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云南特有火把梨UFGT基因片段的克隆与序列分析
被引量:
4
1
作者
孟富宣
周军
+5 位作者
王大玮
陶磅
董娇
徐世宏
段淋渊
Fu Haihui
《西南林业大学学报(自然科学)》
CAS
北大核心
2016年第1期21-27,43,共8页
为研究UFGT基因对红皮梨花色素苷合成的调控机制,以云南特有火把梨为试材,克隆得到UFGT的基因片段,运用生物信息学分析软件对该基因序列进行分析。结果表明:UFGT基因片段长1 440 bp,编码479个氨基酸的蛋白质;该氨基酸序列与沙梨、西洋...
为研究UFGT基因对红皮梨花色素苷合成的调控机制,以云南特有火把梨为试材,克隆得到UFGT的基因片段,运用生物信息学分析软件对该基因序列进行分析。结果表明:UFGT基因片段长1 440 bp,编码479个氨基酸的蛋白质;该氨基酸序列与沙梨、西洋梨、白梨、苹果和樱桃李的同源性分别为99%、96%、94%、91%和72%;蛋白无跨膜结构,不存在导肽和信号肽,属于非分泌蛋白,定位在胞液;结构功能域分析显示该片段含典型的GT1_Gtf_Like功能域和1个GTB型超家族蛋白的典型结构。
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关键词
火把梨
UFGT
基因克隆
生物信息学
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职称材料
火把梨谷胱甘肽S-转移酶基因的克隆与表达
被引量:
3
2
作者
刘迪秋
王光勇
+2 位作者
王继磊
葛锋
陈朝银
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第1期29-34,共6页
依据火把梨编码谷胱甘肽S-转移酶(GST)的EST序列设计基因特异引物,采用快速扩增cDNA末端技术,从云南火把梨中克隆到一个新的GST基因的全长cDNA序列。该基因被命名为PpGST(GenBank登录号为HQ889136)。PpGST全长cDNA为1 177bp,具有130bp 5...
依据火把梨编码谷胱甘肽S-转移酶(GST)的EST序列设计基因特异引物,采用快速扩增cDNA末端技术,从云南火把梨中克隆到一个新的GST基因的全长cDNA序列。该基因被命名为PpGST(GenBank登录号为HQ889136)。PpGST全长cDNA为1 177bp,具有130bp 5′-UTR、696bp ORF以及351bp 3′-UTR,编码含231个氨基酸的蛋白质。与已知植物GSTs家族成员间的氨基酸序列聚类分析将PpGST聚为zeta类GST。RT-PCR分析显示,PpGST在火把梨光照的果皮和没有光照的果皮中大量表达,并且表达强度不受光照时间的影响,而在幼嫩叶片中没有表达。研究结果暗示在果皮中大量表达的PpGST可能参与维持火把梨果实发育过程中的氧化还原平衡及应答逆境胁迫。
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关键词
火把梨
谷胱甘肽S-转移酶
快速扩增CDNA末端
RT-PCR
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职称材料
题名
云南特有火把梨UFGT基因片段的克隆与序列分析
被引量:
4
1
作者
孟富宣
周军
王大玮
陶磅
董娇
徐世宏
段淋渊
Fu Haihui
机构
云南省高校林木遗传改良与繁育重点实验室
云南省农业科学院热区生态农业研究所
西南山地森林资源保育与利用省部共建教育部重点实验室
西南林业大学林学院
云南省农业科学院园艺作物研究所
中华全国供销合作总社昆明食用菌研究所
出处
《西南林业大学学报(自然科学)》
CAS
北大核心
2016年第1期21-27,43,共8页
基金
云南省教育厅科学研究基金项目(2012J050)资助
西南林业大学科研启动基金资助
文摘
为研究UFGT基因对红皮梨花色素苷合成的调控机制,以云南特有火把梨为试材,克隆得到UFGT的基因片段,运用生物信息学分析软件对该基因序列进行分析。结果表明:UFGT基因片段长1 440 bp,编码479个氨基酸的蛋白质;该氨基酸序列与沙梨、西洋梨、白梨、苹果和樱桃李的同源性分别为99%、96%、94%、91%和72%;蛋白无跨膜结构,不存在导肽和信号肽,属于非分泌蛋白,定位在胞液;结构功能域分析显示该片段含典型的GT1_Gtf_Like功能域和1个GTB型超家族蛋白的典型结构。
关键词
火把梨
UFGT
基因克隆
生物信息学
Keywords
Pyrus pyrifolia cv. Huobali
UFGT
gene cloning
bioinformatics
分类号
S718.46 [农业科学—林学]
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职称材料
题名
火把梨谷胱甘肽S-转移酶基因的克隆与表达
被引量:
3
2
作者
刘迪秋
王光勇
王继磊
葛锋
陈朝银
机构
昆明理工大学生命科学与技术学院
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第1期29-34,共6页
基金
云南省应用基础研究面上项目(2008ZC036M)
文摘
依据火把梨编码谷胱甘肽S-转移酶(GST)的EST序列设计基因特异引物,采用快速扩增cDNA末端技术,从云南火把梨中克隆到一个新的GST基因的全长cDNA序列。该基因被命名为PpGST(GenBank登录号为HQ889136)。PpGST全长cDNA为1 177bp,具有130bp 5′-UTR、696bp ORF以及351bp 3′-UTR,编码含231个氨基酸的蛋白质。与已知植物GSTs家族成员间的氨基酸序列聚类分析将PpGST聚为zeta类GST。RT-PCR分析显示,PpGST在火把梨光照的果皮和没有光照的果皮中大量表达,并且表达强度不受光照时间的影响,而在幼嫩叶片中没有表达。研究结果暗示在果皮中大量表达的PpGST可能参与维持火把梨果实发育过程中的氧化还原平衡及应答逆境胁迫。
关键词
火把梨
谷胱甘肽S-转移酶
快速扩增CDNA末端
RT-PCR
Keywords
Pyrus pyrifolia Nakai cv. Huobali
glutathione S-transferase
rapid amplification of cDNAends
RT-PCR
分类号
Q786 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
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1
云南特有火把梨UFGT基因片段的克隆与序列分析
孟富宣
周军
王大玮
陶磅
董娇
徐世宏
段淋渊
Fu Haihui
《西南林业大学学报(自然科学)》
CAS
北大核心
2016
4
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
火把梨谷胱甘肽S-转移酶基因的克隆与表达
刘迪秋
王光勇
王继磊
葛锋
陈朝银
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
3
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