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抗生素溶杆菌13-6次生代谢物Myxin对水稻条斑病菌活体转录组的影响
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作者 孟涵 魏方俊 +4 位作者 王博文 袁加升 彭梦林 刘学瑞 姬广海 《江苏农业科学》 北大核心 2024年第24期117-126,共10页
近年来,水稻细菌性条斑病已成为影响我国水稻产量的重要病害之一。探究抗生素溶杆菌13-6次生代谢物对水稻条斑病菌的影响,明确抗生素溶杆菌13-6次生代谢物对水稻细菌性条斑病的防病机制,对于实际生产具有重要意义。在水稻感病品种日本... 近年来,水稻细菌性条斑病已成为影响我国水稻产量的重要病害之一。探究抗生素溶杆菌13-6次生代谢物对水稻条斑病菌的影响,明确抗生素溶杆菌13-6次生代谢物对水稻细菌性条斑病的防病机制,对于实际生产具有重要意义。在水稻感病品种日本晴(4叶期)上接种条斑病菌YM15,48 h后用抗生素溶杆菌13-6次生代谢物(480μg/mL)处理,然后进行活体转录组测序分析、生物信息分析并进行qRT-PCR验证。结果表明,经抗生素溶杆菌13-6次生代谢物处理后,将处理组和对照组与参考基因组基因进行对比,共得到203个差异显著基因,上调基因125个,下调基因78个。随机挑选10个基因(上调6个,下调4个)进行qRT-PCR验证,qRT-PCR结果与RNA-Seq结果一致,证实转录组测序结果可靠。在GO功能富集中,差异基因主要集中在相应刺激和生物调控等过程;在KEGG功能富集中,差异基因主要集中在双组分系统等代谢通路。本研究发现,抗生素溶杆菌13-6次生代谢物可显著影响病原菌中与致病性相关的基因,如鞭毛合成相关基因和趋化性相关基因。此外,抗生素溶杆菌13-6次生代谢物还可影响KEGG代谢通路中与鞭毛组装相关的基因、双组分系统以及氨基酸代谢过程相关基因表达,为进一步阐明Myxin对水稻细菌性条斑病的作用靶点奠定了基础。 展开更多
关键词 水稻 细菌性条斑病 抗生素溶杆菌 次生代谢物 基因表达差异 活体转录组
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