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深圳杨梅坑海域造礁石珊瑚共生藻分类和遗传多样性研究
被引量：
1
1
作者
陈文静
佟飞
+4 位作者
陈丕茂
朱爱意
张露
李丹丹
龙鑫玲
《应用海洋学学报》
CSCD
北大核心
2019年第2期284-291,共8页
通过核糖体ITS(Internal Transcribed Spacer)的核苷酸序列研究了深圳杨梅坑海域20种47个造礁石珊瑚样本的共生藻。通过ITS序列分析,与GenBank上的4种不同的共生藻构建Neighbor-Joining聚类树,进行石珊瑚共生藻分类和遗传多样性分析。...
通过核糖体ITS(Internal Transcribed Spacer)的核苷酸序列研究了深圳杨梅坑海域20种47个造礁石珊瑚样本的共生藻。通过ITS序列分析,与GenBank上的4种不同的共生藻构建Neighbor-Joining聚类树,进行石珊瑚共生藻分类和遗传多样性分析。结果表明,该海域的造礁石珊瑚共生藻属于2种不同的种类(亚系群),19个样品属于C1亚系群共生藻,1个样品属于C15亚系群共生藻,C1和C15两个亚系群共生藻之间的遗传距离为0. 01。将深圳杨梅坑海域得到的ITS序列与NCBI数据库上的福建东山海域、广东徐闻地区的C1系共生藻进行比对,只有深圳杨梅坑海域藻类样本平均(A+T)碱基含量为49. 4%,(A+T)含量小于(G+C)含量。构建Neighbor-Joining聚类树表明,深圳杨梅坑海域石珊瑚共生藻与福建东山海域的亲缘关系较近,而与广东徐闻地区的亲缘关系较远,地理隔离是主要的因素。
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关键词
海洋生物学
造礁石珊瑚
共生藻
ITS序列
遗传多样性
深圳杨梅坑海域
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题名
深圳杨梅坑海域造礁石珊瑚共生藻分类和遗传多样性研究
被引量：
1
1
作者
陈文静
佟飞
陈丕茂
朱爱意
张露
李丹丹
龙鑫玲
机构
浙江海洋大学
中国水产科学研究院南海水产研究所
中国水产科学研究院南海水产研究所深圳实验基地
出处
《应用海洋学学报》
CSCD
北大核心
2019年第2期284-291,共8页
基金
深科技创新[2016]86号资助项目(JCYJ20160331141759795)
国家海洋公益性行业科研专项经费资助项目(201405020-2)
文摘
通过核糖体ITS(Internal Transcribed Spacer)的核苷酸序列研究了深圳杨梅坑海域20种47个造礁石珊瑚样本的共生藻。通过ITS序列分析,与GenBank上的4种不同的共生藻构建Neighbor-Joining聚类树,进行石珊瑚共生藻分类和遗传多样性分析。结果表明,该海域的造礁石珊瑚共生藻属于2种不同的种类(亚系群),19个样品属于C1亚系群共生藻,1个样品属于C15亚系群共生藻,C1和C15两个亚系群共生藻之间的遗传距离为0. 01。将深圳杨梅坑海域得到的ITS序列与NCBI数据库上的福建东山海域、广东徐闻地区的C1系共生藻进行比对,只有深圳杨梅坑海域藻类样本平均(A+T)碱基含量为49. 4%,(A+T)含量小于(G+C)含量。构建Neighbor-Joining聚类树表明,深圳杨梅坑海域石珊瑚共生藻与福建东山海域的亲缘关系较近,而与广东徐闻地区的亲缘关系较远,地理隔离是主要的因素。
关键词
海洋生物学
造礁石珊瑚
共生藻
ITS序列
遗传多样性
深圳杨梅坑海域
Keywords
marine biology
scleractinia corals
symbiodinium
ITS sequences
genetic diversity
Yangmeikeng sea area in Shenzhen
分类号
P735 [天文地球—海洋生物学]
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被引量
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1
深圳杨梅坑海域造礁石珊瑚共生藻分类和遗传多样性研究
陈文静
佟飞
陈丕茂
朱爱意
张露
李丹丹
龙鑫玲
《应用海洋学学报》
CSCD
北大核心
2019
1
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