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应用液体蛋白芯片飞行时间质谱技术研究原发性肝癌门静脉癌栓形成相关标志物 被引量:1
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作者 李长煜 王小林 +6 位作者 龚高全 程洁敏 陈颐 刘凌晓 李国平 王成刚 施东华 《复旦学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期459-463,共5页
目的应用液体蛋白质芯片飞行时间质谱技术研究肝癌门静脉癌栓(portal vein tumor thrombus,PVTT)形成相关标志物,并建立预测模型。方法采取非PVTT和PVTT原发性肝癌(hepatocellularcarcinoma,HCC)患者血清各20例,采用磁珠分离系统纯化、... 目的应用液体蛋白质芯片飞行时间质谱技术研究肝癌门静脉癌栓(portal vein tumor thrombus,PVTT)形成相关标志物,并建立预测模型。方法采取非PVTT和PVTT原发性肝癌(hepatocellularcarcinoma,HCC)患者血清各20例,采用磁珠分离系统纯化、基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization ti me of flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)分析及ClinProTools生物信息学方法研究其血清蛋白表达谱,通过神经网络算法(statistical neural networks,SNN)建立图谱诊断模型并进行验证。结果经数据对比分析找到39个差异有统计学意义的质荷比(m/z)峰(P<0.05),从中筛选出最具划分能力的8个质荷比峰(m/z=4 420.43、4 055.19、2 988.80、4 091.46、4 072.24、6 935.04、4 109.53和5 321.17),并以此建立HCC的PVTT诊断模型,模型识别率达到97.5%,而预测率达到92.73%。非PVTT组和PVTT组的准确性分别为100%和95%。结论筛选得到的蛋白可能成为原发性肝癌PVTT的相关标志物,诊断模型可能对预测PVTT的形成具有重要临床意义。 展开更多
关键词 原发性肝癌 门静脉癌栓 液体蛋白芯片飞行时间质谱 蛋白质组
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应用液体蛋白芯片飞行时间质谱系统研究胃癌的血清蛋白差异表达谱 被引量:1
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作者 高翔 刘文韬 +7 位作者 杨秋蒙 刘炳亚 蔡劬 李建芳 朱正伦 项明 燕敏 朱正纲 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2010年第16期933-936,共4页
目的:应用液体蛋白芯片飞行时间质谱系统分析胃癌患者血清蛋白质表达谱,寻找具有潜在诊断意义的血清标志物。方法:收集血清样本62例,其中正常对照组(N组)16例,胃癌组(T组)28例,验证组18例。经WCX磁珠纯化、MALDI-TOF-MS及ClinproTools... 目的:应用液体蛋白芯片飞行时间质谱系统分析胃癌患者血清蛋白质表达谱,寻找具有潜在诊断意义的血清标志物。方法:收集血清样本62例,其中正常对照组(N组)16例,胃癌组(T组)28例,验证组18例。经WCX磁珠纯化、MALDI-TOF-MS及ClinproTools生物信息学方法研究其血清蛋白表达谱,并筛选出差异蛋白质峰,运用数据挖掘算法,构建胃癌的血清蛋白诊断模型,并在验证组中验证其准确性。结果:1)通过对比胃癌组和正常组的血清蛋白质谱图,分析得到25个具有显著差异的蛋白质峰,其中差异最显著的前两位质核比分别为5 248.49m/z和5 754.25m/z,其灵敏度分别为84.61%和73.07%,特异性分别为100%和93.75%,能很好地区分胃癌组和正常组。2)通过ANN的数据挖掘的方法,在具有显著差别的25个蛋白质峰中,筛选了组合能力最强的6个蛋白峰(分别为4 268.05m/z、5 636.53m/z、5 248.49m/z、2 933.15m/z、1450.13m/z和1 349.4m/z),建立了胃恶性肿瘤的诊断模型,其识别率为100%,预测能力为90.59%,准确性为100%。将已知信息的验证组18例分别代入已建立的模型,特异性和灵敏性分别为75%和100%。结论:液体蛋白芯片飞行时间质谱系统作为研究蛋白表达谱的工具,能够用于筛选潜在的胃恶性肿瘤的血清标志物,利用其优点并结合统计学的方法,建立血清学胃癌的诊断模型,能为胃恶性肿瘤的筛查提供帮助。 展开更多
