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豉甲科及水生肉食亚目的分子系统发育学分析(昆虫纲：鞘翅目)
被引量：
3
1
作者
习欠云
邓日强
+2 位作者
王瑾雯
贾凤龙
王珣章
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第2期166-181,共16页
利用PAUP和MrBayes软件,对线粒体COⅠ基因序列3个密码子位置的数据模块分别进行了豉甲科（Gyrinidae）和水生肉食亚目（Hydradephaga）在亚科或科水平上的系统发育学分析,结果表明第二密码子数据模块获得了理想的分析结果。由PAUP生成...
利用PAUP和MrBayes软件,对线粒体COⅠ基因序列3个密码子位置的数据模块分别进行了豉甲科（Gyrinidae）和水生肉食亚目（Hydradephaga）在亚科或科水平上的系统发育学分析,结果表明第二密码子数据模块获得了理想的分析结果。由PAUP生成的豉甲科最优树来自第二密码子数据模块的分析,而由MrBayes生成的最优树来自全部密码子数据模块的分析。此外,用对应的氨基酸序列生成的ME和MP树与第二密码子数据模块分析的结果也一致。亚科Orectochilinae和Gyrininae以高的支持率形成了单系。然而,来自亚科Enhydrinae的种Porrorhynchus landaisi landaisi呈现了异常的位置。SH-test检验也支持该异常位置,表明这个种可能代表了一个科。在来自第二密码子数据模块的水生肉食亚目最优ML树中,整个Hydradephaga树呈现单系,豉甲科位于树的基部,表明了该科在水生肉食亚目中是一个早期的分支。在树中还产生了一个单系的Dytiscoidea总科,由Dytiscidae、Hygrobiidae、Noteridae和Amphizoidae 4个科组成,单系的Haliplidae与之成为姐妹群。此外线粒体分子钟的结果表明豉甲科的5对相近种间的分化是一个短时期内发生的（0.01~1.81百万年前）,这点可能与它们的特殊地理分布有关。
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关键词
豉甲科
线粒体COⅠ基因
系统发育学
水生肉食亚目
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职称材料
位点特异性频率模型在昆虫分子系统发育分析中的应用
2
作者
习欠云
杨洁
+5 位作者
邓日强
王瑾雯
贾凤龙
张永亮
江青艳
王珣章
《中山大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第5期78-82,共5页
根据位点特异性频率模型(site-specific rate model),利用PAUP软件,对线粒体COI基因序列不同密码子位点的数据模块分别进行了豉甲科和水生肉食亚目在亚科或科水平上的系统发育学分析,结果表明第二密码子数据模块获得的系统分析结果与形...
根据位点特异性频率模型(site-specific rate model),利用PAUP软件,对线粒体COI基因序列不同密码子位点的数据模块分别进行了豉甲科和水生肉食亚目在亚科或科水平上的系统发育学分析,结果表明第二密码子数据模块获得的系统分析结果与形态学分析结果一致。表明位点特异性频率模型在线粒体COI基因作为标记来进行昆虫分子系统发育分析上获得了更好的效果。
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关键词
位点特异性频率模型
豉甲科
线粒体COI基因
系统发育
水生肉食亚目
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职称材料
题名
豉甲科及水生肉食亚目的分子系统发育学分析(昆虫纲：鞘翅目)
被引量：
3
1
作者
习欠云
邓日强
王瑾雯
贾凤龙
王珣章
机构
中山大学生命科学学院
出处
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第2期166-181,共16页
基金
The Natural Science Foundation of Guangdong Province under GrantO4009785
文摘
利用PAUP和MrBayes软件,对线粒体COⅠ基因序列3个密码子位置的数据模块分别进行了豉甲科（Gyrinidae）和水生肉食亚目（Hydradephaga）在亚科或科水平上的系统发育学分析,结果表明第二密码子数据模块获得了理想的分析结果。由PAUP生成的豉甲科最优树来自第二密码子数据模块的分析,而由MrBayes生成的最优树来自全部密码子数据模块的分析。此外,用对应的氨基酸序列生成的ME和MP树与第二密码子数据模块分析的结果也一致。亚科Orectochilinae和Gyrininae以高的支持率形成了单系。然而,来自亚科Enhydrinae的种Porrorhynchus landaisi landaisi呈现了异常的位置。SH-test检验也支持该异常位置,表明这个种可能代表了一个科。在来自第二密码子数据模块的水生肉食亚目最优ML树中,整个Hydradephaga树呈现单系,豉甲科位于树的基部,表明了该科在水生肉食亚目中是一个早期的分支。在树中还产生了一个单系的Dytiscoidea总科,由Dytiscidae、Hygrobiidae、Noteridae和Amphizoidae 4个科组成,单系的Haliplidae与之成为姐妹群。此外线粒体分子钟的结果表明豉甲科的5对相近种间的分化是一个短时期内发生的（0.01~1.81百万年前）,这点可能与它们的特殊地理分布有关。
关键词
豉甲科
线粒体COⅠ基因
系统发育学
水生肉食亚目
Keywords
Gyrinidae
mitochondrial COⅠ gene
phylogenetic relationship
Hydradephaga
分类号
Q959.722 [生物学—动物学]
TU545 [建筑科学—建筑技术科学]
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职称材料
题名
位点特异性频率模型在昆虫分子系统发育分析中的应用
2
作者
习欠云
杨洁
邓日强
王瑾雯
贾凤龙
张永亮
江青艳
王珣章
机构
中山大学生命科学学院
华南农业大学动物科学学院
出处
《中山大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第5期78-82,共5页
基金
广东省自然科学基金资助项目(04009785)
文摘
根据位点特异性频率模型(site-specific rate model),利用PAUP软件,对线粒体COI基因序列不同密码子位点的数据模块分别进行了豉甲科和水生肉食亚目在亚科或科水平上的系统发育学分析,结果表明第二密码子数据模块获得的系统分析结果与形态学分析结果一致。表明位点特异性频率模型在线粒体COI基因作为标记来进行昆虫分子系统发育分析上获得了更好的效果。
关键词
位点特异性频率模型
豉甲科
线粒体COI基因
系统发育
水生肉食亚目
Keywords
site-specific rate model
Gyrinidae
mitochondrial COI gene
phylogenetic relationship
Hydradephaga
分类号
Q349.5 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
豉甲科及水生肉食亚目的分子系统发育学分析(昆虫纲：鞘翅目)
习欠云
邓日强
王瑾雯
贾凤龙
王珣章
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
位点特异性频率模型在昆虫分子系统发育分析中的应用
习欠云
杨洁
邓日强
王瑾雯
贾凤龙
张永亮
江青艳
王珣章
《中山大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2007
0
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