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青钱柳法呢基焦磷酸合成酶基因的克隆及功能研究
被引量：
3
1
作者
缪倩
曹小迎
+3 位作者
李长根
尹婷
李晓储
蒋继宏
《植物研究》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第3期323-329,共7页
青钱柳是集药用、材用和观赏等多种价值于一身的珍贵树种。法呢基焦磷酸合成酶(FPS)催化=牛儿基焦磷酸(GPP)与异戊烯基焦磷酸(IPP)缩合成法呢基焦磷酸(FPP),FPP是植物次生代谢产物倍半萜,三萜,甾醇等的前体。本研究通过RACE方法首次从...
青钱柳是集药用、材用和观赏等多种价值于一身的珍贵树种。法呢基焦磷酸合成酶(FPS)催化=牛儿基焦磷酸(GPP)与异戊烯基焦磷酸(IPP)缩合成法呢基焦磷酸(FPP),FPP是植物次生代谢产物倍半萜,三萜,甾醇等的前体。本研究通过RACE方法首次从青钱柳中扩增了法呢基焦磷酸合成酶的全长cDNA序列,序列命名为CpF-PS(Genbank登录号为GU121224),序列长度为1 420 bp,包含1 029 bp的开放阅读框,编码342个氨基酸残基,预测蛋白分子量为39.60 kDa。通过BlASTP分析,推断的青钱柳FPS蛋白序列与木本棉(Gossypium arboreum)(CAA72793.1)、橡胶树(Hevea brasiliensis)(BAF98301)等的FPS蛋白相似度较高。蛋白质保守区、特征区以及进化树分析初步证实扩增到的全长cDNA序列为青钱柳的FPS基因。将该基因连入酵母表达载体并转入麦角甾醇缺陷型酵母菌株CC25(MATa/MATalpha,deltaERG20/+),发现该基因可弥补营养缺陷使得CC25菌株在高温中正常生长,证明所得到的青钱柳CpFPS基因编码的蛋白是有功能的蛋白。
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关键词
青钱柳
法呢基焦磷酸合成酶
RACE
功能研究
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职称材料
植物法呢基焦磷酸合成酶的生物信息学分析
被引量：
14
2
作者
李嵘
王喆之
《热带亚热带植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第2期126-134,共9页
采用生物信息学的方法和工具对已在GenBank上注册的番茄(Lycopersicon esculentum)、橡胶(Hevea brasiliensis)、香蕉(Musa acuminata)、苹果(Malus×domestica)、向日葵(Helianthus annuus)、葡萄(Vitis vinifera)等的法呢基焦磷...
采用生物信息学的方法和工具对已在GenBank上注册的番茄(Lycopersicon esculentum)、橡胶(Hevea brasiliensis)、香蕉(Musa acuminata)、苹果(Malus×domestica)、向日葵(Helianthus annuus)、葡萄(Vitis vinifera)等的法呢基焦磷酸合成酶的核苷酸及氨基酸序列进行分析,并对其组成成分、转运肽、跨膜拓朴结构域、疏水性/亲水性、蛋白质二级及三级结构、分子系统进化关系等进行预测和推断。结果表明:该酶基因的全长包括5’、3’非翻译区和一个开放阅读框;其编码的蛋白是一个无跨膜结构域、不具转运肽的亲水性蛋白,包括5个保守的结构motif,其中两个是富含天冬氨酸(Asp)的motif,α-螺旋和不规则盘绕是蛋白质二级结构最大量的结构元件,β-转角和延伸链散布于整个蛋白质中,蛋白质的功能域在空间布局上是由α-螺旋围绕形成的中间具一个“大空穴”的立体结构,“大空穴”的表面藏有五个功能保守motif,其中两个Asp-motif位于“空穴”的内壁。
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关键词
植物萜类
合成
法呢基焦磷酸合成酶
生物信息学
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职称材料
洋常春藤法呢基焦磷酸合酶基因的克隆与序列分析
被引量：
5
3
作者
阮琴妹
曹雄军
+1 位作者
孙化鹏
钟晓红
《湖南农业大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第2期136-141,共6页
以洋常春藤叶片为材料,采用同源RT–PCR方法,克隆获得了洋常春藤法呢基焦磷酸合成酶基因,其c DNA序列大小为1 050 bp,开放阅读框为1 026 bp,推测编码342个氨基酸残基,该序列的核苷酸、氨基酸与五加科植物有同源性;用在线数据软件进行分...
