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水稻斑点叶突变体spl101和spl102的筛选及候选基因鉴定
被引量：
2
1
作者
韩晓斌
徐冉
+3 位作者
段朋根
于海跃
罗越华
李云海
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第4期346-353,共8页
斑点叶突变体是指植物在正常生长条件下叶片或叶鞘上自发形成、且与病原菌侵染产生的病斑类似的一类突变体,筛选并研究斑点叶突变体对揭示植物抗病反应机理具有重要意义。为了进一步研究斑点叶的形成机制,本文通过EMS诱变品种宽叶粳(KY...
斑点叶突变体是指植物在正常生长条件下叶片或叶鞘上自发形成、且与病原菌侵染产生的病斑类似的一类突变体,筛选并研究斑点叶突变体对揭示植物抗病反应机理具有重要意义。为了进一步研究斑点叶的形成机制,本文通过EMS诱变品种宽叶粳(KYJ),筛选得到两个斑点叶突变体spl101和spl102。这两个突变体在生长发育晚期(抽穗期以后)形成严重的类病斑。遗传分析表明,spl101和spl102均受隐性单基因控制。利用Mutmap方法对候选基因进行克隆,结果显示,spl101和spl102的候选基因均为OsEDR1,该基因与类病斑发生有关。在spl101中,OsEDR1基因突变发生在第6外显子和第6内含子的交接处,该突变导致第6内含子的错误识别,最终造成移码突变。在spl102中,OsEDR1基因突变发生在第10外显子上,导致一个苯丙氨酸(F)变成半胖氨酸(C)。因此,本研究鉴定了两个新的OsEDR1等位突变,对OsEDR1抗病反应机理的进一步研究及丰富水稻种质资源具有积极意义。同时验证了利用Mutmap方法克隆水稻突变基因的有效性。
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关键词
水稻斑点叶突变体
Mutmap
OsEDR1
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职称材料
基于分子标记和高通量测序的基因精细定位
被引量：
3
2
作者
王茂辉
钟春燕
+4 位作者
罗文龙
聂金泉
郭涛
王慧
陈志强
《广东农业科学》
CAS
2018年第10期1-8,173,共9页
水稻斑点叶突变体Spl34是自然获得的突变体,在研究其形态学和生理生化等方面的基础上,利用粳稻Francis和Spl34杂交构建F_2基因定位群体进行精细定位研究,遗传分析表明Spl34的斑点叶表型受单个显性基因Spl34(t)调控;利用SSR/InDel标记对...
水稻斑点叶突变体Spl34是自然获得的突变体,在研究其形态学和生理生化等方面的基础上,利用粳稻Francis和Spl34杂交构建F_2基因定位群体进行精细定位研究,遗传分析表明Spl34的斑点叶表型受单个显性基因Spl34(t)调控;利用SSR/InDel标记对无斑点叶隐性单株进行连锁分析,将Spl34(t)精细定位于第11号染色体23.483～23.530 Mb之间,定位区间长度为46.99 kb,筛选出8个候选基因。另外,利用高通量测序技术对F_2(Francis/Spl34)有斑点个体混合池、无斑点个体混合池以及双亲进行重测序,利用基因组SNP对有斑点和无斑点混合池进行关联分析,将Spl34(t)定位于第11号染色体23.223～23.791 Mb之间,区间大小约568 kb;进一步利用单分子测序技术对Spl34突变体进行测序,通过从头组装、关联分析,在两个重叠群tig00001409和tig00003011检测到紧密连锁。通过对两个重叠群之间序列进行Sanger测序并产生的新重叠群长度达到233.95 kb,其中Spl34(t)定位区间大小约40 kb。将斑点叶基因Spl34(t)精细定位于第11号染色体约40 kb的区间,为进一步开展该基因的功能研究奠定了良好基础。
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关键词
水稻斑点叶突变体
分子标记
高通量测序
基因定位
序列比对
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职称材料
题名
水稻斑点叶突变体spl101和spl102的筛选及候选基因鉴定
被引量：
2
1
作者
韩晓斌
徐冉
段朋根
于海跃
罗越华
李云海
机构
海南大学农学院海南省热带生物资源可持续利用重点实验室
中国科学院遗传与发育生物学研究所植物细胞与染色体工程国家重点实验室
中国科学院大学
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第4期346-353,共8页
