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基于环境RNA研究海山效应对浮游细菌多样性和分布的影响
被引量：
1
1
作者
尹婷婷
赵峰
+1 位作者
刘巍岳
徐奎栋
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第7期1111-1119,共9页
研究采用环境RNA技术探究西太平洋M4海山区细菌多样性,并与基于环境DNA技术的研究结果进行比较,解析细菌代谢活性特征。结果表明基于环境RNA和DNA技术检获的物种构成相似,但真光层中蓝细菌在RNA中的占比明显高于DNA,显示其高代谢活性;...
研究采用环境RNA技术探究西太平洋M4海山区细菌多样性,并与基于环境DNA技术的研究结果进行比较,解析细菌代谢活性特征。结果表明基于环境RNA和DNA技术检获的物种构成相似,但真光层中蓝细菌在RNA中的占比明显高于DNA,显示其高代谢活性;而α变形菌在RNA中的占比明显小于DNA,代谢活性低;γ变形菌在RNA中占比更大且随水层加深而增加。物种间关系网络复杂度随着水深的增加呈先升高后下降的趋势。基于RNA数据构建的网络较DNA数据网络简单,且随着水深增加变化趋势更加显著,去除蓝细菌后网络变化剧烈,而去除α变形菌对网络影响小。综上,研究基于环境RNA技术提供了海山区浮游细菌多样性及分布更加完整的认知,α变形菌在海山区多样性占比和其在群落中作用可能被高估。
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关键词
深海
环境RNA
细菌
微生物多样性
海山效应
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职称材料
西太平洋M2和M4海山区浮游动物群落组成及生物量研究
2
作者
景薛
金鑫
+2 位作者
王彦涛
王延清
陶振铖
《海洋与湖沼》
北大核心
2025年第5期1177-1190,共14页
利用湿重测量法与ZooSCAN图像扫描分析法相结合的方法,以西太平洋马里亚纳M2和卡罗琳M4海山区的浮游动物群落为研究对象,分析比较了两个海山区大型和大中型浮游动物群落的生物量组成、水平分布情况及浮游动物群落生物量的差异;结合温度...
利用湿重测量法与ZooSCAN图像扫描分析法相结合的方法,以西太平洋马里亚纳M2和卡罗琳M4海山区的浮游动物群落为研究对象,分析比较了两个海山区大型和大中型浮游动物群落的生物量组成、水平分布情况及浮游动物群落生物量的差异;结合温度、盐度和叶绿素a浓度等环境因子数据,探讨了海山对大型和大中型浮游动物群落及其组成类群碳生物量的影响。结果表明,ZooSCAN图像分析法能够准确区分和计算出不同浮游动物类群的碳生物量组成,其精度显著优于传统湿重法;M2与M4海山区的浮游动物群落碳生物量均以桡足类为主,磷虾类次之,M2海山区浮游动物群落的总碳生物量要高于M4海山区,其中毛颚类碳生物量占比也明显高于M4海山区。相关性、主成分和BIO-ENV分析结果表明,两个海山区浮游动物群落生物量的首要环境影响因子均为盐度。叶绿素a浓度同样对M2海山区的浮游动物群落分布有一定影响,但对M4海山区大中型浮游动物群落生物量的影响并不明显。基于此,推测两个海山对浮游动物群落生物量都存在“海山效应”,M2海山山顶海域对中小型浮游动物群落的聚集作用显著高于M4海山,而M4海山山顶海域则促进了大型浮游动物群落生物量的分布。
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关键词
浮游动物
碳生物量
ZooSCAN
海山效应
西太平洋
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职称材料
基于环境RNA研究西太平洋浅水海山区真核微生物多样性及其与细菌的关系
3
作者
尹婷婷
赵峰
+1 位作者
刘巍岳
徐奎栋
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第5期1213-1222,共10页
海山遍布大洋海底,由于其特殊海底地形和水文动力环境,孕育了丰富且特殊的生物群落。采用环境RNA技术分析西太平洋M4浅水海山区真核微生物的多样性和分布,并与环境DNA技术检获的结果进行比较,揭示二者的异同。研究发现,RNA和DNA技术检...