以洋常春藤叶片为材料,采用同源RT–PCR方法,克隆获得了洋常春藤法呢基焦磷酸合成酶基因,其c DNA序列大小为1 050 bp,开放阅读框为1 026 bp,推测编码342个氨基酸残基,该序列的核苷酸、氨基酸与五加科植物有同源性;用在线数据软件进行分析,推测该蛋白可能存在于细胞质之中,定位在细胞膜外,FPS蛋白的相对分子质量为39 735.7;该蛋白含有2个天冬氨酸保守结构域,其二级结构主要以α螺旋和无规则卷曲为主;双子叶植物系统进化树分析结果表明,洋常春藤的FPS与刺五加、人参、三七、西洋参、辽东楤木的FPS亲缘关系最近,这一结果符合传统的分类法规则。
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关键词
洋常春藤
法呢基焦磷酸合成酶
同源性
五加科植物
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职称材料
题名
青钱柳法呢基焦磷酸合成酶基因的克隆及功能研究
被引量：
3
1
作者
缪倩
曹小迎
李长根
尹婷
李晓储
蒋继宏
机构
徐州师范大学江苏省药用植物生物技术重点实验室
出处
《植物研究》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第3期323-329,共7页
基金
"十一五"国家科技支撑计划项目(2006BAD03A0603)
徐州科技局项目(XZ2006221)
文摘
青钱柳是集药用、材用和观赏等多种价值于一身的珍贵树种。法呢基焦磷酸合成酶(FPS)催化=牛儿基焦磷酸(GPP)与异戊烯基焦磷酸(IPP)缩合成法呢基焦磷酸(FPP),FPP是植物次生代谢产物倍半萜,三萜,甾醇等的前体。本研究通过RACE方法首次从青钱柳中扩增了法呢基焦磷酸合成酶的全长cDNA序列,序列命名为CpF-PS(Genbank登录号为GU121224),序列长度为1 420 bp,包含1 029 bp的开放阅读框,编码342个氨基酸残基,预测蛋白分子量为39.60 kDa。通过BlASTP分析,推断的青钱柳FPS蛋白序列与木本棉(Gossypium arboreum)(CAA72793.1)、橡胶树(Hevea brasiliensis)(BAF98301)等的FPS蛋白相似度较高。蛋白质保守区、特征区以及进化树分析初步证实扩增到的全长cDNA序列为青钱柳的FPS基因。将该基因连入酵母表达载体并转入麦角甾醇缺陷型酵母菌株CC25(MATa/MATalpha,deltaERG20/+),发现该基因可弥补营养缺陷使得CC25菌株在高温中正常生长,证明所得到的青钱柳CpFPS基因编码的蛋白是有功能的蛋白。
关键词
青钱柳
法呢基焦磷酸合成酶
RACE
功能研究
Keywords
Cyclocarya paliurus
farnesyl diphosphate synthase（FPS）
RACE
functional analysis
分类号
S567.1 [农业科学—中草药栽培]
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职称材料
题名
植物法呢基焦磷酸合成酶的生物信息学分析
被引量：
14
2
作者
李嵘
王喆之
机构
陕西师范大学生命科学学院
出处
《热带亚热带植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第2期126-134,共9页
基金
国家"十五"科技攻关项目(2004BA721A35)资助
文摘
采用生物信息学的方法和工具对已在GenBank上注册的番茄(Lycopersicon esculentum)、橡胶(Hevea brasiliensis)、香蕉(Musa acuminata)、苹果(Malus×domestica)、向日葵(Helianthus annuus)、葡萄(Vitis vinifera)等的法呢基焦磷酸合成酶的核苷酸及氨基酸序列进行分析,并对其组成成分、转运肽、跨膜拓朴结构域、疏水性/亲水性、蛋白质二级及三级结构、分子系统进化关系等进行预测和推断。结果表明:该酶基因的全长包括5’、3’非翻译区和一个开放阅读框;其编码的蛋白是一个无跨膜结构域、不具转运肽的亲水性蛋白,包括5个保守的结构motif,其中两个是富含天冬氨酸(Asp)的motif,α-螺旋和不规则盘绕是蛋白质二级结构最大量的结构元件,β-转角和延伸链散布于整个蛋白质中,蛋白质的功能域在空间布局上是由α-螺旋围绕形成的中间具一个“大空穴”的立体结构,“大空穴”的表面藏有五个功能保守motif,其中两个Asp-motif位于“空穴”的内壁。
关键词
植物萜类
合成
法呢基焦磷酸合成酶
生物信息学
Keywords
Plant isoprenoid biosynthesis
Famesyl diphosphate synthase （FPPS）
Bioinformatics
分类号
Q946 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
洋常春藤法呢基焦磷酸合酶基因的克隆与序列分析
被引量：
5
3
作者
阮琴妹
曹雄军
孙化鹏
钟晓红
机构
湖南农业大学园艺园林学院
广西农业科学院葡萄与葡萄酒研究所
出处
《湖南农业大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第2期136-141,共6页
基金
湖南省研究生科研创新项目(CX2014B290)
湖南省教育厅科研项目(15A089)
文摘
以洋常春藤叶片为材料,采用同源RT–PCR方法,克隆获得了洋常春藤法呢基焦磷酸合成酶基因,其c DNA序列大小为1 050 bp,开放阅读框为1 026 bp,推测编码342个氨基酸残基,该序列的核苷酸、氨基酸与五加科植物有同源性;用在线数据软件进行分析,推测该蛋白可能存在于细胞质之中,定位在细胞膜外,FPS蛋白的相对分子质量为39 735.7;该蛋白含有2个天冬氨酸保守结构域,其二级结构主要以α螺旋和无规则卷曲为主;双子叶植物系统进化树分析结果表明,洋常春藤的FPS与刺五加、人参、三七、西洋参、辽东楤木的FPS亲缘关系最近,这一结果符合传统的分类法规则。
关键词
洋常春藤
法呢基焦磷酸合成酶
同源性
五加科植物
Keywords
Hedera helix
farnesyl pyrophosphate synthase
homology
Araliaceous plants
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
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被引量
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1
青钱柳法呢基焦磷酸合成酶基因的克隆及功能研究
缪倩
曹小迎
李长根
尹婷
李晓储
蒋继宏
《植物研究》
CAS
CSCD
北大核心
2011
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
植物法呢基焦磷酸合成酶的生物信息学分析
李嵘
王喆之
《热带亚热带植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007
14
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
洋常春藤法呢基焦磷酸合酶基因的克隆与序列分析
阮琴妹
曹雄军
孙化鹏
钟晓红
《湖南农业大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2016
5
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职称材料
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