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抗原肽与MHC分子相互作用的QSAR模型研究
被引量：
9
1
作者
宋哲
刘涛
+2 位作者
刘伟
朱鸣华
王晓钢
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2007年第2期198-205,共8页
分别采用氨基酸序列及氨基酸结构描述符方法定量研究了短肽-MHC(majorhistocompatibilitycomplex)分子结合亲合力的定量构效关系(QSAR)模型,用这两个模型对短肽与HLA-A*0201分子结合的805个预测样本进行了预测,预测准确度分别达到66.8%...
分别采用氨基酸序列及氨基酸结构描述符方法定量研究了短肽-MHC(majorhistocompatibilitycomplex)分子结合亲合力的定量构效关系(QSAR)模型,用这两个模型对短肽与HLA-A*0201分子结合的805个预测样本进行了预测,预测准确度分别达到66.8%和65.5%.采用了去除“劣点”方法检验模型的鲁棒性,结果证明两个模型都具有良好的鲁棒性.通过改变两个模型的参数,对氨基酸残基个数为8或10的CTL(cytotoxicyTlymphocyte)表位进行预测.
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关键词
CTL表位
氨基酸结构描述符
定量构效关系
偏最小二乘法
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职称材料
题名
抗原肽与MHC分子相互作用的QSAR模型研究
被引量：
9
1
作者
宋哲
刘涛
刘伟
朱鸣华
王晓钢
机构
大连理工大学物理系大连理工大学高科技研究院
出处
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2007年第2期198-205,共8页
文摘
分别采用氨基酸序列及氨基酸结构描述符方法定量研究了短肽-MHC(majorhistocompatibilitycomplex)分子结合亲合力的定量构效关系(QSAR)模型,用这两个模型对短肽与HLA-A*0201分子结合的805个预测样本进行了预测,预测准确度分别达到66.8%和65.5%.采用了去除“劣点”方法检验模型的鲁棒性,结果证明两个模型都具有良好的鲁棒性.通过改变两个模型的参数,对氨基酸残基个数为8或10的CTL(cytotoxicyTlymphocyte)表位进行预测.
关键词
CTL表位
氨基酸结构描述符
定量构效关系
偏最小二乘法
Keywords
CTL epitopes
Amino acid structure descriptors
QSAR
Partial least squares method
分类号
R392 [医药卫生—免疫学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
抗原肽与MHC分子相互作用的QSAR模型研究
宋哲
刘涛
刘伟
朱鸣华
王晓钢
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2007
9
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