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猪Delta冠状病毒的流行病学调查及M基因序列分析
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作者 马玉飞 李本强 +3 位作者 陶洁 程靖华 刘雷 刘惠莉 《上海农业学报》 2020年第1期71-76,共6页
为了解猪Delta冠状病毒(Porcine Deltacoronavirus,PDCoV)在发生腹泻疫情猪群中的感染情况,根据PDCoV M基因的保守序列设计了一对RT-PCR检测引物,建立了猪Delta冠状病毒的RT-PCR的检测方法,其最低核酸检测限量为3.92×10^3 copies/... 为了解猪Delta冠状病毒(Porcine Deltacoronavirus,PDCoV)在发生腹泻疫情猪群中的感染情况,根据PDCoV M基因的保守序列设计了一对RT-PCR检测引物,建立了猪Delta冠状病毒的RT-PCR的检测方法,其最低核酸检测限量为3.92×10^3 copies/μL,特异性和灵敏度均较好。利用该方法对2015—2017年上海周边猪场的518份猪腹泻粪便样品进行检测,检测出25份PDCoV阳性样品,感染阳性率达4.8%。在所检出的阳性样本中,PDCoV与猪嵴病毒(porcine kobuvirus,PKV)和猪星状病毒(porcine astrovirus,PAstV)的混合感染率较高,分别为40%和48%;PDCoV与猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)混合感染率为8.0%,未检测到PDCoV与猪传染性胃肠炎病毒(transmissible gastroenteritis virus,TEGV)混合感染的样本。随机选取10份PDCoV阳性样本,对扩增的M基因片段同源性进行分析,结果,10份样品中核苷酸同源性达95.0%—99.6%,与GenBank登录的PDCoV毒株的同源性为96.1%—100%,说明目前流行的PDCoV毒株的遗传差异不大,该研究为了解PDCoV流行情况提供了参考依据。 展开更多
关键词 潴delta冠状病毒 基因 RT-PCR 进化分析
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猪Delta冠状病毒和猪流行性腹泻病毒双重RT-PCR诊断方法的建立 被引量:5
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作者 刘莹 贾敬亮 +5 位作者 刘涛 袁广富 陈少杰 王晶 范京惠 左玉柱 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2020年第2期30-32,35,共4页
猪流行性腹泻病毒(PEDV)和猪Delta冠状病毒(PDCoV)已经成为养猪行业的主要疫病。建立能够同时检测且能区分这2种病毒感染的诊断方法,对于临床实践具有重要意义。根据GenBank中登录的PEDV和PDCoV基因序列,分别用PDCoV M基因和PEDV M基因... 猪流行性腹泻病毒(PEDV)和猪Delta冠状病毒(PDCoV)已经成为养猪行业的主要疫病。建立能够同时检测且能区分这2种病毒感染的诊断方法,对于临床实践具有重要意义。根据GenBank中登录的PEDV和PDCoV基因序列,分别用PDCoV M基因和PEDV M基因设计了2对引物,并对PEDV的M基因片段和PDCoV的M基因片段进行扩增,通过对PCR反应条件的优化,建立了检测PDCoV和PEDV双重逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)检测方法。特异性和敏感度的试验表明,此方法对PDCoV和PEDV核酸的最低检测量分别为3.27×10~3拷贝/μL和3.63×10~4拷贝/μL,具有较高的敏感度;该方法可同时扩增出340 bp(PDCoV)和520 bp(PEDV),但不能扩增出猪传染性胃肠炎病毒、猪伪狂犬病病毒、猪博卡病毒和猪繁殖与呼吸综合征病毒。多重PCR与单一PCR符合率100%。表明此方法可以用于PDCoV和PEDV的检测。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻 delta病毒 双重RT-PCR方法
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猪Delta冠状病毒及其检测技术研究进展 被引量:4
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作者 高光健 《福建畜牧兽医》 2020年第4期30-34,共5页
猪Delta冠状病毒是近年来新发现的导致仔猪腹泻、呕吐和脱水的肠道致病性冠状病毒,仔猪感染后有较高的发病率和病死率。本文简要概述PDCoV病原学、流行病学及其检测方法研究现状,以期未来对PDCoV感染的流行病学调查和疫情防控提供参考。
关键词 delta病毒 病原学 检测
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猪流行性腹泻病毒和猪Delta冠状病毒二重RT-PCR检测方法的建立及应用 被引量:1
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作者 周博 《中国猪业》 2023年第2期75-78,82,共5页
