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致鹅败血症粪肠球菌溶血素激活因子基因克隆及序列分析
1
作者
狄婷婷
高原
聂鑫
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第7期683-688,共6页
目的了解粪肠球菌溶血素激活因子(CylA)基因的遗传变异情况。方法根据GenBank上已发表的粪肠球菌CylA基因序列设计2对特异性引物,对临床分离的4株致鹅败血症粪肠球菌CylA基因进行克隆及序列测定,并与国外从人体分离的和国内从猪体分离的...
目的了解粪肠球菌溶血素激活因子(CylA)基因的遗传变异情况。方法根据GenBank上已发表的粪肠球菌CylA基因序列设计2对特异性引物,对临床分离的4株致鹅败血症粪肠球菌CylA基因进行克隆及序列测定,并与国外从人体分离的和国内从猪体分离的各4株致病性粪肠球菌的CylA基因,用Lasergene 7.0软件进行同源性比对和构建系统进化发育树。结果鹅源4株菌CylA基因均长1 239bp,有1个完整的开放阅读框,编码412个氨基酸;序列中无缺失和插入,仅有1处未引起其编码氨基酸变异的无义突变。其余8株菌CylA基因及推导的氨基酸变异程度均不大。4株鹅源菌CylA基因推导的氨基酸同源性为100%;与国外人源菌和国内猪源菌CylA基因推导的氨基酸遗传距离也较近,同源性为98.6%～100%。结论粪肠球菌CylA基因高度保守,有可能成为检测诊断和免疫预防的靶基因。
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关键词
鹅
粪肠球菌
溶血素激活因子
克隆
同源性比对
系统进化发育树
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题名
致鹅败血症粪肠球菌溶血素激活因子基因克隆及序列分析
1
作者
狄婷婷
高原
聂鑫
机构
内蒙古民族大学动物科学技术学院
出处
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第7期683-688,共6页
基金
内蒙古自治区自然科学基金(200607010418)
内蒙古自治区高等学校科学研究项目(NJ05077)~~
文摘
目的了解粪肠球菌溶血素激活因子(CylA)基因的遗传变异情况。方法根据GenBank上已发表的粪肠球菌CylA基因序列设计2对特异性引物,对临床分离的4株致鹅败血症粪肠球菌CylA基因进行克隆及序列测定,并与国外从人体分离的和国内从猪体分离的各4株致病性粪肠球菌的CylA基因,用Lasergene 7.0软件进行同源性比对和构建系统进化发育树。结果鹅源4株菌CylA基因均长1 239bp,有1个完整的开放阅读框,编码412个氨基酸;序列中无缺失和插入,仅有1处未引起其编码氨基酸变异的无义突变。其余8株菌CylA基因及推导的氨基酸变异程度均不大。4株鹅源菌CylA基因推导的氨基酸同源性为100%;与国外人源菌和国内猪源菌CylA基因推导的氨基酸遗传距离也较近,同源性为98.6%～100%。结论粪肠球菌CylA基因高度保守,有可能成为检测诊断和免疫预防的靶基因。
关键词
鹅
粪肠球菌
溶血素激活因子
克隆
同源性比对
系统进化发育树
Keywords
goose
Enterococcus faecalis
cytolysin activator
clone
homologous alignment
phylogenetic trees
分类号
R378 [医药卫生—病原生物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
致鹅败血症粪肠球菌溶血素激活因子基因克隆及序列分析
狄婷婷
高原
聂鑫
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
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