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浮游细菌群落结构及其与网箱养殖鱼病害的关系
1
作者
陈鹤
李筱鑫
+5 位作者
崔婧
蒙爱云
骆大鹏
刘庆明
邱名毅
涂志刚
《热带生物学报》
2023年第1期17-24,共8页
为了揭示深水网箱养殖区养殖过程中浮游细菌群落结构及其与网箱养殖鱼类细菌性病害的关系,采用Illumina测序技术对海南后水湾深水网箱养殖水样进行16S rRNA基因高通量测序。结果表明,检测到浮游细菌种群归属于36个门、56个纲、98个目、...
为了揭示深水网箱养殖区养殖过程中浮游细菌群落结构及其与网箱养殖鱼类细菌性病害的关系,采用Illumina测序技术对海南后水湾深水网箱养殖水样进行16S rRNA基因高通量测序。结果表明,检测到浮游细菌种群归属于36个门、56个纲、98个目、235个科、807个属,香农-威纳指数范围为2.47~4.5,说明该养殖区水体中浮游细菌具有丰富的多样性。变形菌门是主要优势门类,其次为拟杆菌门、放线菌门、厚壁菌门和蓝细菌门;主要类群为Cobetia属、弧菌属(Vibrio)、假交替单胞菌属(Pseudoalteromonas)、盐单胞菌属(Halomonas)等,不同养殖期优势类群差异较大,其中休养期以Cobetia属、玫瑰变色菌属和嗜冷杆菌属为主;养殖初期以Cobetia属、假交替单胞菌属、Kushneria属和弧菌属为主;养殖中期优势类群为Cobetia属、盐单胞菌属、交替单胞菌属(Alteromonas)、弧菌属和假交替单胞菌属;养殖后期优势类群为GpIIa属和Cobetia属。潜在致病菌弧菌属相对丰度在不同养殖期差异较大,在养殖初期、中期含量较高,而在非养殖期和养殖后期含量较低,与网箱养殖卵形鲳鲹细菌性病害发病规律相吻合,表明由于弧菌引起的鱼类病害为养殖区的主要细菌性病害类型。
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关键词
网箱养殖
16S
rRNA基因高通量测序
浮游细菌群落结构
水质因子
细菌
性病害
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职称材料
渤海湾表层海水中浮游细菌群落随离岸距离的分布特征及其影响因素
被引量:
8
2
作者
赵维
王敬敬
+4 位作者
徐松
李晴晴
杨榕
张小霞
黄志勇
《海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第12期156-171,共16页
为研究渤海湾近岸污染对远近岸海域微生态的影响,利用高通量测序技术,对渤海湾不同离岸距离的6个站位采集表层海水,进行浮游细菌群落结构分析,结合环境、空间因素探究影响其变化的主要因素。结果表明:研究区域存在环境因子的梯度变化,...
为研究渤海湾近岸污染对远近岸海域微生态的影响,利用高通量测序技术,对渤海湾不同离岸距离的6个站位采集表层海水,进行浮游细菌群落结构分析,结合环境、空间因素探究影响其变化的主要因素。结果表明:研究区域存在环境因子的梯度变化,如氮营养盐在近岸高于远岸;细菌α-多样性在不同站位间差异不显著,但仍显示在近岸相对较高;细菌群落结构随离岸距离变化显著,γ-变形菌和拟杆菌在近岸显著富集,且与氮营养盐的含量有关;蓝细菌在远岸显著富集,且与氨氮、透明度、电导率有关;邻体矩阵主坐标单独解释部分对群落结构变异的贡献率最大(38.1%),说明可能存在尚未测量但具有空间结构的环境变量影响群落空间分布;结合功能预测的结果推测近岸区域的富营养与烃类污染等可能影响群落变化。本文从环境和空间影响两方面探讨了渤海湾不同离岸距离的海域浮游细菌群落结构变化,为研究渤海湾海洋生态及环境保护提供一定的参考。
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关键词
渤海湾
浮游细菌群落结构
地理分布
功能预测
邻体矩阵主坐标
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职称材料
象山港电厂温排水增温对浮游细菌群落空间分布的影响
被引量:
15
3
作者
陈梦齐
刘紫丹
+3 位作者
戴文芳
叶仙森
梁新友
熊金波
《生态学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第20期6574-6582,共9页
沿海电厂产生的温排水已造成了较严重的环境问题,如生物病害和赤潮暴发频率增加。现有研究多关注温排水增温对浮游动、植物多样性的影响,而缺乏在物质能量循环过程起核心纽带作用的微生物对增温的响应和反馈。考虑到生态系统对增温的反...