基金
植物细胞与染色体工程国家重点实验室自主研究课题~~
文摘
斑点叶突变体是指植物在正常生长条件下叶片或叶鞘上自发形成、且与病原菌侵染产生的病斑类似的一类突变体,筛选并研究斑点叶突变体对揭示植物抗病反应机理具有重要意义。为了进一步研究斑点叶的形成机制,本文通过EMS诱变品种宽叶粳(KYJ),筛选得到两个斑点叶突变体spl101和spl102。这两个突变体在生长发育晚期(抽穗期以后)形成严重的类病斑。遗传分析表明,spl101和spl102均受隐性单基因控制。利用Mutmap方法对候选基因进行克隆,结果显示,spl101和spl102的候选基因均为OsEDR1,该基因与类病斑发生有关。在spl101中,OsEDR1基因突变发生在第6外显子和第6内含子的交接处,该突变导致第6内含子的错误识别,最终造成移码突变。在spl102中,OsEDR1基因突变发生在第10外显子上,导致一个苯丙氨酸(F)变成半胖氨酸(C)。因此,本研究鉴定了两个新的OsEDR1等位突变,对OsEDR1抗病反应机理的进一步研究及丰富水稻种质资源具有积极意义。同时验证了利用Mutmap方法克隆水稻突变基因的有效性。
关键词
水稻斑点叶突变体
Mutmap
OsEDR1
Keywords
rice spotted-leaf mutant
Mutmap
OsEDR1
分类号
S511 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
基于分子标记和高通量测序的基因精细定位
被引量：
3
2
作者
王茂辉
钟春燕
罗文龙
聂金泉
郭涛
王慧
陈志强
机构
肇庆市农业科学研究所
华南农业大学国家植物航天育种工程技术研究中心
广东省农业科学院蔬菜研究所
出处
《广东农业科学》
CAS
2018年第10期1-8,173,共9页
基金
国家重点研发计划项目(2016YFD0102102)
国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-01-12)
文摘
水稻斑点叶突变体Spl34是自然获得的突变体,在研究其形态学和生理生化等方面的基础上,利用粳稻Francis和Spl34杂交构建F_2基因定位群体进行精细定位研究,遗传分析表明Spl34的斑点叶表型受单个显性基因Spl34(t)调控;利用SSR/InDel标记对无斑点叶隐性单株进行连锁分析,将Spl34(t)精细定位于第11号染色体23.483～23.530 Mb之间,定位区间长度为46.99 kb,筛选出8个候选基因。另外,利用高通量测序技术对F_2(Francis/Spl34)有斑点个体混合池、无斑点个体混合池以及双亲进行重测序,利用基因组SNP对有斑点和无斑点混合池进行关联分析,将Spl34(t)定位于第11号染色体23.223～23.791 Mb之间,区间大小约568 kb;进一步利用单分子测序技术对Spl34突变体进行测序,通过从头组装、关联分析,在两个重叠群tig00001409和tig00003011检测到紧密连锁。通过对两个重叠群之间序列进行Sanger测序并产生的新重叠群长度达到233.95 kb,其中Spl34(t)定位区间大小约40 kb。将斑点叶基因Spl34(t)精细定位于第11号染色体约40 kb的区间,为进一步开展该基因的功能研究奠定了良好基础。
关键词
水稻斑点叶突变体
分子标记
高通量测序
基因定位
序列比对
Keywords
rice spotted leaf mutant
molecular markers
high-throughput sequencing
gene mapping
sequence alignment
分类号
S511.01 [农业科学—作物学]
Q343.17 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
水稻斑点叶突变体spl101和spl102的筛选及候选基因鉴定
韩晓斌
徐冉
段朋根
于海跃
罗越华
李云海
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2017
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
基于分子标记和高通量测序的基因精细定位
王茂辉
钟春燕
罗文龙
聂金泉
郭涛
王慧
陈志强
《广东农业科学》
CAS
2018
3
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职称材料
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