【目的】鉴定津巴布韦烟草丛顶病病原复合体组成。【方法】采集津巴布韦烟草丛顶病样品,对其病原复合体进行分子鉴定。【结果】烟草丛顶病毒津巴布韦分离物(tobacco bushy top virus-Zimbabwe,TBTV-Zimbabwe)在基因组RNA核苷酸序列水平...【目的】鉴定津巴布韦烟草丛顶病病原复合体组成。【方法】采集津巴布韦烟草丛顶病样品,对其病原复合体进行分子鉴定。【结果】烟草丛顶病毒津巴布韦分离物(tobacco bushy top virus-Zimbabwe,TBTV-Zimbabwe)在基因组RNA核苷酸序列水平上与幽影病毒属(Umbravirus)其他成员的一致性为47.8%~94.6%,其中与埃塞俄比亚烟草丛顶病毒(Ethiopian tobacco bushy top virus,ETBTV)序列的一致性最高,为94.6%;与中国烟草丛顶病毒(tobacco bushy top virus,TBTV)序列的一致性仅为56.9%。分子系统进化分析表明:该病毒分离物与ETBTV同源性最高,为ETBTV的分离物,与TBTV为不同的病毒种。TBTV-Zimbabwe卫星RNA与ETBTV卫星RNA在基因组全长核苷酸序列水平上的一致性为93.9%,与GenBank数据库中除ETBTV卫星RNA之外的其他序列无同源性。研究还获得了津巴布韦烟草丛顶病病原复合体中马铃薯卷叶病毒(potato leafroll virus,PLRV)外壳蛋白基因部分核苷酸序列。【结论】津巴布韦烟草丛顶病病原复合体包含3种病毒组分,它们分别与埃塞俄比亚烟草丛顶病病原复合体的3种组分在病毒种的分类水平上一致。津巴布韦与中国烟草丛顶病病原物差异较大。展开更多
利用RT-PCR方法对烟草丛顶病毒(tobacco bushy top virus,TBTV)卫星RNA不同分离物进行扩增和克隆测序,同时运用DNAMAN,MEGA,ClustalX等生物软件对TBTV和其它幽影病毒的卫星RNA核苷酸序列进行同源性比较,构建了幽影病毒属成员卫星RNA的...利用RT-PCR方法对烟草丛顶病毒(tobacco bushy top virus,TBTV)卫星RNA不同分离物进行扩增和克隆测序,同时运用DNAMAN,MEGA,ClustalX等生物软件对TBTV和其它幽影病毒的卫星RNA核苷酸序列进行同源性比较,构建了幽影病毒属成员卫星RNA的系统进化树。E结果显示:TBTV不同分离物卫星RNA的核苷酸同源性为79.2%～99.0%。它们与幽影病毒属其它成员卫星RNA的核苷酸同源性为32.5%～44.1%。通过构建幽影病毒属成员卫星RNA的系统进化树可以看出:TBTV的卫星RNA与GRV的卫星RNA亲缘关系最近,与CMoMV的亲缘关系最远。展开更多
文摘【目的】鉴定津巴布韦烟草丛顶病病原复合体组成。【方法】采集津巴布韦烟草丛顶病样品,对其病原复合体进行分子鉴定。【结果】烟草丛顶病毒津巴布韦分离物(tobacco bushy top virus-Zimbabwe,TBTV-Zimbabwe)在基因组RNA核苷酸序列水平上与幽影病毒属(Umbravirus)其他成员的一致性为47.8%~94.6%,其中与埃塞俄比亚烟草丛顶病毒(Ethiopian tobacco bushy top virus,ETBTV)序列的一致性最高,为94.6%;与中国烟草丛顶病毒(tobacco bushy top virus,TBTV)序列的一致性仅为56.9%。分子系统进化分析表明:该病毒分离物与ETBTV同源性最高,为ETBTV的分离物,与TBTV为不同的病毒种。TBTV-Zimbabwe卫星RNA与ETBTV卫星RNA在基因组全长核苷酸序列水平上的一致性为93.9%,与GenBank数据库中除ETBTV卫星RNA之外的其他序列无同源性。研究还获得了津巴布韦烟草丛顶病病原复合体中马铃薯卷叶病毒(potato leafroll virus,PLRV)外壳蛋白基因部分核苷酸序列。【结论】津巴布韦烟草丛顶病病原复合体包含3种病毒组分,它们分别与埃塞俄比亚烟草丛顶病病原复合体的3种组分在病毒种的分类水平上一致。津巴布韦与中国烟草丛顶病病原物差异较大。
文摘利用RT-PCR方法对烟草丛顶病毒(tobacco bushy top virus,TBTV)卫星RNA不同分离物进行扩增和克隆测序,同时运用DNAMAN,MEGA,ClustalX等生物软件对TBTV和其它幽影病毒的卫星RNA核苷酸序列进行同源性比较,构建了幽影病毒属成员卫星RNA的系统进化树。E结果显示:TBTV不同分离物卫星RNA的核苷酸同源性为79.2%～99.0%。它们与幽影病毒属其它成员卫星RNA的核苷酸同源性为32.5%～44.1%。通过构建幽影病毒属成员卫星RNA的系统进化树可以看出:TBTV的卫星RNA与GRV的卫星RNA亲缘关系最近,与CMoMV的亲缘关系最远。