关键词 胃恶性肿瘤 液体蛋白芯片飞行质谱 磁珠 肿瘤标志物 数据挖掘
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液体芯片-飞行时间质谱对结膜松弛症患者泪液蛋白质的分析 被引量:3
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作者 项敏泓 张兴儒 +1 位作者 李青松 孙威 《眼科研究》 CSCD 北大核心 2010年第9期864-868,共5页
目的应用液体芯片-飞行时间质谱系统分析结膜松弛症患者的泪液蛋白质表达谱,寻找潜在具有结膜松弛症诊断意义的生物学标志物。方法收集10例结膜松弛症患者和9例正常对照的泪液,利用毛细管法每眼收集15μL泪液。经ClinProt磁珠纯化、基... 目的应用液体芯片-飞行时间质谱系统分析结膜松弛症患者的泪液蛋白质表达谱,寻找潜在具有结膜松弛症诊断意义的生物学标志物。方法收集10例结膜松弛症患者和9例正常对照的泪液,利用毛细管法每眼收集15μL泪液。经ClinProt磁珠纯化、基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)分析及ClinProTools生物信息学软件研究其泪液蛋白表达谱,比较2组人群泪液蛋白质谱表达的差异。结果 2组共检测发现了77个蛋白质峰,其中13个蛋白质峰差异有统计学意义(P<0.05)。其中质荷比(m/z)为1 632.48和3 401.87者为差异蛋白质,能较好地鉴别结膜松弛症组和正常对照组。结论液体芯片-飞行时间质谱系统可高效、精确地筛查泪液蛋白质。结膜松弛症组与正常对照组泪液蛋白存在差异,值得进一步研究,可能对发现结膜松弛症的发病机制和寻求有效的防治手段有指导作用。 展开更多
关键词 结膜松弛症 泪液蛋白 液体芯片-飞行时间质谱技术 差异蛋白
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基于液体芯片-飞行时间质谱分析的肺结核患者血清差异表达蛋白
4
作者 杨娟 杨拴盈 +3 位作者 倪磊 宋土生 于林 黄辰 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期728-732,共5页
目的应用液体芯片-飞行时间质谱技术分析肺结核患者和正常对照人群的血清蛋白多肽图谱,找出组间具有统计学意义的差异表达蛋白多肽,从而筛选出肺结核的标志蛋白多肽峰图(m/z)。方法应用2种液体蛋白芯片技术(MB-WCX和MB-IMAC-CU)结合飞... 目的应用液体芯片-飞行时间质谱技术分析肺结核患者和正常对照人群的血清蛋白多肽图谱,找出组间具有统计学意义的差异表达蛋白多肽,从而筛选出肺结核的标志蛋白多肽峰图(m/z)。方法应用2种液体蛋白芯片技术(MB-WCX和MB-IMAC-CU)结合飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)对14例病理确诊的肺结核患者和32例正常对照人群进行血清蛋白多肽图谱分析;采用ClinProTools软件分析肺结核患者和正常对照组的组间差异表达蛋白。结果 MB-WCX型液体蛋白芯片处理后共获得74个蛋白多肽峰图,其中42个蛋白多肽峰图呈组间极显著差异(P<0.001)表达。MB-IMAC-CU型液体蛋白芯片处理后共获得68个蛋白多肽峰图,有11个蛋白多肽呈组间极显著差异(P<0.001)表达,且其中的8个峰图与MB-WCX型液体芯片检出的组间极显著差异峰图完全相同。经MB-WCX处理所获的42个差异蛋白多肽峰图中有17个蛋白多肽在肺结核患者组中表达上调,其余25个蛋白多肽在肺结核患者组中表达下调。结论利用液体芯片-飞行时间质谱技术可以从肺结核患者的血清中获得稳定丰富的蛋白多肽图谱,并且能够筛选出潜在的疾病标志物。 展开更多
关键词 液体芯片-飞行时间质谱 肺结核患者 差异蛋白表达
