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保种场涪陵水牛及西南地区水牛品种间遗传结构与ROH分析
被引量：
1
1
作者
屠芸
曾雅楠
+8 位作者
张蒸豪
洪瑞
王震
吴平
周泽洋
叶艺茹
杜亚楠
左福元
张龚炜
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第5期1989-1998,共10页
旨在对保种场涪陵水牛及西南地区其他沼泽型水牛品种进行群体遗传结构和连续纯合片段(ROH)分析,为涪陵水牛保种与遗传改良提供理论依据。本研究对保种场26头涪陵水牛以及1头杂交水牛(FM_HY)进行全基因组重测序,从NCBI下载了68头西南地...
旨在对保种场涪陵水牛及西南地区其他沼泽型水牛品种进行群体遗传结构和连续纯合片段(ROH)分析,为涪陵水牛保种与遗传改良提供理论依据。本研究对保种场26头涪陵水牛以及1头杂交水牛(FM_HY)进行全基因组重测序,从NCBI下载了68头西南地区沼泽型水牛和7头河流型水牛的基因组重测序数据,基于所有的基因组数据获得的高质量单核苷酸多态性(SNPs)位点进行遗传结构、ROH以及近交系数的分析。全基因组重测序结果显示,涪陵水牛平均测序深度为10×,质量控制后共鉴定出14 326 437个SNPs。群体遗传结构分析显示,保种场内涪陵水牛与毗邻区域的宜宾水牛、贵州水牛、贵州白水牛、盐津水牛间具有明显的遗传结构差异,德宏水牛和滇东南水牛与上述5个品种区别均明显;当分群数量为K=6时,涪陵水牛可划分为2个类群,与毗邻区域水牛品种相比具有一类独特的群体结构。涪陵水牛、宜宾水牛、贵州水牛这3个品种间共检测到2 722个ROHs,其中涪陵水牛检测到1 593个ROHs,且1~2 Mb的短ROH片段占比达78.15%;仅在涪陵水牛群体中检测到8个大于16 Mb的长ROH片段,最长为24.56 Mb。基于ROH计算的保种场涪陵水牛平均近交系数为0.056 8,其中7头个体近交系数较高(0.062 5~0.125 0);贵州水牛和宜宾水牛的平均近交系数分别为0.034 6和0.041 0。综上,涪陵水牛保种群可分为2个类群,与毗邻区域水牛品种相比具有一类独特的群体结构;保种场内7头涪陵水牛个体存在近交风险,迫切需要加强涪陵水牛的资源保护与利用工作。
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关键词
涪陵水牛
群体遗传结构
SNP
ROH
近交系数
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职称材料
涪陵水牛短期育肥技术研究
被引量：
1
2
作者
向白菊
高立芳
+3 位作者
王琳
邢豫川
陈静
刘万红
《湖北畜牧兽医》
2012年第11期7-9,共3页
为了探索一条适合涪陵水牛老残牛的育肥方式,充分挖掘涪陵水牛的产肉性能,进行了舍饲条件下涪陵水牛老残牛的短期育肥试验,研究了饲喂不同日粮对老残牛增重情况、屠宰性能和经济效益的影响。结果表明,在舍饲条件下,增量精料饲喂方式为...
