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亲和分离在蛋白质泛素化修饰研究中的应用进展被引量：3: 1; 作者钟卉菲黄嫣嫣 +1 位作者金钰龙赵睿《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期26-33,共8页; 蛋白质泛素化是真核生物最普遍、最复杂的翻译后修饰方式之一,在细胞的信号转导、生长、发育、代谢等生命过程中发挥着重要作用。泛素化过程的失调则与神经退行性疾病、炎症反应、癌症等重大疾病的发生发展密切相关。分析和研究蛋白质... 展开更多; 关键词蛋白质泛素化亲和色谱抗体多肽; 在线阅读下载PDF 职称材料

人神经母细胞瘤的磷酸化膜蛋白质组分析被引量：2: 2; 作者侯春彦马俊锋 +3 位作者陶定银张丽华梁振张玉奎《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2011年第9期851-856,共6页; 针对人神经母细胞瘤SH-SY5Y细胞系的磷酸化膜蛋白质组,发展了基于多酶酶解法结合杂化硅胶基质固定化钛离子亲和色谱(Ti 4+-IMAC)整体柱富集的分析策略。该方法通过对细胞裂解液进行超速离心,以及1 mol/LNaCl和0.1 mol/L Na2CO3顺序清洗... 展开更多; 关键词人神经母细胞瘤磷酸化肽富集膜蛋白质多酶酶解固定化钛离子亲和色谱有机-无机杂化硅胶整体材料; 在线阅读下载PDF 职称材料

泛素化修饰组学技术及其在疾病研究中的应用: 3; 作者董继林李衍常徐平《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期320-331,共12页; 泛素化修饰作为真核细胞内主要的蛋白质翻译后修饰之一,通过泛素-蛋白酶体系统(UPS)介导了细胞内的蛋白质特异性降解,同时广泛参与并调控细胞内基因转录、信号传导、DNA损伤与修复、细胞周期调控、应激反应甚至个体的免疫应答等几乎所... 展开更多; 关键词泛素化泛素化修饰组学泛素化蛋白质/肽段富集质谱鉴定技术疾病; 在线阅读下载PDF 职称材料

去泛素酶复合体Ubp3/Bre5的制备及与Cdc48作用（英文）: 4; 作者苏文成吕操 +8 位作者时丽丽景晓飞盖园明张洁谭焕波王鹏举夏立新邹培建秦刚《深圳大学学报（理工版）》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第1期58-67,共10页; 泛素化是一种存在于真核细胞中与生理功能密切相关的蛋白修饰,泛素化与去泛素化处于动态调节过程中.Ubp3是与人USP10同源的酵母去泛素化酶,结合辅引子Bre5在细胞内发挥广泛作用.为研究该复合体的工作机制,制备重组蛋白复合体,在大肠杆... 展开更多; 关键词结合蛋白质 Ubp3去泛素化酶结合辅因子Bre5 ATP酶Cdc48 去泛素化复合体与谷光苷肽巯基转移酶沉淀试验直接相互作用; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名亲和分离在蛋白质泛素化修饰研究中的应用进展被引量：3: 1; 作者钟卉菲黄嫣嫣金钰龙赵睿; 机构北京分子科学国家研究中心中国科学院大学; 出处《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期26-33,共8页; 基金国家自然科学基金(91853103,21874141,21974143).; 文摘蛋白质泛素化是真核生物最普遍、最复杂的翻译后修饰方式之一,在细胞的信号转导、生长、发育、代谢等生命过程中发挥着重要作用。泛素化过程的失调则与神经退行性疾病、炎症反应、癌症等重大疾病的发生发展密切相关。分析和研究蛋白质泛素化的结构与功能,可望为认识生命、探索疾病调控内在规律和发现新的诊断策略提供重要信息。生命体系的高度复杂性,泛素化修饰位点、结构类型的多变和多样性,时空动态变化等特点给蛋白质泛素化分析研究带来了巨大的挑战。亲和分离以其高选择性成为泛素化蛋白质结构与功能研究的有力工具。免疫亲和分离法基于抗原-抗体相互作用,是最为经典的分离分析方法,已广泛应用于泛素化蛋白质或肽段的富集分离。源于天然泛素受体的泛素结合结构域(ubiquitin binding domains,UBDs)可与泛素或多聚泛素链相互作用。