学技术研究项目(GJJ 201704)
上饶市科技局重点研发计划一般项目(2020 C 002)
上饶市科技局平台载体建设项目(2020 J 001)
上饶市科技局平台载体建设项目(2019 I 017)。
文摘
通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选到怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A基因的核心片段,利用RT-PCR技术克隆怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A基因,并采用生物信息学方法、转基因瞬时表达和实时定量PCR进行序列分析、亚细胞定位和器官表达分析。结果表明,怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A基因cDNA总长度为858 bp,G+C含量为49.53%;怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A由285个氨基酸组成,分子量31437.53 Da,等电点5.77,为亲水性蛋白;二级结构由α-螺旋(28.77%)、β-片层(16.14%)、无规则卷曲(55.09%)构成;三级结构为单体;预测怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A主要存在细胞核、线粒体、叶绿体和细胞质中;怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A在进化上与硬粒小麦、节节麦、乌拉尔图小麦、大麦、二穗短柄草的亲缘关系较近,尤其是与硬粒小麦未命名蛋白产物(VAH 15508.1)在进化上具有最高的亲缘关系。通过烟草叶片亚细胞定位分析表明,烟草病毒增殖蛋白2 A定位于细胞质和细胞核中。实时定量PCR结果显示,烟草病毒增殖蛋白2 A基因在怀玉山三叶青2个栽培种中的表达存在器官特异性,怀玉2号和怀玉1号均在叶中表达量最高。
关键词
怀玉山三叶青
烟草病毒增殖蛋白2
A
基因克隆
亚细胞定位
表达分析
Keywords
Tetrastigma hemsleyanum Diels et Gilg in Huaiyushan
tobamovirus multiplication protein
2
A
gene cloning
subcellular localization
expression analysis
分类号
S572 [农业科学—烟草工业]
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职称材料
题名
怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2A-like基因克隆及其功能分析
被引量：
1
2
作者
夏瑾华
李丹丹
李然
刘贤泥
刘子捷
罗冰
欧丽佳
机构
上饶师范学院生命科学学院
上饶农业技术创新研究院
上饶市药食同源植物资源保护与利用重点实验室
上饶市三叶青保育与利用技术创新中心
出处
《江苏农业科学》
北大核心
2023年第2期36-43,共8页
基金
国家自然科学基金(编号:31960079)
江西省科技厅重点研发计划一般项目(编号:20202BBG73010、20192BBGL70050)
+2 种基金
江西省教育厅科学技术研究项目(编号:GJJ201704)
上饶市科技局重点研发计划一般项目(编号:2020C002)
上饶市科技局平台载体建设项目(编号:2020J001、2019I017)。
文摘
通过怀玉山三叶青试管苗转录组数据库筛选得到怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2A-like基因的核心片段,利用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)技术克隆怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2A-like基因,并对其进行序列分析、亚细胞定位和器官表达分析。结果表明,怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2A-like基因cDNA总长度为828 bp,G+C含量为46.50%;怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2A-like由275个氨基酸组成,分子量为30728.97 u,等电点为5.39,为疏水性蛋白;二级结构由α-螺旋(28.36%)、β-片层(20.73%)、无规则卷曲(50.91%)构成;三级结构为单体跨膜蛋白;预测怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2A-like主要存在液泡膜中;怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2A-like与葡萄烟草病毒增殖蛋白2A(GenBank:XP_034708140.1、XP_002279170.2)的同源性最高,同源性达到86.79%。通过烟草叶片亚细胞定位分析表明,烟草病毒增殖蛋白2A-like定位于细胞质和细胞核中。实时定量PCR结果显示,烟草病毒增殖蛋白2A-like基因在怀玉山三叶青2个栽培种中的表达存在器官特异性,怀玉2号和怀玉1号均在叶中表达量最高。怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2A-like具有典型烟草病毒增殖蛋白2A的结构特征,氨基酸序列及核酸序列与同源物种相似度较高,进化上较为保守,且可降低植株的光合作用效率。
关键词
怀玉山三叶青
烟草病毒增殖蛋白2
A-like
基因克隆
表达分析
亚细胞定位
分类号
R284.2 [医药卫生—中药学]
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出处
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被引量
操作
1
怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2 A基因克隆和功能分析
尹明华
曾淑琴
曾荧
张彩霞
张慧博
张丽佳
《种子》
北大核心
2022
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
怀玉山三叶青烟草病毒增殖蛋白2A-like基因克隆及其功能分析
夏瑾华
李丹丹
李然
刘贤泥
刘子捷
罗冰
欧丽佳
《江苏农业科学》
北大核心
2023
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