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FT-SERS研究非极性R侧链氨基酸在银胶体系中的吸附状态
被引量:
11
1
作者
黎司
周光明
+4 位作者
杨大成
虞丹尼
彭红军
伍辛军
王宁
《光谱学与光谱分析》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2007年第4期711-715,共5页
利用傅里叶变换表面增强拉曼光谱(FT-SERS)研究了以L-蛋氨酸为代表的非极性R侧链氨基酸在纳米银衬底上的吸附状态和相互作用的特性,并结合浓度、pH值的变化探讨了吸附作用的特点和规律。实验结果表明,L-蛋氨酸在银胶上的最佳FT-SER...
利用傅里叶变换表面增强拉曼光谱(FT-SERS)研究了以L-蛋氨酸为代表的非极性R侧链氨基酸在纳米银衬底上的吸附状态和相互作用的特性,并结合浓度、pH值的变化探讨了吸附作用的特点和规律。实验结果表明,L-蛋氨酸在银胶上的最佳FT-SERS的浓度范围为10^-3~10^-4mol·L^-1;其pH范围以酸性、等电点、碱性而分段,当pH值在等电点附近及酸碱度过大时的FT-SERS都较差;L-蛋氨酸与纳米银的作用是通过氨基、羧基、硫与银的物理、化学吸附,其吸附态随着pH值的变化而改变。结合文献,对非极性R侧链氨基酸与纳米银的吸附特性作了总结,以期有助于对氨基酸、蛋白质、多肽、酶等相关领域更深入的研究。
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关键词
FT-SERS
非
极性
R侧链
氨基酸
蛋氨酸
浓度
PH值
吸附
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职称材料
自组装双亲短肽氨基酸组成及连接肽对其融合酶表达量的影响
被引量:
2
2
作者
赵伟欣
刘松
+2 位作者
刘立明
陈坚
堵国成
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第12期1-6,共6页
自组装双亲短肽(self-assembling amphipathic peptides,SAPs)是一类亲疏水氨基酸按一定规律分布,具有自聚合效应的氨基酸短肽,融合在酶蛋白N端时,具有促进表达和稳定化的功能。以自组装双亲短肽S1(AEAEAKAKAEAEAKAK)为出发序列,与来源...
自组装双亲短肽(self-assembling amphipathic peptides,SAPs)是一类亲疏水氨基酸按一定规律分布,具有自聚合效应的氨基酸短肽,融合在酶蛋白N端时,具有促进表达和稳定化的功能。以自组装双亲短肽S1(AEAEAKAKAEAEAKAK)为出发序列,与来源于Bacillus sp.WSHB04-02的碱性果胶酶(alkaline polygalacturonate lyase,PGL)组成的融合酶为模式蛋白,考察SAPs的氨基酸组成及SAPs融合蛋白内部连接肽(linker peptide)对PGL-SAP融合酶的表达量的影响。结果显示,含有较弱疏水性的甘氨酸和丙氨酸残基的PGL-S1突变体可使融合酶正常表达,其中,含有组氨酸的PGL-S1v1具有相对最高的胞外酶活,较野生型提高了9倍,较PGL-S1提高了1.5倍。连接肽方面,与刚性连接肽相比,含有柔性连接肽的融合酶具有更高的胞外酶活,含有(GGGGS)3的PGL-F-S1融合酶胞外酶活是野生型的14倍。上述结果表明,SAPs的氨基酸组成及融合蛋白之间的连接肽对PGL融合酶的表达具有重要影响。
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关键词
自组装双亲短肽
融合蛋白
连接肽
氨基酸极性
表达量
碱性果胶酶
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职称材料
序列上下文氨基酸与其蛋白质二级结构的关系
被引量:
4
3
作者
马寿勇
王联结
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2011年第30期18414-18416,共3页
按照蛋白质二级结构的连续性和二级结构多样性提取序列片段,通过用自编的计算机软件在967条非冗余蛋白质数据库中按照氨基酸残基的极性逐个对提取出的序列片段在其原蛋白质中的上下文中的氨基酸残基对目标序列的二级结构的影响概率进行...
按照蛋白质二级结构的连续性和二级结构多样性提取序列片段,通过用自编的计算机软件在967条非冗余蛋白质数据库中按照氨基酸残基的极性逐个对提取出的序列片段在其原蛋白质中的上下文中的氨基酸残基对目标序列的二级结构的影响概率进行分析,并给出其影响概率的平均值。最后发现,序列上下文中的氨基酸残基的极性对目标序列片段的蛋白质二级结构具有较为明显的影响。
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关键词
二级结构多样性
氨基酸
残基
极性
序列上下文
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职称材料
蛋白质-核酸复合物氢键与范德华力作用位点分析
被引量:
3
4
作者
吴建盛
胡栋
+3 位作者
晏善成
马昕
谢建明
孙啸
《东南大学学报(自然科学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2011年第4期778-783,共6页
为了深入了解蛋白质-核酸相互作用模式,对复合物结构中氢键/范德华力作用力位点上的氨基酸和核苷酸的偏好性(即相对使用频率)进行了统计分析.结果表明:氢键/范德华力作用位点上对氨基酸的偏好性差异均极其显著,与蛋白质-核酸特异作用密...
