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黄皮叶绿体基因组测序与分析被引量：3: 1; 作者赵志常高爱平 +1 位作者黄建峰罗睿雄《安徽农业科学》 CAS 2019年第11期115-118,共4页; [目的]分析黄皮[Clausena lansium(Lour.)Skeels)]叶绿体基因组,为黄皮属不同种或品种的进化、杂交、演变,以及黄皮不同品种的鉴定等提供技术支持。[方法]使用试剂盒提取了黄皮的叶绿体DNA,通过测序、组装、注释获得了黄皮叶绿体基因组... 展开更多; 关键词黄皮叶绿体基因组测序与分析; 在线阅读下载PDF 职称材料

霸王叶绿体基因组测序及结构分析被引量：2: 2; 作者李曼芝朱强 +1 位作者曾继娟牛锦凤《天津农业科学》 CAS 2021年第10期13-16,共4页; 为探索霸王植物叶绿体基因的系统进化,以银川植物园沙生植物种质资源库提供的霸王为试验材料,采用Illumina HiSeq X Ten测序系统对其叶绿体基因组DNA建库测序,借助近缘参考序列,得到霸王的叶绿体全基因组序列,并采用MEGA7软件通过邻接... 展开更多; 关键词霸王叶绿体基因组测序与分析; 在线阅读下载PDF 职称材料

六盘山鸡爪大黄叶绿体基因组特征分析: 3; 作者曾继娟杨雪 +4 位作者姚宁梁文裕曹荣荣王利霞朱强《种子》北大核心 2025年第4期136-142,共7页; 六盘山鸡爪大黄(Rheum tanguticum var.liupanshanense)是唐古特大黄的变种,仅分布于宁夏六盘山地区,为该地区的特有植物。采用Illumina HiSeq X Ten测序系统对六盘山鸡爪大黄叶绿体基因组DNA建库测序,借助近缘参考序列,通过最大似然法... 展开更多; 关键词六盘山鸡爪大黄叶绿体基因组测序与分析; 在线阅读下载PDF 职称材料

一株新城疫病毒分离株全基因组序列的克隆与分析被引量：1: 4; 作者魏雪涛李银 +1 位作者刘宇卓张敬峰《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2008年第2期159-163,共5页; 根据GenBank上所公布的新城疫病毒（NDV）的全基因组序列，设计了10对引物，运用RT-PCR方法获取了三黄鸡新城疫病毒（SHJ00株）全基因组序列，并对其进行了比较分析。结果表明：此株三黄鸡新城疫病毒（SHJ00）的全基因组序列由15192个... 展开更多; 关键词新城疫病毒全基因组测序与分析; 在线阅读下载PDF 职称材料

欧洲型PRRSVGD2023株的全长基因序列测定与分析: 5; 作者王紫荷吕丁丁 +5 位作者闫才杰韩峰李铎李玉博孙刘妹张振东《动物医学进展》 2025年第11期17-24,共8页; 为了解我国猪繁殖与呼吸综合征病毒1(PRRSV 1)的遗传变异与演化情况,试验使用分段引物对广东省一规模化猪场PRRSV 1的强阳性样品进行全长基因组的扩增、测序与拼接,并与国内外常见参考毒株进行了同源性比对及遗传演化分析。结果表明,GD2... 展开更多; 关键词猪繁殖与呼吸综合征病毒欧洲型全基因组测序与分析遗传与演化阅读框5; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名黄皮叶绿体基因组测序与分析被引量：3: 1; 作者赵志常高爱平黄建峰罗睿雄; 机构中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所/农业部华南作物基因资源与种质创制重点开发实验室国家热带果树品种改良中心; 出处《安徽农业科学》 CAS 2019年第11期115-118,共4页; 基金国家自然科学基金资助项目(31471850) 国家重点研发计划(2018YFD1000500) +1 种基金 1630032017004); 文摘 [目的]分析黄皮[Clausena lansium(Lour.)Skeels)]叶绿体基因组,为黄皮属不同种或品种的进化、杂交、演变,以及黄皮不同品种的鉴定等提供技术支持。[方法]使用试剂盒提取了黄皮的叶绿体DNA,通过测序、组装、注释获得了黄皮叶绿体基因组。[结果]黄皮叶绿体基因组全长159283bp,其中反相重复序列区(IRs)长53998bp,大单拷贝序列区(LSC)和小单拷贝序列区(SSC)长度分别为87301、17983bp,共注释126个基因,包括编码蛋白基因89个,tRNA基因29个和rRNA基因8个。黄皮叶绿体基因组全序列GC含量38.7%。