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基于线粒体COⅠ和COⅡ基因的沙果小食心虫与梨小食心虫的分子鉴定
被引量：
7
1
作者
王康
李玉婷
+4 位作者
郑燕
段辛乐
张蒙
彭雄
陈茂华
《西北农林科技大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2016年第2期156-164,共9页
【目的】建立基于线粒体COⅠ和COⅡ基因序列的沙果小食心虫、梨小食心虫分子鉴定方法。【方法】田间采集试虫,利用PCR和基因测序技术,扩增2种食心虫的线粒体COⅠ和COⅡ基因,将获得的COⅠ和COⅡ基因序列在GenBank中进行BLAST比对,并通过G...
【目的】建立基于线粒体COⅠ和COⅡ基因序列的沙果小食心虫、梨小食心虫分子鉴定方法。【方法】田间采集试虫,利用PCR和基因测序技术,扩增2种食心虫的线粒体COⅠ和COⅡ基因,将获得的COⅠ和COⅡ基因序列在GenBank中进行BLAST比对,并通过GeneDoc软件分析基因序列相似性,利用Mega 5.05软件分别计算基于COⅠ和COⅡ基因序列的遗传距离,并分别构建COⅠ和COⅡ基因的系统发育树。【结果】在分析的2种食心虫样本中,沙果小食心虫COⅠ基因的种内相似度在99.4%以上,梨小食心虫COⅠ基因的种内相似度在99.6%以上,2种食心虫COⅠ基因的种间相似度为95.0%-95.6%;沙果小食心虫COⅡ基因的种内相似度在99.0%以上,梨小食心虫COⅡ基因的种内相似度在99.3%以上,2种食心虫COⅡ基因的种间相似度为94.6%-95.5%;2种食心虫COⅠ基因种间存在30个稳定变异位点,COⅡ基因种间有26个稳定变异位点。2种食心虫种内遗传距离为0.001-0.006（COⅠ）和0.001-0.010（COⅡ）,种间遗传距离为0.046-0.052（COⅠ）和0.047-0.057（COⅡ）,基于COⅠ和COⅡ基因的种间遗传距离均显著大于种内遗传距离。分别构建COⅠ和COⅡ基因单倍型的系统发育树,结果显示,在2个基因的系统发育树上,2种食心虫的基因序列分别位于不同的进化支,且置信度均达到100%,同种食心虫的基因序列位于相同的进化枝。【结论】可以根据本研究所用的COⅠ和COⅡ基因序列的差异性,进行沙果小食心虫和梨小食心虫的分子鉴定。
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关键词
沙果小食心虫
梨
小食心虫
COⅠ基因
COⅡ基因
单倍型
分子鉴定
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职称材料
我国果树一新害虫──沙果小食心虫
被引量：
1
2
作者
严善春
刘友樵
李明文
《森林病虫通讯》
北大核心
1999年第4期15-16,共2页
沙果小食心虫Ｇｒａｐｈｏｌｉｔａ ｄｉｍ ｏｒｐｈａ Ｋｏｍ ａｉ危害沙果、李子和山里红的果实，为我国新记录种。文中描述了该种的形态特征及其与相似种梨小食心虫Ｇ．ｍ ｏｌｅｓｔａ（Ｂｕｓｃｋ）在形态及生物学特性上的区别。
关键词
沙果小食心虫
鳞翅目
卷蛾科
新记录种
中国
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职称材料
题名
基于线粒体COⅠ和COⅡ基因的沙果小食心虫与梨小食心虫的分子鉴定
被引量：
7
1
作者
王康
李玉婷
郑燕
段辛乐
张蒙
彭雄
陈茂华
机构
西北农林科技大学植物保护学院
出处
《西北农林科技大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2016年第2期156-164,共9页
基金
国家自然科学基金项目(31071687)
教育部高等学校博士学科点专项科研基金(博导类)项目(20110204110001)
+1 种基金
西北农林科技大学人才引进项目
国家科技支撑计划项目(2012BAK11B03)
文摘
【目的】建立基于线粒体COⅠ和COⅡ基因序列的沙果小食心虫、梨小食心虫分子鉴定方法。【方法】田间采集试虫,利用PCR和基因测序技术,扩增2种食心虫的线粒体COⅠ和COⅡ基因,将获得的COⅠ和COⅡ基因序列在GenBank中进行BLAST比对,并通过GeneDoc软件分析基因序列相似性,利用Mega 5.05软件分别计算基于COⅠ和COⅡ基因序列的遗传距离,并分别构建COⅠ和COⅡ基因的系统发育树。【结果】在分析的2种食心虫样本中,沙果小食心虫COⅠ基因的种内相似度在99.4%以上,梨小食心虫COⅠ基因的种内相似度在99.6%以上,2种食心虫COⅠ基因的种间相似度为95.0%-95.6%;沙果小食心虫COⅡ基因的种内相似度在99.0%以上,梨小食心虫COⅡ基因的种内相似度在99.3%以上,2种食心虫COⅡ基因的种间相似度为94.6%-95.5%;2种食心虫COⅠ基因种间存在30个稳定变异位点,COⅡ基因种间有26个稳定变异位点。2种食心虫种内遗传距离为0.001-0.006（COⅠ）和0.001-0.010（COⅡ）,种间遗传距离为0.046-0.052（COⅠ）和0.047-0.057（COⅡ）,基于COⅠ和COⅡ基因的种间遗传距离均显著大于种内遗传距离。分别构建COⅠ和COⅡ基因单倍型的系统发育树,结果显示,在2个基因的系统发育树上,2种食心虫的基因序列分别位于不同的进化支,且置信度均达到100%,同种食心虫的基因序列位于相同的进化枝。【结论】可以根据本研究所用的COⅠ和COⅡ基因序列的差异性,进行沙果小食心虫和梨小食心虫的分子鉴定。
关键词
沙果小食心虫
梨
小食心虫
COⅠ基因
COⅡ基因
单倍型
分子鉴定
Keywords
Grapholita dimorpha
Grapholita molesta
COⅠ gene
COⅡ gene
haplotypes
molecular identification
分类号
S763.42 [农业科学—森林保护学]
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
我国果树一新害虫──沙果小食心虫
被引量：
1
2
作者
严善春
刘友樵
李明文
机构
东北林业大学
中国科学院动物研究所
黑龙江省黑河市森林病虫防治检疫站
出处
《森林病虫通讯》
北大核心
1999年第4期15-16,共2页
基金
哈尔滨市青年科学基金
文摘
沙果小食心虫Ｇｒａｐｈｏｌｉｔａ ｄｉｍ ｏｒｐｈａ Ｋｏｍ ａｉ危害沙果、李子和山里红的果实，为我国新记录种。文中描述了该种的形态特征及其与相似种梨小食心虫Ｇ．ｍ ｏｌｅｓｔａ（Ｂｕｓｃｋ）在形态及生物学特性上的区别。
关键词
沙果小食心虫
鳞翅目
卷蛾科
新记录种
中国
Keywords
Grapholita dimorpha Komai, Lepidoptera, Tortricidae, new record,China
分类号
Q969.429.2 [生物学—昆虫学]
S436.6 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于线粒体COⅠ和COⅡ基因的沙果小食心虫与梨小食心虫的分子鉴定
王康
李玉婷
郑燕
段辛乐
张蒙
彭雄
陈茂华
《西北农林科技大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2016
7
在线阅读
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职称材料
2
我国果树一新害虫──沙果小食心虫
严善春
刘友樵
李明文
《森林病虫通讯》
北大核心
1999
1
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