沿海电厂产生的温排水已造成了较严重的环境问题,如生物病害和赤潮暴发频率增加。现有研究多关注温排水增温对浮游动、植物多样性的影响,而缺乏在物质能量循环过程起核心纽带作用的微生物对增温的响应和反馈。考虑到生态系统对增温的反馈取决于浮游植物的初级生产力和微生物异养呼吸之间的平衡,利用Illumina测序技术结合水体理化性质研究了象山港电厂温排水增温梯度下浮游细菌的空间分布特征。温排水预期的海水增温显著地增加了水体中硝氮(P=0.041,单因素方差分析)、化学需氧量(P<0.001)、油污(P=0.004)和余氯(P=0.003)的浓度;但降低了溶解氧(P=0.034)和叶绿素a(P=0.045)的含量。此外,相似性分析发现温排水增温显著地(r=0.338;P=0.042)改变了浮游细菌群落结构,空间分布遵循空间距离-群落相似性衰减(r=-0.582;P=0.026)模型,周转速率为0.0013。细菌多样性主要受水体溶解氧、化学需要量和叶绿素a的影响,分别控制了34.6%、20.1%和10.0%的多样性变异。冗余分析(RDA)群落变异主要受环境因子(包括温度、油污、溶解氧和叶绿素a)的影响,一共解释了55.6%的群落变异;增温仅解释了4.8%的群落变异。因此,浮游细菌群落结构主要受环境因子的影响,这种各因子对群落变异相对贡献比例的特征与增温主要通过改变水质和浮游植物特征,以间接作用影响细菌群落组成的观念一致。此外,细菌多样性和群落组成受不同环境因子的驱动。相比而言,空间距离只控制了较小比例的群落变异(7.1%)。此外,筛选到11个细菌科,这些科的相对丰度与增温幅度显著相关,变化特征与各科已知的生态功能相吻合,如海洋螺菌科(Oceanospirillaceae)中有些菌株能够降解石油污染物,其相对丰度在高油污浓度站点增加(油污浓度与增温幅度正相关,r=0.558;P=0.030);嗜温的弧菌科相对丰度与增温幅度正相关。综上,研究结果初步明确了浮游细菌群落对电厂温排水增温的响应特征,并筛选到敏感的细菌科来指示和预测增温对生态功能的潜在影响。
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关键词
温排水
浮游细菌群落结构
空间分布
指示
细菌
科
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职称材料
题名
浮游细菌群落结构及其与网箱养殖鱼病害的关系
1
作者
陈鹤
李筱鑫
崔婧
蒙爱云
骆大鹏
刘庆明
邱名毅
涂志刚
机构
海南省海洋与渔业科学院
新南威尔士大学
出处
《热带生物学报》
2023年第1期17-24,共8页
基金
海南省重大科技计划项目(ZDKJ2016011)。
文摘
为了揭示深水网箱养殖区养殖过程中浮游细菌群落结构及其与网箱养殖鱼类细菌性病害的关系,采用Illumina测序技术对海南后水湾深水网箱养殖水样进行16S rRNA基因高通量测序。结果表明,检测到浮游细菌种群归属于36个门、56个纲、98个目、235个科、807个属,香农-威纳指数范围为2.47~4.5,说明该养殖区水体中浮游细菌具有丰富的多样性。变形菌门是主要优势门类,其次为拟杆菌门、放线菌门、厚壁菌门和蓝细菌门;主要类群为Cobetia属、弧菌属(Vibrio)、假交替单胞菌属(Pseudoalteromonas)、盐单胞菌属(Halomonas)等,不同养殖期优势类群差异较大,其中休养期以Cobetia属、玫瑰变色菌属和嗜冷杆菌属为主;养殖初期以Cobetia属、假交替单胞菌属、Kushneria属和弧菌属为主;养殖中期优势类群为Cobetia属、盐单胞菌属、交替单胞菌属(Alteromonas)、弧菌属和假交替单胞菌属;养殖后期优势类群为GpIIa属和Cobetia属。潜在致病菌弧菌属相对丰度在不同养殖期差异较大,在养殖初期、中期含量较高,而在非养殖期和养殖后期含量较低,与网箱养殖卵形鲳鲹细菌性病害发病规律相吻合,表明由于弧菌引起的鱼类病害为养殖区的主要细菌性病害类型。
关键词
网箱养殖
16S
rRNA基因高通量测序
浮游细菌群落结构
水质因子
细菌
性病害
Keywords
mariculture in cage
bacterioplankton community
high throughput 16S rRNA gene sequencing
water quality factor
bacterial diseases
分类号
S941.42 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
渤海湾表层海水中浮游细菌群落随离岸距离的分布特征及其影响因素
被引量:
8
2
作者
赵维
王敬敬
徐松
李晴晴
杨榕
张小霞
黄志勇
机构
中国科学院天津工业生物技术研究所天津市工业生物系统与过程工程重点实验室
出处
《海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第12期156-171,共16页
基金
天津市科技计划项目(18ZXSZSF00100,18YFZCNC01180,16YFXTSY00580)
国家自然科学基金项目(3150020230)
中国科学院战略生物资源计划(KFJ-BRP-009)
文摘