UBDs和基于此发展起来的串联泛素结合实体(tandem ubiquitin-binding entities,TUBEs)已成为蛋白质泛素化功能研究的热门识别分子。各种多肽类化合物的发展也为蛋白质泛素化的结构和功能解析提供新工具。此外,多种亲和识别配基的联合使用,在蛋白质泛素化修饰的高特异性、高灵敏度分析中展现了独特的优势,为认识生命体内的泛素化修饰提供了重要保障。该文对亲和分离方法在蛋白质泛素化修饰分析中的应用及进展进行了综述。; 关键词蛋白质泛素化亲和色谱抗体多肽; Keywords protein ubiquitination affinity chromatography(AFC) antibody peptide; 分类号 O658 [理学—分析化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名人神经母细胞瘤的磷酸化膜蛋白质组分析被引量：2: 2; 作者侯春彦马俊锋陶定银张丽华梁振张玉奎; 机构中国科学院大连化学物理研究所中国科学院研究生院; 出处《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2011年第9期851-856,共6页; 基金国家重大科学研究计划项目(2007CB914100) 国家自然科学基金项目(20935004) 科技部创新方法工作专项项目(2009IM031800); 文摘针对人神经母细胞瘤SH-SY5Y细胞系的磷酸化膜蛋白质组,发展了基于多酶酶解法结合杂化硅胶基质固定化钛离子亲和色谱(Ti 4+-IMAC)整体柱富集的分析策略。该方法通过对细胞裂解液进行超速离心,以及1 mol/LNaCl和0.1 mol/L Na2CO3顺序清洗,获得膜蛋白质组分。所提取的蛋白质分别经胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶和胃蛋白酶平行酶解,产生的肽段经Ti 4+-IMAC整体柱选择性富集磷酸肽后,采用纳升级反相液相色谱分离和质谱鉴定,成功鉴定到43个磷酸化蛋白质,其中有14个定位于膜上。研究结果表明,采用该策略开展SH-SY5Y细胞系磷酸化膜蛋白质组学分析有望加速对该肿瘤的研究和相关潜在标记物的筛选。; 关键词人神经母细胞瘤磷酸化肽富集膜蛋白质多酶酶解固定化钛离子亲和色谱有机-无机杂化硅胶整体材料; Keywords human neuroblastoma phosphopeptide enrichment membrane protein multi-enzyme digestion immobilized Ti4＋affinity chromatography organic-inorganic hybrid silica monolith; 分类号 O658 [理学—分析化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名泛素化修饰组学技术及其在疾病研究中的应用: 3; 作者董继林李衍常徐平; 机构河北大学生命科学学院军事科学院军事医学研究院生命组学研究所蛋白质组学国家重点实验室国家蛋白质科学中心(北京)北京蛋白质组研究中心中国医学科学院蛋白质组学与新药研发创新单元; 出处《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期320-331,共12页; 基金国家自然科学基金(No.32071431,No.31700723) 国家重点研发计划(No.2017YFC0906600,2017YFA0505000)资助。; 文摘泛素化修饰作为真核细胞内主要的蛋白质翻译后修饰之一,通过泛素-蛋白酶体系统(UPS)介导了细胞内的蛋白质特异性降解,同时广泛参与并调控细胞内基因转录、信号传导、DNA损伤与修复、细胞周期调控、应激反应甚至个体的免疫应答等几乎所有的生命活动过程。泛素-蛋白酶体系统的精确调控构成了稳定而复杂的泛素化信号网络,而其失调通常会造成癌症、神经退行性疾病、代谢性疾病等多种疾病的发生发展。近年来,基于质谱(MS)的蛋白质组学逐渐成熟,并极大促进了泛素化修饰研究的深度与广度。依托于泛素化蛋白质/肽段富集技术的发展以及高通量、高覆盖度和高灵敏度的质谱检测技术平台,蛋白质泛素化修饰组学也得以快速发展,并逐渐应用于人类生理、病理状态的泛素化蛋白质组研究和疾病发生发展的机制探索。