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黄芩-金银花药对治疗新型冠状病毒肺炎潜在作用机制的网络药理学研究 被引量:34
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作者 刘嘉 严宝飞 +3 位作者 曾明月 曾庆琪 杨海军 张景正 《世界中医药》 CAS 2020年第4期502-511,共10页
目的:基于网络药理学探讨黄芩-金银花药对与新型冠状病毒肺炎(COVID-19)关联关系及潜在作用机制。方法:利用TCMSP和STRING数据库平台过滤黄芩-金银花的有效化合物及对应作用靶点;运用Cytoscape 3.7.0统计软件建立并分析黄芩-金银花有效... 目的:基于网络药理学探讨黄芩-金银花药对与新型冠状病毒肺炎(COVID-19)关联关系及潜在作用机制。方法:利用TCMSP和STRING数据库平台过滤黄芩-金银花的有效化合物及对应作用靶点;运用Cytoscape 3.7.0统计软件建立并分析黄芩-金银花有效化合物-作用靶点网络;利用STRING数据库平台和Cytoscape 3.7.0统计软件建立并分析黄芩-金银花有效化合物作用靶点PPI网络;利用Bioconductor对作用靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析。结果:黄芩-金银花59个有效化合物通过171条通路作用于202个靶点发挥其中医临床功效及潜在的COVID-19治疗作用。结论:黄芩-金银花所含的活性化合物可能通过抗病毒、抗炎等和肺、肝及心血管保护等作用,对COVID-19引发的肺损伤、肝损伤、心血管疾病和炎性反应具有潜在的预防与治疗作用,研究结果可为中医药治疗新冠肺炎提供一定的理论基础与科学依据。 展开更多
关键词 黄芩-金银花 药对 新型冠状病毒肺炎 网络药理学 潜在作用机制
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基于网络药理学探讨柴胡-黄芩治疗新型冠状病毒肺炎的作用机制 被引量:27
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作者 秦一冰 曲妮妮 +2 位作者 郑忻 石晓乐 赵克明 《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2020年第6期10-13,I0011,I0012,共6页
基于网络药理学预测柴胡-黄芩药对治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的作用靶点及信号通路,探讨其作用机制。方法:通过TCMSP数据库筛选柴胡-黄芩药对有效成分及对应作用靶点,运用GeneGards数据库对疾病靶点进行预测,将两者进行映射,利用Cy... 基于网络药理学预测柴胡-黄芩药对治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的作用靶点及信号通路,探讨其作用机制。方法:通过TCMSP数据库筛选柴胡-黄芩药对有效成分及对应作用靶点,运用GeneGards数据库对疾病靶点进行预测,将两者进行映射,利用Cytoscape 3.7.2软件构建PPI网络并进行GO富集分析与KEGG通路分析。结果:根据筛选条件得到53个化合物、730个对应的作用靶点、247个疾病潜在靶点。GO功能富集分析得到GO条目1131个,其中生物过程(BP)条目1087个,细胞组成(CC)条目11个,分子功能(MF)条目33个。KEGG通路富集筛选得到102条信号通路。结论:本研究预测出柴胡-黄芩药对治疗COVID-19的主要成分前六位是黄芩素、汉黄芩素、金合欢素、槲皮素、山柰酚、异鼠李碱。通过调节IL-6、IL1B、AKT1、IL1A、MAPK8、CASP8、STAT1、CCL2等靶点,调控TNF、IL-17等信号通路达到抑制炎症、调节细胞凋亡、减轻肺损伤的作用,从而达到治疗COVID-19的目的。 展开更多
关键词 柴胡-黄芩 新型冠状病毒肺炎 网络药理学 潜在作用机制
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基于网络药理学和文献筛选分析宣白承气汤治疗重型COVID-19的作用机制 被引量:8
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作者 王世豪 李彩霞 王至婉 《世界科学技术-中医药现代化》 CSCD 北大核心 2020年第10期3472-3484,共13页
目的基于网络药理学、文献筛选及分子对接探讨宣白承气汤治疗重型COVID-19的主要活性成分、作用靶点和相关通路,明确其潜在作用机制。方法利用TCMSP、PubChem和Swiss Target Prediction数据库筛选宣白承气汤的活性成分和作用靶点,从Gene... 目的基于网络药理学、文献筛选及分子对接探讨宣白承气汤治疗重型COVID-19的主要活性成分、作用靶点和相关通路,明确其潜在作用机制。方法利用TCMSP、PubChem和Swiss Target Prediction数据库筛选宣白承气汤的活性成分和作用靶点,从GeneCards数据库获取与重型COVID-19发生、发展相关的基因,将两者取交集得到药物治疗的潜在靶标,并利用已发表的宣白承气汤治疗重症肺炎的文献,找出有效检测指标,与各靶标取交集后,找出最有可能起作用的关键靶标。