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基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术对分枝杆菌液体培养系统菌种鉴定的临床研究 被引量:7
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作者 杜岩青 秦中华 张丽霞 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第10期871-877,共7页
目的应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)对Bactec^(TM) MGIT^(TM) 960液体培养出的阳性培养物进行高通量、快速、准确的菌种鉴定,为... 目的应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)对Bactec^(TM) MGIT^(TM) 960液体培养出的阳性培养物进行高通量、快速、准确的菌种鉴定,为临床早期、精准治疗提供病原学依据。方法选取我院Bactec^(TM) MGIT^(TM) 960分枝杆菌快速液体培养的阳性培养物为研究对象,通过不同的孵育时间、不同大小的研磨珠处理、不同的破壁方式摸索出MALDI-TOF MS对Bactec^(TM) MGIT^(TM) 960阳性培养物鉴定的"最优处理方法",并将所有结果与基因芯片法菌种鉴定做参照进行比对,鉴定不一致的结果通过基因测序确认。结果Bactec^(TM) MGIT^(TM) 960液体培养报阳性后增加孵育时间可提高检出率及鉴定分值,同时使用0.5 mm的氧化锆珠研磨,使用超声震荡混匀处理,鉴定效果最佳。鉴定结果方面,液体系统报阳的420份阳性标本,基因芯片法鉴定结果为结核分枝杆菌占69.05%(290/420),非结核菌占28.81%(121/420),9例未鉴定出,未鉴定占2.14%(9/420),错误鉴定占0.95%(4/420),总鉴定率为97.86%(411/420);采用MALDI-TOF MS质谱鉴定420份阳性标本中鉴定出419例,其中结核分枝杆菌占69.05%(290/420),非结核占30.00%(126/420),星型奴卡菌0.48%(2/420),巴西奴卡菌占0.24%(1/420),1例未鉴定出,总鉴定率为99.76%。质谱鉴定分值≥2.0的400例占95.24%,分值在1.7~2.0的19例占4.52%,分值<1.7的1例占0.24%。结论本实验实现了Bactec^(TM) MGIT^(TM) 960液体培养阳性培养物的直接质谱鉴定,缩短了培养鉴定的时间,将分枝杆菌鉴定到种水平,能区分出结核菌与非结核菌,同时也能将与分枝杆菌相似的奴卡菌鉴定出来,对临床疾病的鉴别诊断起到了积极的作用。 展开更多
关键词 Bactec^(TM)MGIT^(TM)960液体培养 基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱技术 结核分枝杆菌 非结核分枝杆菌
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表面增强激光解析离子化飞行时间质谱技术在大肠癌患者中肿瘤标记物的早期检测研究 被引量:3
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作者 张庆彤 冯勇 刘亚莉 《中国医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期789-791,共3页
目的进行大肠癌肿瘤标志物的早期检测,为大肠癌患者早期诊断提供依据。方法应用飞行时间质谱技术对80例大肠癌及41例健康人血清标本进行检测。结果大肠癌患者与健康对照样本检测到72个蛋白质的质核比(M/Z)峰值有统计学意义。获得分子量... 目的进行大肠癌肿瘤标志物的早期检测,为大肠癌患者早期诊断提供依据。方法应用飞行时间质谱技术对80例大肠癌及41例健康人血清标本进行检测。结果大肠癌患者与健康对照样本检测到72个蛋白质的质核比(M/Z)峰值有统计学意义。获得分子量为3961.44,4286.32,6438.39,3162.36,4301.49,4478.96,6844.42Da这7个蛋白质组成的模板,可将大肠癌与正常人正确分组。准确率为94.21%(114/121);敏感度为92.50%(74/80);特异度为86.96%(40/46)。结论飞行时间质谱技术可用于大肠癌肿瘤标志物的早期检测。 展开更多