为了深入了解蛋白质-核酸相互作用模式,对复合物结构中氢键/范德华力作用力位点上的氨基酸和核苷酸的偏好性(即相对使用频率)进行了统计分析.结果表明:氢键/范德华力作用位点上对氨基酸的偏好性差异均极其显著,与蛋白质-核酸特异作用密切相关的残基侧链与核苷酸碱基间相互作用力位点对氨基酸类型的选择特异性更高;单链RNA分子与蛋白质发生相互作用时对氨基酸残基的偏好性和双链RNA分子差异不显著;氨基酸的极性大小及方向在决定其是否与核酸分子形成范德华力作用具有重要贡献,氨基酸侧链形成的空间位阻会阻碍其与核酸分子形成氢键作用;蛋白质-DNA复合物结构氢键/范德华力作用位点上残基间空间协同作用时对氨基酸类型的选择与蛋白质-RNA复合物结构间存在显著差异.
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关键词
蛋白质-核酸复合物
氢键作用位点
范德华力作用位点
偏好性
氨基酸极性
协同作用
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职称材料
蛋白质-核酸复合物中氢键和范德华力作用位点偏好性分析
5
作者
吴建盛
晏善成
+1 位作者
武灵芝
汤丽华
《南京邮电大学学报(自然科学版)》
2011年第4期138-144,共7页
对蛋白质-核酸复合物结构中氢键/范德华力作用位点氨基酸与核苷酸的偏好性(即相对使用频率)进行了统计分析。发现:(1)在蛋白质-DNA复合物结构中,范德华力作用对与氢键数量相当;而在蛋白质-RNA复合物结构中,范德华力作用对数量要远多于氢...
对蛋白质-核酸复合物结构中氢键/范德华力作用位点氨基酸与核苷酸的偏好性(即相对使用频率)进行了统计分析。发现:(1)在蛋白质-DNA复合物结构中,范德华力作用对与氢键数量相当;而在蛋白质-RNA复合物结构中,范德华力作用对数量要远多于氢键;(2)复合物结构中氢键和范德华力作用位点上对氨基酸的偏好性差异显著;(3)氨基酸的极性大小及方向在决定它是否与DNA/RNA分子形成氢键/范德华力相互作用时起到重要的作用。
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关键词
蛋白质-核酸复合物
氢键
范德华力
偏好性
氨基酸极性
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职称材料
色氨酸在家禽生产上的应用研究进展
6
作者
罗玲
韩奇鹏
+1 位作者
曲湘勇
陈继发
《广东饲料》
2015年第10期30-32,共3页
1色氨酸的生物学功能1.1色氨酸的理化性质色氨酸又名α-氨基-β-吲哚丙酸,是一种芳香族、杂环、非极性氨基酸,分子式:C11H12N2O2,分子量:204.23,有DL型、D型和L型3种异构体,天然存在的只有L-色氨酸(刘锁珠,2007),呈白色或略带黄色...