海山遍布大洋海底,由于其特殊海底地形和水文动力环境,孕育了丰富且特殊的生物群落。采用环境RNA技术分析西太平洋M4浅水海山区真核微生物的多样性和分布,并与环境DNA技术检获的结果进行比较,揭示二者的异同。研究发现,RNA和DNA技术检获的表层和DCM层群落结构相似,在200 m以深的水层中群落结构差异较大。共甲藻纲的相对丰度在DNA数据中占比高于RNA数据,因此可能被基于eDNA的技术高估;而甲藻纲和金藻纲则相反,存在被低估的可能性。通过真核微生物与细菌的共现网络,揭示甲藻虽然是海山区叶绿素最大层共现网络中的关键类群,但其与细菌的相互关系弱,且代谢活性较弱。金藻中行混合营养的类群以及Bicoecea类群,在深层海水中普遍存在,且具有较高的代谢活性。环境RNA技术可检获有生命活性的物种分布,为海山区真核微生物多样性及分布提供更完整的认知。
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关键词
深海
环境RNA
扩增子
原生生物多样性
海山效应
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职称材料
题名
基于环境RNA研究海山效应对浮游细菌多样性和分布的影响
被引量：
1
1
作者
尹婷婷
赵峰
刘巍岳
徐奎栋
机构
青岛农业大学
中国科学院海洋研究所海洋生物分类与系统演化实验室
中国科学院大学
出处
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第7期1111-1119,共9页
基金
国家自然科学基金(41930533和41976099)
中国科学院青年创新促进会(2022206)资助。
文摘
研究采用环境RNA技术探究西太平洋M4海山区细菌多样性,并与基于环境DNA技术的研究结果进行比较,解析细菌代谢活性特征。结果表明基于环境RNA和DNA技术检获的物种构成相似,但真光层中蓝细菌在RNA中的占比明显高于DNA,显示其高代谢活性;而α变形菌在RNA中的占比明显小于DNA,代谢活性低;γ变形菌在RNA中占比更大且随水层加深而增加。物种间关系网络复杂度随着水深的增加呈先升高后下降的趋势。基于RNA数据构建的网络较DNA数据网络简单,且随着水深增加变化趋势更加显著,去除蓝细菌后网络变化剧烈,而去除α变形菌对网络影响小。综上,研究基于环境RNA技术提供了海山区浮游细菌多样性及分布更加完整的认知,α变形菌在海山区多样性占比和其在群落中作用可能被高估。
关键词
深海
环境RNA
细菌
微生物多样性
海山效应
Keywords
Deep sea
Environmental RNA
Bacteria
Microbial diversity
Seamount effect
分类号
Q938 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
西太平洋M2和M4海山区浮游动物群落组成及生物量研究
2
作者
景薛
金鑫
王彦涛
王延清
陶振铖
机构
中国科学院海洋研究所海洋生态与环境科学重点实验室
崂山实验室
中国科学院大学
中国科学院海洋研究所工程技术部
出处
《海洋与湖沼》
北大核心
2025年第5期1177-1190,共14页
基金
国家自然科学基金重大项目,42090044号
中国科学院战略性先导科技专项(A类),XDA11030202号
“科学”号高端用户项目,KEXUE2018G17号。
文摘
利用湿重测量法与ZooSCAN图像扫描分析法相结合的方法,以西太平洋马里亚纳M2和卡罗琳M4海山区的浮游动物群落为研究对象,分析比较了两个海山区大型和大中型浮游动物群落的生物量组成、水平分布情况及浮游动物群落生物量的差异;结合温度、盐度和叶绿素a浓度等环境因子数据,探讨了海山对大型和大中型浮游动物群落及其组成类群碳生物量的影响。结果表明,ZooSCAN图像分析法能够准确区分和计算出不同浮游动物类群的碳生物量组成,其精度显著优于传统湿重法;M2与M4海山区的浮游动物群落碳生物量均以桡足类为主,磷虾类次之,M2海山区浮游动物群落的总碳生物量要高于M4海山区,其中毛颚类碳生物量占比也明显高于M4海山区。相关性、主成分和BIO-ENV分析结果表明,两个海山区浮游动物群落生物量的首要环境影响因子均为盐度。叶绿素a浓度同样对M2海山区的浮游动物群落分布有一定影响,但对M4海山区大中型浮游动物群落生物量的影响并不明显。基于此,推测两个海山对浮游动物群落生物量都存在“海山效应”,M2海山山顶海域对中小型浮游动物群落的聚集作用显著高于M4海山,而M4海山山顶海域则促进了大型浮游动物群落生物量的分布。
关键词
浮游动物
碳生物量
ZooSCAN
海山效应
西太平洋
Keywords
zooplankton
carbon biomass
ZooSCAN
seamount effect
Western Pacific Ocean
分类号
Q948.8 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
基于环境RNA研究西太平洋浅水海山区真核微生物多样性及其与细菌的关系
3
作者
尹婷婷
赵峰
刘巍岳
徐奎栋
机构
青岛农业大学生命科学学院
中国科学院海洋研究所海洋生物分类与系统演化实验室
中国科学院大学
出处
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第5期1213-1222,共10页
基金
国家自然科学基金资助项目,42376134号,41976099号,41930533号
中国科学院青年创新促进会,2022206号。
文摘
海山遍布大洋海底,由于其特殊海底地形和水文动力环境,孕育了丰富且特殊的生物群落。采用环境RNA技术分析西太平洋M4浅水海山区真核微生物的多样性和分布,并与环境DNA技术检获的结果进行比较,揭示二者的异同。研究发现,RNA和DNA技术检获的表层和DCM层群落结构相似,在200 m以深的水层中群落结构差异较大。共甲藻纲的相对丰度在DNA数据中占比高于RNA数据,因此可能被基于eDNA的技术高估;而甲藻纲和金藻纲则相反,存在被低估的可能性。通过真核微生物与细菌的共现网络,揭示甲藻虽然是海山区叶绿素最大层共现网络中的关键类群,但其与细菌的相互关系弱,且代谢活性较弱。金藻中行混合营养的类群以及Bicoecea类群,在深层海水中普遍存在,且具有较高的代谢活性。环境RNA技术可检获有生命活性的物种分布,为海山区真核微生物多样性及分布提供更完整的认知。
关键词
深海
环境RNA
扩增子
原生生物多样性
海山效应
Keywords
deep sea
environmental RNA
amplicon
protist diversity
seamount effect
分类号
Q938 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于环境RNA研究海山效应对浮游细菌多样性和分布的影响
尹婷婷
赵峰
刘巍岳
徐奎栋
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
1
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职称材料
2
西太平洋M2和M4海山区浮游动物群落组成及生物量研究
景薛
金鑫
王彦涛
王延清
陶振铖
《海洋与湖沼》
北大核心
2025
0
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职称材料
3
基于环境RNA研究西太平洋浅水海山区真核微生物多样性及其与细菌的关系
尹婷婷
赵峰
刘巍岳
徐奎栋
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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