关键词 飞行时间质谱 肿瘤标志物 大肠癌 肝转移 蛋白芯片
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表面增强激光解吸电离-飞行时间质谱在甲状腺癌诊断及临床分期中的应用 被引量:1
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作者 张静 卢秀波 +2 位作者 刘洋 徐桂安 李振宇 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2008年第1期123-125,共3页
目的:用表面增强激光解吸电离-飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)分析正常人和甲状腺癌患者血清蛋白指纹图谱的变化,建立能鉴别正常人和甲状腺癌及Ⅰ-Ⅱ期甲状腺癌和Ⅲ-Ⅳ期甲状腺癌患者的诊断模型。方法:应用SELDI-TOF-MS技术检测72例血清标... 目的:用表面增强激光解吸电离-飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)分析正常人和甲状腺癌患者血清蛋白指纹图谱的变化,建立能鉴别正常人和甲状腺癌及Ⅰ-Ⅱ期甲状腺癌和Ⅲ-Ⅳ期甲状腺癌患者的诊断模型。方法:应用SELDI-TOF-MS技术检测72例血清标本的蛋白质质谱,其中甲状腺癌40例(Ⅰ-Ⅱ期26例,Ⅲ-Ⅳ期14例),正常人32例。应用支持向量机和判别分析的方法分析质谱数据,建立甲状腺癌诊断模型并留一法交叉验证。结果:区分甲状腺癌和正常人的诊断模型交叉检验敏感性为100%,特异性为86%,总的符合率为93%;区分Ⅰ-Ⅱ期甲状腺癌和Ⅲ-Ⅳ期甲状腺癌患者的诊断模型对Ⅰ-Ⅱ期甲状腺癌检出的敏感性为77%,特异性为86%,对Ⅲ-Ⅳ期甲状腺癌检出的敏感性为86%,特异性为77%,总的符合率为80%。结论:应用SELDI-TOF-MS技术平台和生物信息技术建立的诊断模型为甲状腺癌的早期诊断及临床分期提供了新的手段。 展开更多
关键词 甲状腺癌 表面增强激光解吸电离-飞行时间质谱 蛋白芯片 肿瘤标志物
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慢性阻塞性肺疾病患者的血清差异表达蛋白分析 被引量:1
8
作者 杨娟 杨栓盈 +3 位作者 倪磊 宋土生 于林 黄辰 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期61-64,共4页
目的应用液体芯片-飞行时间质谱技术从慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者的血清中找出差异表达蛋白,筛选出其蛋白多肽(m/z)的疾病标志物。方法应用液体蛋白芯片(MB-WCX)结合飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)技术对16例病理确诊的COPD患者和32例正... 目的应用液体芯片-飞行时间质谱技术从慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者的血清中找出差异表达蛋白,筛选出其蛋白多肽(m/z)的疾病标志物。方法应用液体蛋白芯片(MB-WCX)结合飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)技术对16例病理确诊的COPD患者和32例正常对照人群进行血清蛋白组分析。采用ClinProTools软件进行蛋白多肽的组间差异对比,共获得115个蛋白多肽峰图,其中24个蛋白多肽峰图具有极显著差异(P<0.001),其中10个蛋白多肽在COPD患者中表达下调,其余14个蛋白多肽在COPD患者中表达上调。两组数据中最大差异的两个蛋白多肽峰分别是m/z:1 012.92和m/z:4 152.85。结论利用液体芯片-飞行时间质谱技术可以从COPD患者的血清中获得稳定丰富的蛋白多肽图谱,并且能够筛选出潜在的疾病标志物。 展开更多
关键词 液体芯片-飞行时间质谱 COPD患者 血清蛋白 疾病标志物