为了探索一条适合涪陵水牛老残牛的育肥方式,充分挖掘涪陵水牛的产肉性能,进行了舍饲条件下涪陵水牛老残牛的短期育肥试验,研究了饲喂不同日粮对老残牛增重情况、屠宰性能和经济效益的影响。结果表明,在舍饲条件下,增量精料饲喂方式为涪陵水牛的最适短期育肥方式。
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关键词
涪陵水牛
老残牛
短期育肥
舍饲
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职称材料
涪陵水牛种群保护现状及对策思考
3
作者
陈兴刚
《南方农业》
2014年第9期63-64,67,共3页
介绍涪陵水牛的品种特点、分布概况,分析其保护利用的现状和问题,提出建立和完善涪陵水牛组织管理机构、建立和完善涪陵水牛种质基因库、划定和建立涪陵水牛品种保护区、实施涪陵水牛养殖政府补贴、拓展涪陵水牛其他应用途径等对策。
关键词
涪陵水牛
种群
保护措施
役用
重庆市
涪陵
区马武镇
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职称材料
题名
保种场涪陵水牛及西南地区水牛品种间遗传结构与ROH分析
被引量：
1
1
作者
屠芸
曾雅楠
张蒸豪
洪瑞
王震
吴平
周泽洋
叶艺茹
杜亚楠
左福元
张龚炜
机构
西南大学动物科学技术学院
重庆市肉牛工程技术研究中心
重庆市畜牧技术推广总站
重庆市南川区畜牧兽医渔业中心
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第5期1989-1998,共10页
基金
重庆市技术创新与应用发展专项重点项目(cstc2021jscx-gksbX0012)
重庆市农业种质资源精准鉴定项目(23316)。
文摘
旨在对保种场涪陵水牛及西南地区其他沼泽型水牛品种进行群体遗传结构和连续纯合片段(ROH)分析,为涪陵水牛保种与遗传改良提供理论依据。本研究对保种场26头涪陵水牛以及1头杂交水牛(FM_HY)进行全基因组重测序,从NCBI下载了68头西南地区沼泽型水牛和7头河流型水牛的基因组重测序数据,基于所有的基因组数据获得的高质量单核苷酸多态性(SNPs)位点进行遗传结构、ROH以及近交系数的分析。全基因组重测序结果显示,涪陵水牛平均测序深度为10×,质量控制后共鉴定出14 326 437个SNPs。群体遗传结构分析显示,保种场内涪陵水牛与毗邻区域的宜宾水牛、贵州水牛、贵州白水牛、盐津水牛间具有明显的遗传结构差异,德宏水牛和滇东南水牛与上述5个品种区别均明显;当分群数量为K=6时,涪陵水牛可划分为2个类群,与毗邻区域水牛品种相比具有一类独特的群体结构。涪陵水牛、宜宾水牛、贵州水牛这3个品种间共检测到2 722个ROHs,其中涪陵水牛检测到1 593个ROHs,且1~2 Mb的短ROH片段占比达78.15%;仅在涪陵水牛群体中检测到8个大于16 Mb的长ROH片段,最长为24.56 Mb。基于ROH计算的保种场涪陵水牛平均近交系数为0.056 8,其中7头个体近交系数较高(0.062 5~0.125 0);贵州水牛和宜宾水牛的平均近交系数分别为0.034 6和0.041 0。综上,涪陵水牛保种群可分为2个类群,与毗邻区域水牛品种相比具有一类独特的群体结构;保种场内7头涪陵水牛个体存在近交风险,迫切需要加强涪陵水牛的资源保护与利用工作。
关键词
涪陵水牛
群体遗传结构
SNP
ROH
近交系数
Keywords
Fuling buffalo
population genetic structure
SNP
ROH
inbreeding coefficient
分类号
S823.83 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
涪陵水牛短期育肥技术研究
被引量：
1
2
作者
向白菊
高立芳
王琳
邢豫川
陈静
刘万红
机构
重庆市畜牧科学院
出处
《湖北畜牧兽医》
2012年第11期7-9,共3页
基金
重庆市科技攻关计划项目(CSTC
2010AC1122)
文摘
为了探索一条适合涪陵水牛老残牛的育肥方式,充分挖掘涪陵水牛的产肉性能,进行了舍饲条件下涪陵水牛老残牛的短期育肥试验,研究了饲喂不同日粮对老残牛增重情况、屠宰性能和经济效益的影响。结果表明,在舍饲条件下,增量精料饲喂方式为涪陵水牛的最适短期育肥方式。
关键词
涪陵水牛
老残牛
短期育肥
舍饲
分类号
S823.99 [农业科学—畜牧学]
在线阅读
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职称材料
题名
涪陵水牛种群保护现状及对策思考
3
作者
陈兴刚
机构
重庆市涪陵区马武镇农业服务中心
出处
《南方农业》
2014年第9期63-64,67,共3页
文摘
介绍涪陵水牛的品种特点、分布概况,分析其保护利用的现状和问题,提出建立和完善涪陵水牛组织管理机构、建立和完善涪陵水牛种质基因库、划定和建立涪陵水牛品种保护区、实施涪陵水牛养殖政府补贴、拓展涪陵水牛其他应用途径等对策。
关键词
涪陵水牛
种群
保护措施
役用
重庆市
涪陵
区马武镇
分类号
S823 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
保种场涪陵水牛及西南地区水牛品种间遗传结构与ROH分析
屠芸
曾雅楠
张蒸豪
洪瑞
王震
吴平
周泽洋
叶艺茹
杜亚楠
左福元
张龚炜
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
1
在线阅读
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职称材料
2
涪陵水牛短期育肥技术研究
向白菊
高立芳
王琳
邢豫川
陈静
刘万红
《湖北畜牧兽医》
2012
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
涪陵水牛种群保护现状及对策思考
陈兴刚
《南方农业》
2014
0
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职称材料
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