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基于细菌同源蛋白预测细菌最适生长温度的研究
被引量：
1
1
作者
丛华剑
武栓虎
+2 位作者
田健
初晓宇
伍宁丰
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第3期155-165,共11页
不同细菌有不同的最适生长温度,而基因序列与其最适生长温度密切相关。为探究其相关性,选取92个具有不同最适生长温度的细菌的全基因组序列为研究材料,通过寻找92个细菌共有的同源蛋白,并计算共有同源蛋白中氨基酸的频率,发现共有同源...
不同细菌有不同的最适生长温度,而基因序列与其最适生长温度密切相关。为探究其相关性,选取92个具有不同最适生长温度的细菌的全基因组序列为研究材料,通过寻找92个细菌共有的同源蛋白,并计算共有同源蛋白中氨基酸的频率,发现共有同源蛋白的氨基酸频率特征与其最适生长温度存在着显著的相关关系,其中蛋白质序列中的螺旋结构与其最适生长温度关系最大。该研究为揭示细菌对温度的适应机制,以及对蛋白质稳定性相关的分子设计具有重要的意义。
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关键词
细菌
最适生长温度
同源蛋白
氨基酸频率
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职称材料
题名
基于细菌同源蛋白预测细菌最适生长温度的研究
被引量：
1
1
作者
丛华剑
武栓虎
田健
初晓宇
伍宁丰
机构
烟台大学
中国农业科学院生物技术研究所
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第3期155-165,共11页
基金
国家自然科学基金项目(31371748)
文摘
不同细菌有不同的最适生长温度,而基因序列与其最适生长温度密切相关。为探究其相关性,选取92个具有不同最适生长温度的细菌的全基因组序列为研究材料,通过寻找92个细菌共有的同源蛋白,并计算共有同源蛋白中氨基酸的频率,发现共有同源蛋白的氨基酸频率特征与其最适生长温度存在着显著的相关关系,其中蛋白质序列中的螺旋结构与其最适生长温度关系最大。该研究为揭示细菌对温度的适应机制,以及对蛋白质稳定性相关的分子设计具有重要的意义。
关键词
细菌
最适生长温度
同源蛋白
氨基酸频率
Keywords
bacterium
optimal growth temperature
homologous protein
amino acid frequency
分类号
Q93 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于细菌同源蛋白预测细菌最适生长温度的研究
丛华剑
武栓虎
田健
初晓宇
伍宁丰
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
1
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