对5种芸香科果树的全长序列、SSC、LSC、IRA、IRB进行比较分析发现,假黄皮的叶绿体全长序列、LSC、IRA、IRB区域的长度较其他4种果树长,柠檬的SSC区域长度最长,黄皮的全长序列和SSC区域长度最短。黄皮叶绿体的基因数目和编码蛋白数目较其他4种果树多。对20种园艺植物的叶绿体基因组进行分析发现,同一科下面的不同属植物或同一属下面的不同种更容易聚为一类。[结论]该研究丰富了热带果树的叶绿体基因组数据库,为种质资源的合理开发利用提供了依据。; 关键词黄皮叶绿体基因组测序与分析; Keywords Clausena lansium (Lour.)Skeels Chloroplast genome Sequencing and analysis; 分类号 S667.9 [农业科学—果树学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名霸王叶绿体基因组测序及结构分析被引量：2: 2; 作者李曼芝朱强曾继娟牛锦凤; 机构宁夏宁苗生态园林(集团)股份有限公司宁夏林业研究院股份有限公司种苗生物工程国家重点实验室宁夏国有林场和林木种苗工作总站; 出处《天津农业科学》 CAS 2021年第10期13-16,共4页; 基金宁夏回族自治区重点研发计划项目(2020BBF03001)。; 文摘为探索霸王植物叶绿体基因的系统进化,以银川植物园沙生植物种质资源库提供的霸王为试验材料,采用Illumina HiSeq X Ten测序系统对其叶绿体基因组DNA建库测序,借助近缘参考序列,得到霸王的叶绿体全基因组序列,并采用MEGA7软件通过邻接法基于叶绿体全基因组序列对牻牛儿苗科、蒺藜科共20个物种构建系统发育树。结果表明,霸王叶绿体基因组序列全长105349 bp,包括长单拷贝区79818 bp、短单拷贝区16955 bp和2个反向重复序列4288 bp,共编码97种基因,包括64种蛋白编码基因、29种tRNA基因和4种rRNA,检测到7种重复基因,包括4种蛋白质编码基因和3种tRNA;系统发育树中霸王与蒺藜科四合木的亲缘关系最近,与牻牛儿苗科老鹳草属、老鹳葵属亲缘关系较远。研究结果为进一步开展霸王植物资源的引种驯化提供参考依据。; 关键词霸王叶绿体基因组测序与分析; Keywords Zygophyllum xanthoxylum chloroplast genome sequencing and analysis; 分类号 Q941.2 [生物学—植物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名六盘山鸡爪大黄叶绿体基因组特征分析: 3; 作者曾继娟杨雪姚宁梁文裕曹荣荣王利霞朱强; 机构宁夏大学生命科学学院林木资源高效生产全国重点实验室六盘山林草局; 出处《种子》北大核心 2025年第4期136-142,共7页; 基金宁夏回族自治区重点研发计划(重点)项目“六盘山特色濒危中药材资源保护与开发利用关键技术研究与示范” “六盘山生物多样性调查项目”。; 文摘六盘山鸡爪大黄(Rheum tanguticum var.liupanshanense)是唐古特大黄的变种,仅分布于宁夏六盘山地区,为该地区的特有植物。采用Illumina HiSeq X Ten测序系统对六盘山鸡爪大黄叶绿体基因组DNA建库测序,借助近缘参考序列,通过最大似然法基于叶绿体全基因组序列对大黄属、酸模属共15个物种构建系统发育树。结果表明,叶绿体基因组序列全长161144 bp,包括1个长单拷贝区(LSC)86500 bp、1个短单拷贝区(SSC)12732 bp和2个反向重复序列(IR)30956 bp。叶绿体基因组编码的基因总数为112种,其中包含79种蛋白编码基因、29个tRNA基因以及4个rRNA。检测到18种基因含有内含子,其中16种含有1个内含子,2种含有2个内含子。六盘山鸡爪大黄与掌叶大黄、药用大黄的亲缘关系最近。; 关键词六盘山鸡爪大黄叶绿体基因组测序与分析; Keywords Rheum tanguticum var.liupanshanense chloroplast genome sequencing and analysis; 分类号 S567.239 [农业科学—中草药栽培] Q943 [生物学—植物学] Q949.36 [生物学—植物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名一株新城疫病毒分离株全基因组序列的克隆与分析被引量：1: 4; 作者魏雪涛李银刘宇卓张敬峰; 机构江苏省农业科学院兽医研究所; 出处《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2008年第2期159-163,共5页; 基金江浙沪长三角农业攻关项目(2005E60014); 文摘根据GenBank上所公布的新城疫病毒（NDV）的全基因组序列，设计了10对引物，运用RT-PCR方法获取了三黄鸡新城疫病毒（SHJ00株）全基因组序列，并对其进行了比较分析。