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SELDI筛选绒癌耐氨甲喋呤细胞株耐药相关蛋白 被引量:1
9
作者 杨晓丹 李巨 《中国医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期45-47,共3页
目的应用飞行时间质谱技术结合蛋白芯片分析筛选人绒毛癌细胞株JAR及其与人绒毛癌耐氨甲喋呤细胞株JAR/MTX之间的蛋白质表达差异,寻找出绒癌耐药的相关蛋白。方法采用体外细胞培养来提取两种细胞的胞浆蛋白和分泌蛋白,应用SELDI-TOF-MS... 目的应用飞行时间质谱技术结合蛋白芯片分析筛选人绒毛癌细胞株JAR及其与人绒毛癌耐氨甲喋呤细胞株JAR/MTX之间的蛋白质表达差异,寻找出绒癌耐药的相关蛋白。方法采用体外细胞培养来提取两种细胞的胞浆蛋白和分泌蛋白,应用SELDI-TOF-MS技术检测各细胞株提取的胞浆蛋白和分泌蛋白,采用CM-10型弱阳离子交换芯片检测。结果经SELDI技术检测发现质荷比(m/z)为8132.043,10738.36的胞浆蛋白在JAR/MTX细胞中呈高表达;质荷比(m/z)为11555.09的分泌蛋白及m/z为4896.68的胞浆蛋白在JAR细胞中高表达,在JAR/MTX中呈低表达。结论应用飞行时间质谱技术结合弱阳离子交换芯片,可有效筛选绒癌耐氨甲喋呤细胞株中的特异性表达蛋白;寻找到的差异蛋白与绒癌耐药密切相关,并可能成为本病耐药的标志物。 展开更多
关键词 滋养细胞肿瘤 JAR细胞株 JAR/MTX细胞株 蛋白芯片 差异蛋白 飞行时间质谱 表面增强激光解吸离子化
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QuEChERS EMR-Lipid技术结合LC-QTOF快速筛查与确证液体乳中兽药残留 被引量:10
10
作者 张凤艳 蒋万枫 王锡青 《中国乳品工业》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期57-60,共4页
建立了QuEChERS EMR-Lipid技术结合LC-QTOF筛查液体乳中兽药残留的方法,样品经5%甲酸乙腈提取,QuEChERS EMR-Lipid技术净化,LC-QTOF筛查与确证。建立了134种药物的一级筛查谱库,对其中40种常用兽药进行了方法学验证,方法的灵敏度、准确... 建立了QuEChERS EMR-Lipid技术结合LC-QTOF筛查液体乳中兽药残留的方法,样品经5%甲酸乙腈提取,QuEChERS EMR-Lipid技术净化,LC-QTOF筛查与确证。建立了134种药物的一级筛查谱库,对其中40种常用兽药进行了方法学验证,方法的灵敏度、准确性和重复性良好。对45个实际样品进行了一级谱库扫描,对发现的兽药残留通过二级质谱解析进一步确证,最终采用标准物质进行验证。该法能发现日常检测难以发现的问题,满足评估和监管液体乳中的药物残留的要求。 展开更多
关键词 QUECHERS 液体 兽药 液相四级杆飞行时间质谱 筛查
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基于代谢组学法鉴定液体果蜡中漂白紫胶的模型构建
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作者 李坤 张雯雯 +5 位作者 唐保山 邢淑婕 马金菊 朱静 雷福厚 张弘 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2023年第14期377-383,共7页
为鉴定液体果蜡中是否含有漂白紫胶,借鉴代谢组学的研究思路和方法,采用液相色谱-串联四极杆飞行时间质谱定性,并结合液相色谱蒸发光散射检测器对不同来源的漂白紫胶进行靶向化合物分析。通过无监督的主成分分析和有监督的偏最小二乘判... 为鉴定液体果蜡中是否含有漂白紫胶,借鉴代谢组学的研究思路和方法,采用液相色谱-串联四极杆飞行时间质谱定性,并结合液相色谱蒸发光散射检测器对不同来源的漂白紫胶进行靶向化合物分析。通过无监督的主成分分析和有监督的偏最小二乘判别分析等多元统计分析,筛选出12种靶向化合物。根据变量投影重要性值分为5种差异性化合物和7种共性化合物。最后,以共性化合物为生物标识物,在市售的商业化液体果蜡产品中,验证了该方法的可行性,通过该研究结论并结合色谱-质谱联用技术可以鉴定液体果蜡中是否含有漂白紫胶。 展开更多