为快速、便捷地检测猪流行性腹泻病毒(PEDV)和猪Delta冠状病毒(PDCoV)混合感染病原,试验根据Genbank收录的2种病毒的M基因序列,分别设计2对引物,通过对RT-PCR反应优化,最终建立了PEDV和PDCoV二重RT-PCR扩增检测方法,验证其特异性和敏感... 为快速、便捷地检测猪流行性腹泻病毒(PEDV)和猪Delta冠状病毒(PDCoV)混合感染病原,试验根据Genbank收录的2种病毒的M基因序列,分别设计2对引物,通过对RT-PCR反应优化,最终建立了PEDV和PDCoV二重RT-PCR扩增检测方法,验证其特异性和敏感性,将该方法应用于临床病料的检测。结果显示,利用建立的二重RT-PCR方法对PEDV和PDCoV进行扩增,分别获得750 bp和372 bp的特异性目的条带,最佳退火温度为56℃。扩增未见CSFV、PRV、PPV病毒基因片段,而能够同时扩增出PEDV和PDCoV目的基因片段。PEDV/PDCoV 2种病毒混合核酸最小检测量为0.1 ng。对临床疑似病料检测结果符合率为100%。表明建立的PEDV/PDCoV二重RT-PCR方法具有较好的特异性、灵敏性和临床适用性,为PEDV、PDCoV的快速、准确临床诊断和有效防控提供了检测技术手段。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 delta病毒 RT-PCR 建立 应用
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四重荧光qRT-PCR检测猪腹泻相关病毒方法的建立 被引量:4
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作者 包雯骏 张强 +3 位作者 李树清 林颖峥 李健 严亚贤 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2018年第6期42-47,共6页
为建立同时检测猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(Transmissible gastroenteritis virus,TGEV)、猪delta冠状病毒(Porcinedeltacoronavirus,PDCoV)和猪捷申病毒(Porcine teschovirus,PTV)... 为建立同时检测猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(Transmissible gastroenteritis virus,TGEV)、猪delta冠状病毒(Porcinedeltacoronavirus,PDCoV)和猪捷申病毒(Porcine teschovirus,PTV)的四重荧光qRT-PCR检测方法,本研究以PEDV的N基因、TGEV的S基因、PDCoV的M基因和PTV基因组5'非编码基因为检测对象,建立同时检测4种病毒的荧光RT-PCR方法。结果显示,该方法可以特异扩增4种病毒的基因,不能扩增猪呼吸道冠状病毒、伪狂犬病毒、猪瘟病毒、口蹄疫病毒、猪细小病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒和猪圆环病毒2型的基因;PEDV、TGEV、PDCoV和PTV的最低核酸检出量分别为141、68、8和11拷贝数;对100份送检样品进行检测,其中PEDV、TGEV、PDCoV和PTV感染检出率分别为10%、6%、2%和55%。结果表明本研究建立的检测方法具有良好的特异性和敏感性,而且操作快速简便,可用于猪腹泻疫病的临床诊断和流行病学调查。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 猪传染性胃肠炎病毒 delta病毒 猪捷申病毒 四重荧光RT-PCR 检测
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凉山地区猪腹泻样本中PEDV、PDCoV和GARV感染检测 被引量:2
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作者 彭艳伶 李昊 +4 位作者 余琼 李建 张斌 沈思思 任玉鹏 《四川畜牧兽医》 2017年第7期18-20,22,共4页
为了解四川省凉山州部分猪场3种猪腹泻病毒的感染情况,本研究采用RT-PCR方法,分别对来自德昌、冕宁县和宁南县多个规模化猪场的60份猪腹泻样本进行病原检测,包括猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪Delta冠状病毒(PDCoV)和猪A群轮状病毒(GARV)... 为了解四川省凉山州部分猪场3种猪腹泻病毒的感染情况,本研究采用RT-PCR方法,分别对来自德昌、冕宁县和宁南县多个规模化猪场的60份猪腹泻样本进行病原检测,包括猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪Delta冠状病毒(PDCoV)和猪A群轮状病毒(GARV)。结果显示:3种病原的检出率分别为PEDV15%、PDCoV33.33%、GARV58.33%,其中冕宁县PDCoV检出率为65%,而GARV检出率更高达70%;3种病毒混合感染的情况普遍存在,总体混合感染率分别为:德昌15%(3/20),冕宁60%(12/20),宁南5%(1/20),混合感染类型中尤以PDCoV和GARV的混合感染率最高,提示PDCoV和GARV可能存在更高的协同致病性。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 delta病毒 猪A群轮病毒 RT—PCR
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