本文主要综述了泛素化修饰组学研究中的泛素化蛋白质/肽段富集方法、质谱鉴定技术、定量标记技术和数据处理方法,同时对泛素化修饰组学技术在疾病研究中的应用也进行了系统分析,理清了当前存在的问题与挑战,为泛素化修饰蛋白质的发现与鉴定提供参考,为相关疾病治疗靶点的筛选和药物研发提供思路。; 关键词泛素化泛素化修饰组学泛素化蛋白质/肽段富集质谱鉴定技术疾病; Keywords ubiquitination ubiquitinomics ubiquitinated protein/peptide enrichment mass spectrometry identification technology diseases; 分类号 Q2 [生物学—细胞生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名去泛素酶复合体Ubp3/Bre5的制备及与Cdc48作用（英文）: 4; 作者苏文成吕操时丽丽景晓飞盖园明张洁谭焕波王鹏举夏立新邹培建秦刚; 机构天津工业技术大学生物技术学院中国科学院天津工业生物技术研究所天津药物研究院天津分子设计与药物发现重点实验室深圳大学医学部; 出处《深圳大学学报（理工版）》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第1期58-67,共10页; 基金 The Program of Tianjin Municipal Science&Technology Project(11ZCZDSY08100) The Program of“One Hundred Talented People”of the Chinese Academy of Sciences(KSCW2-YW-BR-4) National Natural Science Foundation of China(81273275)~~; 文摘泛素化是一种存在于真核细胞中与生理功能密切相关的蛋白修饰,泛素化与去泛素化处于动态调节过程中.Ubp3是与人USP10同源的酵母去泛素化酶,结合辅引子Bre5在细胞内发挥广泛作用.为研究该复合体的工作机制,制备重组蛋白复合体,在大肠杆菌中成功表达并纯化重组Ubp3与Bre5单体及Ubp3/Bre5复合体,首次成功大规模制备重组Ubp3/Bre5复合体.通过一系列pulldown实验,检验Ubp3/Bre5与AAA家族中泛素选择性ATP酶Cdc48的相互作用模式,结果发现,Ubp3及Bre5无法单独与Cdc48结合,但Ubp3/Bre5复合体可以有效与Cdc48相互作用.提出了Ubp3/Bre5-Cdc48相互作用的新模式,制备了高质量重组Ubp3/Bre5复合体.该研究为通过生化及结构生物学进行分子机制探索奠定了基础.; 关键词结合蛋白质 Ubp3去泛素化酶结合辅因子Bre5 ATP酶Cdc48 去泛素化复合体与谷光苷肽巯基转移酶沉淀试验直接相互作用; Keywords protein binding deubiquitinase Ubp3 cofactor Bre5 ATPase Cdc48 deubiquitinating complex GST-pulldown direct interaction; 分类号 Q513 [生物学—生物化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	亲和分离在蛋白质泛素化修饰研究中的应用进展	钟卉菲黄嫣嫣金钰龙赵睿	《色谱》 CAS CSCD 北大核心	2021	3	在线阅读下载PDF 职称材料
2	人神经母细胞瘤的磷酸化膜蛋白质组分析	侯春彦马俊锋陶定银张丽华梁振张玉奎	《色谱》 CAS CSCD 北大核心	2011	2	在线阅读下载PDF 职称材料
3	泛素化修饰组学技术及其在疾病研究中的应用	董继林李衍常徐平	《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心	2023	0	在线阅读下载PDF 职称材料
4	去泛素酶复合体Ubp3/Bre5的制备及与Cdc48作用（英文）	苏文成吕操时丽丽景晓飞盖园明张洁谭焕波王鹏举夏立新邹培建秦刚	《深圳大学学报（理工版）》 EI CAS CSCD 北大核心	2015	0	在线阅读下载PDF 职称材料