关键词 漂白紫胶 鉴定 液体果蜡 液相色谱-四极杆串联飞行时间质谱
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基于贝叶斯-神经网络筛选矽肺早期标志物及建立诊断模型 被引量:1
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作者 马庆波 向华 +1 位作者 刘伟 王世鑫 《质谱学报》 EI CAS CSCD 2011年第1期50-54,共5页
应用液体芯片-飞行时间质谱技术检测了79例早期矽肺组和25例非暴露正常对照组的血清蛋白质。以贝叶斯判别法的最小错误率为目标函数,借助遗传算法全局优化搜索能力,筛选出能代表早期矽肺病人分类特征的最小最优差异蛋白质谱峰子集。用... 应用液体芯片-飞行时间质谱技术检测了79例早期矽肺组和25例非暴露正常对照组的血清蛋白质。以贝叶斯判别法的最小错误率为目标函数,借助遗传算法全局优化搜索能力,筛选出能代表早期矽肺病人分类特征的最小最优差异蛋白质谱峰子集。用选定的差异蛋白质谱峰子集建立早期矽肺的神经网络诊断模型,该模型的特异性为96%,敏感性为96.25%,准确率为96.15%。其中,1 777 u蛋白质谱峰经过二级质谱鉴定其氨基酸序列为补体C3的1个片段C3f(complement C3f),该片段在矽肺暴露人群中异常低,具有潜在的诊断意义。 展开更多
关键词 液体芯片-飞行时间质谱(MALDI-TOF—MS) 矽肺 贝叶斯 神经网络 标志物
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乳腺Paget病患者血清标志物的研究 被引量:3
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作者 石荷玲 杨志波 +1 位作者 朱明芳 陈晋广 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2010年第9期520-522,共3页
目的:目前,蛋白质芯片技术已成为肿瘤蛋白质组学研究的重要工具之一。本研究应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术(surfaced enhanced laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)寻找乳腺Paget... 目的:目前,蛋白质芯片技术已成为肿瘤蛋白质组学研究的重要工具之一。本研究应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术(surfaced enhanced laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)寻找乳腺Paget病患者血清特异性蛋白,找出最佳的标志蛋白组合模式作为临床诊断指标,以期用于乳腺Paget病患者的早期诊断。方法:用弱阳离子蛋白芯片(Weak cation exchanger protein chip,WCX2)及SELDI-TOF-MS技术检测10例健康者、10例乳房湿疹和15例乳腺Paget病患者血清中蛋白的相对含量。使用PBSⅡ-C型蛋白质芯片阅读机读取数据,获得的结果采用CIPHERGEN公司的Biomarkerwizard和Biomarker Patterns System软件分析。结果:Paget病患者与健康人相比质荷比为3868Da和8876Da的2个蛋白峰差异有统计学意义(P<0.01);与慢性湿疹相比质荷比为2911Da、3868Da、5097Da的3个蛋白质峰差异有统计学意义(P<0.05)。分析系统筛选出3868Da及8876Da标志蛋白建立起一个乳腺Paget病的诊断模型,对乳腺Paget病的诊断特异性为100%,敏感度为73.3%。结论:SELDI-TOS-MS技术对乳腺Paget病早期诊断和鉴别慢性湿疹具有诊断价值,在特异性肿瘤标记物的筛选等方面有一定应用前景,无创安全,值得推广。 展开更多
关键词 PAGET病 弱阳离子蛋白芯片 表面增强激光解析电离 飞行时间质谱
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