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灰比诺葡萄病毒内蒙古分离物全基因组分析
1
作者
郭孟泽
徐磊
+3 位作者
闫雨婷
孙平平
张磊
李正男
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第12期2425-2435,共11页
【目的】获取灰比诺葡萄病毒(grapevine pinot gris virus,GPGV)内蒙古分离物全基因组序列,并对该病毒群体进行序列一致性、系统发育、基因重组以及群体遗传多样性等分析。【方法】以GPGV阳性样品为试验材料,通过RT-PCR技术和cDNA末端...
【目的】获取灰比诺葡萄病毒(grapevine pinot gris virus,GPGV)内蒙古分离物全基因组序列,并对该病毒群体进行序列一致性、系统发育、基因重组以及群体遗传多样性等分析。【方法】以GPGV阳性样品为试验材料,通过RT-PCR技术和cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNAends,RACE)克隆GPGV内蒙古分离物的全基因组序列,并通过分子生物学分析软件对其进行基因组序列分析。【结果】成果克隆了2条GPGV内蒙古分离物(20IM-Vi-Vi1和20IM-ViVi2)的全基因组序列,序列全长均为7250 nt,且均编码3个ORFs;序列一致性分析结果显示,20IM-Vi-Vi1与20IM-ViVi2基因组序列核苷酸一致率为96.4%,与其他分离物的全基因组序列一致率分别为79.7%~96.8%、79.5%~97.7%;系统进化分析表明,GPGV所有全基因组分离物可划为4个分支,其中本研究中所获得的2个分离物20IM-ViVi1与20IM-ViVi2均聚集在第Ⅰ分支,并均与中国夏黑分离物SRR2845691-GPGV亲缘关系最近;遗传多样性分析结果表明,GPGV具有较高的遗传多样性,其中GPGV亚洲分离物遗传多样性最高。【结论】首次获得GPGV内蒙古分离物的全基因组序列,并阐述了2个GPGV内蒙古分离物与已知病毒之间的进化关系,可为中国GPGV株系划分、遗传进化研究奠定理论基础。
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关键词
灰比诺葡萄病毒
系统进化分析
序列一致性
遗传多样性
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职称材料
GPGV与GRSPaV病毒对“阳光玫瑰”葡萄植株生长及叶片营养元素含量的影响
被引量:
1
2
作者
黄宇
张向昆
+5 位作者
乔月莲
安德志
梁晨
王莉
师校欣
杜国强
《中国南方果树》
北大核心
2025年第1期150-154,共5页
本研究以经热处理结合茎尖培养获得的仅携带灰比诺葡萄病毒(grapevine pinot gris virus,GPGV)、仅携带沙地葡萄茎痘病毒(grapevine rupestris stem pitting associated virus,GRSPaV)、携带GPGV+GRSPaV和不带病毒的“阳光玫瑰”葡萄苗...
本研究以经热处理结合茎尖培养获得的仅携带灰比诺葡萄病毒(grapevine pinot gris virus,GPGV)、仅携带沙地葡萄茎痘病毒(grapevine rupestris stem pitting associated virus,GRSPaV)、携带GPGV+GRSPaV和不带病毒的“阳光玫瑰”葡萄苗为试材,探讨不同病毒对“阳光玫瑰”葡萄植株生长和叶片营养元素含量的影响。结果表明,除新梢节数外,带病毒试材的其他生长指标均显著低于脱毒苗。仅携带GRSPaV与仅携带GPGV植株的株高、节间长度无显著差异,但GRSPaV+GPGV复合感染后其株高与节间长度显著降低。仅携带GRSPaV的茎粗显著小于仅携带GPGV的植株,GRSPaV和GPGV复合感染后茎粗更小。仅携带GPGV、仅携带GRSPaV和携带GRSPaV+GPGV植株的总根长、根平均直径、根体积、根鲜质量和根干质量均显著低于脱毒苗,3种带病毒植株间无显著差异。3种带病毒植株叶片的Ca、Mn含量均较无病毒植株显著降低,且仅携带GPGV植株不显症叶片的Ca、Mn含量显著高于仅携带GRSPaV不显症叶片。3种带病毒植株叶片K、Zn、B的含量均显著高于脱毒苗;仅携带GPGV植株不显症叶片K含量显著高于仅携带GRSPaV植株不显症叶片,两者的Zn和B含量无显著差异。带病毒植株显症叶片的Mg、Fe、Cu含量均显著高于脱毒苗,而不显症叶片显著低于脱毒苗;仅携带GPGV植株不显症叶片的Mg、Fe含量显著低于仅携带GRSPaV植株不显症叶片,两者B含量无显著差异。GPGV或GRSPaV通过影响营养元素含量抑制植株枝条和根系生长,且这两种病毒复合感染加剧影响作用。
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关键词
“阳光玫瑰”
葡萄
灰比诺葡萄病毒
沙地
葡萄
茎痘
病毒
生长
营养元素
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职称材料
我国葡萄扇叶衰退病相关病毒研究进展
被引量:
2
3
作者
范旭东
胡国君
+5 位作者
陈绍莉
任芳
杜乃凡
战良
张尊平
董雅凤
《中国果树》
北大核心
2023年第9期1-5,共5页
葡萄扇叶衰退病(grapevine fanleaf degeneration disease,GFDD)是葡萄栽培中常见的病毒病害,在我国葡萄产区发生普遍,危害严重。引起该病的病毒种类有10余种,症状表现受葡萄品种、病毒种类、栽培条件等多种因素影响。由于高通量测序技...