结果表明：此株三黄鸡新城疫病毒（SHJ00）的全基因组序列由15192个碱基组成，在NP基因和P基因之间的非翻译区多了6个核苷酸ACACTC；与NDV一致，SHJ00基因由6个ORF组成，即3’-NP-P-M-F-HN-L-5’；测序后拼接的F基因长1672bp，包含完整的开放阅读框（1662bp），编码553个氨基酸，F蛋白裂解位点的氨基酸顺序为112^R-R-Q-K-R-F^117，具有强毒株序列特性；根据NDV基因分型标准，三黄鸡新城疫病毒SHJ00株归属基因Ⅶ型新城疫病毒；F基因与国内外NDV代表株的核苷酸同源性为80．9％～97．7％，其中与F48E9同源性为84．3％，与Lasota的同源性为82．0％；测序后拼接的HN基因长为1716bp，编码571个氨基酸，与国内外NDV代表株的核苷酸同源性为80．0％～98．1％，其中与F48E9同源性为84．5％，与Lasota的同源性为81．4％。; 关键词新城疫病毒全基因组测序与分析; Keywords Newcastle disease virus genome sequence cloning and characterization; 分类号 S858.31 [农业科学—临床兽医学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名欧洲型PRRSVGD2023株的全长基因序列测定与分析: 5; 作者王紫荷吕丁丁闫才杰韩峰李铎李玉博孙刘妹张振东; 机构江苏科技大学生物技术学院; 出处《动物医学进展》 2025年第11期17-24,共8页; 基金江苏省自然科学青年基金项目(BK20201005,BK20220647)。; 文摘为了解我国猪繁殖与呼吸综合征病毒1(PRRSV 1)的遗传变异与演化情况,试验使用分段引物对广东省一规模化猪场PRRSV 1的强阳性样品进行全长基因组的扩增、测序与拼接,并与国内外常见参考毒株进行了同源性比对及遗传演化分析。结果表明,GD2023全长基因组为14979 bp(不含poly A),与PRRSV 1及PRRSV 2经典毒株LV、VR2332核苷酸同源性分别为86.7%、60.6%,全长核苷酸遗传进化树分析显示与国内外PRRSV 1毒株处于大的分支,表明GD2023属于PRRSV 1。ORF5遗传进化树分析显示GD2023与PRRSV 1变异株Lena处于同一分支,与SL-01亲缘关系最近。对nsp2与GP5进行氨基酸序列比对分析,结果发现nsp2存在43个氨基酸的缺失(aa289、aa320-360和aa420),缺失模式为1+41+1;GP5蛋白的信号肽、潜在糖基化位点及中和表位均存在不同程度的变异。重组分析显示GD2023未发生任何重组。说明国内PRRSV 1正在发生不同程度的变异与演化,临床上需加强对该类型毒株的关注与监测。; 关键词猪繁殖与呼吸综合征病毒欧洲型全基因组测序与分析遗传与演化阅读框5; Keywords Porcine reproductive and respiratory syndrome virus European type Whole genome sequencing and analysis Genetics and evolution ORF5; 分类号 S852.651 [农业科学] S858.28 [农业科学—基础兽医学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	黄皮叶绿体基因组测序与分析	赵志常高爱平黄建峰罗睿雄	《安徽农业科学》 CAS	2019	3	在线阅读下载PDF 职称材料
2	霸王叶绿体基因组测序及结构分析	李曼芝朱强曾继娟牛锦凤	《天津农业科学》 CAS	2021	2	在线阅读下载PDF 职称材料
3	六盘山鸡爪大黄叶绿体基因组特征分析	曾继娟杨雪姚宁梁文裕曹荣荣王利霞朱强	《种子》北大核心	2025	0	在线阅读下载PDF 职称材料
4	一株新城疫病毒分离株全基因组序列的克隆与分析	魏雪涛李银刘宇卓张敬峰	《江苏农业学报》 CSCD 北大核心	2008	1	在线阅读下载PDF 职称材料
5	欧洲型PRRSVGD2023株的全长基因序列测定与分析	王紫荷吕丁丁闫才杰韩峰李铎李玉博孙刘妹张振东	《动物医学进展》	2025		在线阅读下载PDF 职称材料