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嗜盐古菌中氯视紫红质基因序列的遗传分析
被引量：
1
1
作者
时晗
吴敏
+1 位作者
许学伟
周祯
《浙江大学学报（理学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第1期80-86,共7页
采用PCR方法扩增了嗜盐古菌AB19、AB30和AJ5编码螺旋C至螺旋G的氯视紫红质(halorhodopsin,HR)蛋白基因片断和16S rRNA基因(16S rDNA),测定了它们的核苷酸序列,与已报道的hr基因序列差异显著.获得AJ5 HR蛋白基因序列在Halobiforma属中尚...
采用PCR方法扩增了嗜盐古菌AB19、AB30和AJ5编码螺旋C至螺旋G的氯视紫红质(halorhodopsin,HR)蛋白基因片断和16S rRNA基因(16S rDNA),测定了它们的核苷酸序列,与已报道的hr基因序列差异显著.获得AJ5 HR蛋白基因序列在Halobiforma属中尚属首次.对hr基因序列进行的遗传分析,包括GC含量、转换与颠换的比值、密码子使用偏好,表明hr基因面临进化选择和偏倚突变压的双重制约,是一类进化程度较高的基因.对比br基因编码蛋白螺旋C到G的序列发现它们具有相似的种属特征.采用BR和HR蛋白螺旋C到G序列构建系统发生树比传统的16S rDNA序列具有优势,BR和HR可以作为两种新型的分子指标.
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关键词
嗜盐古菌
氯视紫红质
细菌
视
紫红
质
遗传分析
16S
RDNA
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职称材料
题名
嗜盐古菌中氯视紫红质基因序列的遗传分析
被引量：
1
1
作者
时晗
吴敏
许学伟
周祯
机构
浙江大学生命科学学院
出处
《浙江大学学报（理学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第1期80-86,共7页
基金
国家重点基础研究发展规划项目子项目(973.2004CB719604-3)
中国博士后科学基金(2005048636)
文摘
采用PCR方法扩增了嗜盐古菌AB19、AB30和AJ5编码螺旋C至螺旋G的氯视紫红质(halorhodopsin,HR)蛋白基因片断和16S rRNA基因(16S rDNA),测定了它们的核苷酸序列,与已报道的hr基因序列差异显著.获得AJ5 HR蛋白基因序列在Halobiforma属中尚属首次.对hr基因序列进行的遗传分析,包括GC含量、转换与颠换的比值、密码子使用偏好,表明hr基因面临进化选择和偏倚突变压的双重制约,是一类进化程度较高的基因.对比br基因编码蛋白螺旋C到G的序列发现它们具有相似的种属特征.采用BR和HR蛋白螺旋C到G序列构建系统发生树比传统的16S rDNA序列具有优势,BR和HR可以作为两种新型的分子指标.
关键词
嗜盐古菌
氯视紫红质
细菌
视
紫红
质
遗传分析
16S
RDNA
Keywords
halophilic archaea
halorhodopsin, bacteriorhodopsin
genetic analysis
16S rDNA
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
Q93 [生物学—微生物学]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
嗜盐古菌中氯视紫红质基因序列的遗传分析
时晗
吴敏
许学伟
周祯
《浙江大学学报（理学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2008
1
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