葡萄扇叶衰退病(grapevine fanleaf degeneration disease,GFDD)是葡萄栽培中常见的病毒病害,在我国葡萄产区发生普遍,危害严重。引起该病的病毒种类有10余种,症状表现受葡萄品种、病毒种类、栽培条件等多种因素影响。由于高通量测序技术的发展与应用,我国鉴定发现了除葡萄扇叶病毒(grapevine fanleaf virus,GFLV)之外的3种GFDD相关病毒,即葡萄浆果内坏死病毒(grapevine berry inner necrosis virus,GINV)、灰比诺葡萄病毒(grapevine Pinot gris virus,GPGV)和葡萄蚕豆萎蔫病毒(grapevine fabavirus,GFabV)。系统综述了我国GFDD的主要病原及其侵染状况,可为该病害的精准防控提供参考。
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关键词
葡萄
扇叶衰退病
葡萄
扇叶
病毒
葡萄
浆果内坏死
病毒
灰比诺葡萄病毒
葡萄
蚕豆萎蔫
病毒
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职称材料
题名
灰比诺葡萄病毒内蒙古分离物全基因组分析
1
作者
郭孟泽
徐磊
闫雨婷
孙平平
张磊
李正男
机构
内蒙古农业大学园艺与植物保护学院
出处
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第12期2425-2435,共11页
基金
内蒙古自治区科技计划项目(2022YFDZ0029)
内蒙古自治区自然科学基金项目(2022QN03018)
内蒙古自治区高等学校“青年科技英才支持项目”(NJYT23079)。
文摘
【目的】获取灰比诺葡萄病毒(grapevine pinot gris virus,GPGV)内蒙古分离物全基因组序列,并对该病毒群体进行序列一致性、系统发育、基因重组以及群体遗传多样性等分析。【方法】以GPGV阳性样品为试验材料,通过RT-PCR技术和cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNAends,RACE)克隆GPGV内蒙古分离物的全基因组序列,并通过分子生物学分析软件对其进行基因组序列分析。【结果】成果克隆了2条GPGV内蒙古分离物(20IM-Vi-Vi1和20IM-ViVi2)的全基因组序列,序列全长均为7250 nt,且均编码3个ORFs;序列一致性分析结果显示,20IM-Vi-Vi1与20IM-ViVi2基因组序列核苷酸一致率为96.4%,与其他分离物的全基因组序列一致率分别为79.7%~96.8%、79.5%~97.7%;系统进化分析表明,GPGV所有全基因组分离物可划为4个分支,其中本研究中所获得的2个分离物20IM-ViVi1与20IM-ViVi2均聚集在第Ⅰ分支,并均与中国夏黑分离物SRR2845691-GPGV亲缘关系最近;遗传多样性分析结果表明,GPGV具有较高的遗传多样性,其中GPGV亚洲分离物遗传多样性最高。【结论】首次获得GPGV内蒙古分离物的全基因组序列,并阐述了2个GPGV内蒙古分离物与已知病毒之间的进化关系,可为中国GPGV株系划分、遗传进化研究奠定理论基础。
关键词
灰比诺葡萄病毒
系统进化分析
序列一致性
遗传多样性
Keywords
Grapevine pinot gris virus
Phylogenetic analysis
Sequence identity
Genetic diversity
分类号
S663.1 [农业科学—果树学]
S436.631 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
GPGV与GRSPaV病毒对“阳光玫瑰”葡萄植株生长及叶片营养元素含量的影响
被引量:
1
2
作者
黄宇
张向昆
乔月莲
安德志
梁晨
王莉
师校欣
杜国强
机构
河北农业大学园艺学院
出处
《中国南方果树》
北大核心
2025年第1期150-154,共5页
基金
河北省现代农业产业技术体系葡萄创新团队(HBCT2023150201)
热杂果现代种业科技创新团队(葡萄-6)(21326310D)资助。
文摘