为研究渤海湾近岸污染对远近岸海域微生态的影响,利用高通量测序技术,对渤海湾不同离岸距离的6个站位采集表层海水,进行浮游细菌群落结构分析,结合环境、空间因素探究影响其变化的主要因素。结果表明:研究区域存在环境因子的梯度变化,如氮营养盐在近岸高于远岸;细菌α-多样性在不同站位间差异不显著,但仍显示在近岸相对较高;细菌群落结构随离岸距离变化显著,γ-变形菌和拟杆菌在近岸显著富集,且与氮营养盐的含量有关;蓝细菌在远岸显著富集,且与氨氮、透明度、电导率有关;邻体矩阵主坐标单独解释部分对群落结构变异的贡献率最大(38.1%),说明可能存在尚未测量但具有空间结构的环境变量影响群落空间分布;结合功能预测的结果推测近岸区域的富营养与烃类污染等可能影响群落变化。本文从环境和空间影响两方面探讨了渤海湾不同离岸距离的海域浮游细菌群落结构变化,为研究渤海湾海洋生态及环境保护提供一定的参考。
关键词
渤海湾
浮游细菌群落结构
地理分布
功能预测
邻体矩阵主坐标
Keywords
Bohai Bay
bacterioplankton community composition
geographic distribution
function prediction
PCNM
分类号
P722.4 [天文地球—海洋科学]
Q938 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
象山港电厂温排水增温对浮游细菌群落空间分布的影响
被引量:
15
3
作者
陈梦齐
刘紫丹
戴文芳
叶仙森
梁新友
熊金波
机构
宁波大学海洋学院
宁波海洋环境监测中心站
浙江海洋高效健康养殖协同创新中心
出处
《生态学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第20期6574-6582,共9页
基金
浙江省自然科学基金项目(LY15D060002)
宁波市自然科学基金项目(2015A610246)
浙江省重中之重学科开放基金项目(XKZSC1421)
文摘
沿海电厂产生的温排水已造成了较严重的环境问题,如生物病害和赤潮暴发频率增加。现有研究多关注温排水增温对浮游动、植物多样性的影响,而缺乏在物质能量循环过程起核心纽带作用的微生物对增温的响应和反馈。考虑到生态系统对增温的反馈取决于浮游植物的初级生产力和微生物异养呼吸之间的平衡,利用Illumina测序技术结合水体理化性质研究了象山港电厂温排水增温梯度下浮游细菌的空间分布特征。温排水预期的海水增温显著地增加了水体中硝氮(P=0.041,单因素方差分析)、化学需氧量(P<0.001)、油污(P=0.004)和余氯(P=0.003)的浓度;但降低了溶解氧(P=0.034)和叶绿素a(P=0.045)的含量。此外,相似性分析发现温排水增温显著地(r=0.338;P=0.042)改变了浮游细菌群落结构,空间分布遵循空间距离-群落相似性衰减(r=-0.582;P=0.026)模型,周转速率为0.0013。细菌多样性主要受水体溶解氧、化学需要量和叶绿素a的影响,分别控制了34.6%、20.1%和10.0%的多样性变异。冗余分析(RDA)群落变异主要受环境因子(包括温度、油污、溶解氧和叶绿素a)的影响,一共解释了55.6%的群落变异;增温仅解释了4.8%的群落变异。因此,浮游细菌群落结构主要受环境因子的影响,这种各因子对群落变异相对贡献比例的特征与增温主要通过改变水质和浮游植物特征,以间接作用影响细菌群落组成的观念一致。此外,细菌多样性和群落组成受不同环境因子的驱动。相比而言,空间距离只控制了较小比例的群落变异(7.1%)。此外,筛选到11个细菌科,这些科的相对丰度与增温幅度显著相关,变化特征与各科已知的生态功能相吻合,如海洋螺菌科(Oceanospirillaceae)中有些菌株能够降解石油污染物,其相对丰度在高油污浓度站点增加(油污浓度与增温幅度正相关,r=0.558;P=0.030);嗜温的弧菌科相对丰度与增温幅度正相关。综上,研究结果初步明确了浮游细菌群落对电厂温排水增温的响应特征,并筛选到敏感的细菌科来指示和预测增温对生态功能的潜在影响。
关键词
温排水
浮游细菌群落结构
空间分布
指示
细菌
科
Keywords
thermal discharge
bacterioplankton community structure
spatial distribution
bacterial bio-indicator family
分类号
Q938 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
浮游细菌群落结构及其与网箱养殖鱼病害的关系
陈鹤
李筱鑫
崔婧
蒙爱云
骆大鹏
刘庆明
邱名毅
涂志刚
《热带生物学报》
2023
0
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职称材料
2
渤海湾表层海水中浮游细菌群落随离岸距离的分布特征及其影响因素
赵维
王敬敬
徐松
李晴晴
杨榕
张小霞
黄志勇
《海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
8
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职称材料
3
象山港电厂温排水增温对浮游细菌群落空间分布的影响
陈梦齐
刘紫丹
戴文芳
叶仙森
梁新友
熊金波
《生态学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
15
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