运用Cytoscape软件构建活性成分靶标作用网络,并STRING数据库构建蛋白互做网络,并筛选出核心靶标;运用R软件对作用靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析。使用SYBYL软件将主要的活性成分与与SARS-CoV-23CL水解酶和血管紧张素转化酶II(ACE2)进行分子对接。结果宣白承气汤的亚油酸乙酯、亚麻酸乙酯等46个活性成分可能通过PI3K/Akt通路、HIF1通路、Ras信号通路等140条通路作用于以IL6(白介素6)为核心的108个靶点发挥其治疗作用。分子对接结果显示:杏仁中的丁二酸二异辛酯、大黄中的β-胡萝卜素氧化物和瓜蒌中的亚油酸乙酯与与SARS-CoV-23CL水解酶、ACE3等具有较好的结合性。结论网络药理学、文献筛选及分子对接均表明宣白承气汤可用于重型COVID-19的治疗。宣白承气汤所含的活性成分可能通过抗炎、抗病毒、调节免疫、抗凝等作用,对重型COVID-19引发的炎症、免疫损伤、凝血异常等具有潜在的预防与治疗作用。 展开更多
关键词 宣白承气汤 重型COVID-19 网络药理学 文献筛选 分子对接 潜在作用机制
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基于整合药理学平台预测前列腺1号方治疗慢性前列腺炎作用机制 被引量:3
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作者 张天宇 刘嘉 +3 位作者 杨凯 曾明月 董盼攀 曾庆琪 《海南医学院学报》 CAS 2021年第17期1312-1318,共7页
目的:应用中医药整合药理学方法预测前列腺1号治疗慢性前列腺炎(chronic prostatitis,CP)的潜在作用机制。方法:借助TCMIP平台中药材数据库,筛选出前列腺1号方有效化学成分;应用中药(含方剂)靶标预测功能,建立前列腺1号方的潜在靶标数... 目的:应用中医药整合药理学方法预测前列腺1号治疗慢性前列腺炎(chronic prostatitis,CP)的潜在作用机制。方法:借助TCMIP平台中药材数据库,筛选出前列腺1号方有效化学成分;应用中药(含方剂)靶标预测功能,建立前列腺1号方的潜在靶标数据库。基于Human Phenotype Ontology数据库和蛋白质相互作用网络(PPI)数据库,明确CP疾病靶标并构建靶标相互作用网络;通过对前列腺1号治疗CP的候选靶标进行GO功能分析、KEGG通路富集分析,结合中外文献研究预测其治疗CP可能的生物途径和作用通路。结果:前列腺1号方通过8味中药、79个有效化学成分、33个核心靶标、11条通路发挥治疗慢性前列腺炎的药理作用。结论:前列腺1号对CP的干预治疗可能体现在抗炎抗肿瘤、细胞代谢、免疫调节、神经调节等方面。 展开更多
关键词 前列腺1号方 中医药整合药理学研究平台 慢性前列腺炎 潜在作用机制
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四妙勇安汤“异病同治”动脉粥样硬化与血栓闭塞性脉管炎机制研究 被引量:20
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作者 李艺博 张悦健 +2 位作者 李娟 童宏选 卢涛 《世界中医药》 CAS 2021年第18期2663-2671,共9页
目的:通过生物信息分析手段探讨四妙勇安汤对动脉粥样硬化(AS)与血栓闭塞性脉管炎(TAO)“异病同治”的潜在分子机制。方法:通过数据库挖掘与检索获取四妙勇安汤中4味中药的活性化合物和对应的靶标;通过GeneCards、比较基因组数据库(CTD... 目的:通过生物信息分析手段探讨四妙勇安汤对动脉粥样硬化(AS)与血栓闭塞性脉管炎(TAO)“异病同治”的潜在分子机制。方法:通过数据库挖掘与检索获取四妙勇安汤中4味中药的活性化合物和对应的靶标;通过GeneCards、比较基因组数据库(CTD)以及美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库筛选AS和TAO的关联靶点;运用Venny 2.1,获得药物作用于二病的共有靶点;基于STRING数据库构建共有靶蛋白的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;通过Cytoscape 3.7.2软件构建药物-活性化合物-共有靶点-疾病整体调控网络图。使用Bioconductor生物信息软件包进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:四妙勇安汤与AS、TAO的共有靶点主要为VEGFA、IL6、JUN、TNF、FOS、MAPK8、MMP9、IL10、ICAM1等计47个;筛选出以黄酮类和甾醇类为主的有效活性成分计9个;KEGG通路富集得到的这些靶点共同参与糖尿病并发症AGE-RAGE、TNF、动脉粥样硬化与流体剪切应力、人巨细胞病毒感染、细胞凋亡、T细胞受体等多条通路调节。结论:四妙勇安汤通过抗炎、减少斑块形成、免疫反应、改变血液流变等多条生物学通路发挥药理作用,证实了其多成分、多靶点、多途径的调节特点,预测了四妙勇安汤“异病同治”AS与TAO的潜在分子机制,为实验设计和后续研究提供理论依据。 展开更多
关键词 四妙勇安汤 动脉粥样硬化 血栓闭塞性脉管炎 异病同治 潜在作用机制 网络药理学
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