本研究以经热处理结合茎尖培养获得的仅携带灰比诺葡萄病毒(grapevine pinot gris virus,GPGV)、仅携带沙地葡萄茎痘病毒(grapevine rupestris stem pitting associated virus,GRSPaV)、携带GPGV+GRSPaV和不带病毒的“阳光玫瑰”葡萄苗为试材,探讨不同病毒对“阳光玫瑰”葡萄植株生长和叶片营养元素含量的影响。结果表明,除新梢节数外,带病毒试材的其他生长指标均显著低于脱毒苗。仅携带GRSPaV与仅携带GPGV植株的株高、节间长度无显著差异,但GRSPaV+GPGV复合感染后其株高与节间长度显著降低。仅携带GRSPaV的茎粗显著小于仅携带GPGV的植株,GRSPaV和GPGV复合感染后茎粗更小。仅携带GPGV、仅携带GRSPaV和携带GRSPaV+GPGV植株的总根长、根平均直径、根体积、根鲜质量和根干质量均显著低于脱毒苗,3种带病毒植株间无显著差异。3种带病毒植株叶片的Ca、Mn含量均较无病毒植株显著降低,且仅携带GPGV植株不显症叶片的Ca、Mn含量显著高于仅携带GRSPaV不显症叶片。3种带病毒植株叶片K、Zn、B的含量均显著高于脱毒苗;仅携带GPGV植株不显症叶片K含量显著高于仅携带GRSPaV植株不显症叶片,两者的Zn和B含量无显著差异。带病毒植株显症叶片的Mg、Fe、Cu含量均显著高于脱毒苗,而不显症叶片显著低于脱毒苗;仅携带GPGV植株不显症叶片的Mg、Fe含量显著低于仅携带GRSPaV植株不显症叶片,两者B含量无显著差异。GPGV或GRSPaV通过影响营养元素含量抑制植株枝条和根系生长,且这两种病毒复合感染加剧影响作用。
关键词
“阳光玫瑰”
葡萄
灰比诺葡萄病毒
沙地
葡萄
茎痘
病毒
生长
营养元素
Keywords
Shine Muscat grape
GPGV
GRSPaV
growth
nutrient element
分类号
S436.631.1 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
我国葡萄扇叶衰退病相关病毒研究进展
被引量:
2
3
作者
范旭东
胡国君
陈绍莉
任芳
杜乃凡
战良
张尊平
董雅凤
机构
中国农业科学院果树研究所
辽宁省绿色农业技术中心
山东青大种苗有限公司
出处
《中国果树》
北大核心
2023年第9期1-5,共5页
基金
财政部和农业农村部:国家现代农业(葡萄)产业技术体系(CARS-29-bc-1)
中国农业科学院科技创新工程
青岛市科技惠民示范专项(23-2-8-xdny-4-nsh)。
文摘
葡萄扇叶衰退病(grapevine fanleaf degeneration disease,GFDD)是葡萄栽培中常见的病毒病害,在我国葡萄产区发生普遍,危害严重。引起该病的病毒种类有10余种,症状表现受葡萄品种、病毒种类、栽培条件等多种因素影响。由于高通量测序技术的发展与应用,我国鉴定发现了除葡萄扇叶病毒(grapevine fanleaf virus,GFLV)之外的3种GFDD相关病毒,即葡萄浆果内坏死病毒(grapevine berry inner necrosis virus,GINV)、灰比诺葡萄病毒(grapevine Pinot gris virus,GPGV)和葡萄蚕豆萎蔫病毒(grapevine fabavirus,GFabV)。系统综述了我国GFDD的主要病原及其侵染状况,可为该病害的精准防控提供参考。
关键词
葡萄
扇叶衰退病
葡萄
扇叶
病毒
葡萄
浆果内坏死
病毒
灰比诺葡萄病毒
葡萄
蚕豆萎蔫
病毒
Keywords
grapevine fanleaf degeneration disease
grapevine fanleaf virus(GFLV)
grapevine berry inner necrosis virus(GINV)
grapevine Pinot gris virus(GPGV)
grapevine fabavirus(GFabV)
分类号
S436.631.19 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
灰比诺葡萄病毒内蒙古分离物全基因组分析
郭孟泽
徐磊
闫雨婷
孙平平
张磊
李正男
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
在线阅读
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职称材料
2
GPGV与GRSPaV病毒对“阳光玫瑰”葡萄植株生长及叶片营养元素含量的影响
黄宇
张向昆
乔月莲
安德志
梁晨
王莉
师校欣
杜国强
《中国南方果树》
北大核心
2025
1
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职称材料
3
我国葡萄扇叶衰退病相关病毒研究进展
范旭东
胡国君
陈绍莉
任芳
杜乃凡
战良
张尊平
董雅凤
《中国果树》
北大核心
2023
2
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职称材料
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