1色氨酸的生物学功能1.1色氨酸的理化性质色氨酸又名α-氨基-β-吲哚丙酸,是一种芳香族、杂环、非极性氨基酸,分子式:C11H12N2O2,分子量:204.23,有DL型、D型和L型3种异构体,天然存在的只有L-色氨酸(刘锁珠,2007),呈白色或略带黄色叶片状结晶或粉末,无臭味或微臭,微苦。
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关键词
吲哚丙酸
家禽生产
非
极性
氨基酸
叶片状
黄羽肉鸡
日采食量
肉种鸡
饲料添加剂
繁殖性能
色胺
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职称材料
题名
FT-SERS研究非极性R侧链氨基酸在银胶体系中的吸附状态
被引量:
11
1
作者
黎司
周光明
杨大成
虞丹尼
彭红军
伍辛军
王宁
机构
西南大学化学化工学院
出处
《光谱学与光谱分析》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2007年第4期711-715,共5页
基金
西南师范大学校青年基金(SWNUQ:2005008)资助
文摘
利用傅里叶变换表面增强拉曼光谱(FT-SERS)研究了以L-蛋氨酸为代表的非极性R侧链氨基酸在纳米银衬底上的吸附状态和相互作用的特性,并结合浓度、pH值的变化探讨了吸附作用的特点和规律。实验结果表明,L-蛋氨酸在银胶上的最佳FT-SERS的浓度范围为10^-3~10^-4mol·L^-1;其pH范围以酸性、等电点、碱性而分段,当pH值在等电点附近及酸碱度过大时的FT-SERS都较差;L-蛋氨酸与纳米银的作用是通过氨基、羧基、硫与银的物理、化学吸附,其吸附态随着pH值的变化而改变。结合文献,对非极性R侧链氨基酸与纳米银的吸附特性作了总结,以期有助于对氨基酸、蛋白质、多肽、酶等相关领域更深入的研究。
关键词
FT-SERS
非
极性
R侧链
氨基酸
蛋氨酸
浓度
PH值
吸附
Keywords
FT-SERS, Nonpolar R-side amino acids L-methionine Concentration pH Adsorption
分类号
O657.3 [理学—分析化学]
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职称材料
题名
自组装双亲短肽氨基酸组成及连接肽对其融合酶表达量的影响
被引量:
2
2
作者
赵伟欣
刘松
刘立明
陈坚
堵国成
机构
江南大学
江南大学生物工程学院
江南大学
出处
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第12期1-6,共6页
基金
国家自然科学基金(31401638)
国家自然科学基金(31771913)
江苏省重点研发计划社会发展项目(BE2016629)
文摘
自组装双亲短肽(self-assembling amphipathic peptides,SAPs)是一类亲疏水氨基酸按一定规律分布,具有自聚合效应的氨基酸短肽,融合在酶蛋白N端时,具有促进表达和稳定化的功能。以自组装双亲短肽S1(AEAEAKAKAEAEAKAK)为出发序列,与来源于Bacillus sp.WSHB04-02的碱性果胶酶(alkaline polygalacturonate lyase,PGL)组成的融合酶为模式蛋白,考察SAPs的氨基酸组成及SAPs融合蛋白内部连接肽(linker peptide)对PGL-SAP融合酶的表达量的影响。结果显示,含有较弱疏水性的甘氨酸和丙氨酸残基的PGL-S1突变体可使融合酶正常表达,其中,含有组氨酸的PGL-S1v1具有相对最高的胞外酶活,较野生型提高了9倍,较PGL-S1提高了1.5倍。连接肽方面,与刚性连接肽相比,含有柔性连接肽的融合酶具有更高的胞外酶活,含有(GGGGS)3的PGL-F-S1融合酶胞外酶活是野生型的14倍。上述结果表明,SAPs的氨基酸组成及融合蛋白之间的连接肽对PGL融合酶的表达具有重要影响。
关键词
自组装双亲短肽
融合蛋白
连接肽
氨基酸极性
表达量
碱性果胶酶
Keywords
self-assembling amphipathic peptides
fusion enzymes
linker peptides
polarity of amino acid
catalyticefficiency
alkaline polygalacturonate lyase
分类号
TS201.2 [轻工技术与工程—食品科学]
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职称材料
题名
序列上下文氨基酸与其蛋白质二级结构的关系
被引量:
4
3
作者
马寿勇
王联结
机构
陕西科技大学生命科学与工程学院
出处
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2011年第30期18414-18416,共3页
文摘
按照蛋白质二级结构的连续性和二级结构多样性提取序列片段,通过用自编的计算机软件在967条非冗余蛋白质数据库中按照氨基酸残基的极性逐个对提取出的序列片段在其原蛋白质中的上下文中的氨基酸残基对目标序列的二级结构的影响概率进行分析,并给出其影响概率的平均值。最后发现,序列上下文中的氨基酸残基的极性对目标序列片段的蛋白质二级结构具有较为明显的影响。
关键词
二级结构多样性
氨基酸
残基
极性
序列上下文
Keywords
Diversity of secondary structure
Amino acid residues polarity
Sequence context
分类号
S132 [农业科学—农业基础科学]
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职称材料
题名
蛋白质-核酸复合物氢键与范德华力作用位点分析
被引量:
3
4
作者
吴建盛
胡栋
晏善成
马昕
谢建明
孙啸
机构
南京邮电大学地理与生物信息学院
东南大学生物电子学国家重点实验室
出处
《东南大学学报(自然科学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2011年第4期778-783,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(61073141
60771024)
南京邮电大学科研启动基金资助项目(NY209027)
文摘
为了深入了解蛋白质-核酸相互作用模式,对复合物结构中氢键/范德华力作用力位点上的氨基酸和核苷酸的偏好性(即相对使用频率)进行了统计分析.结果表明:氢键/范德华力作用位点上对氨基酸的偏好性差异均极其显著,与蛋白质-核酸特异作用密切相关的残基侧链与核苷酸碱基间相互作用力位点对氨基酸类型的选择特异性更高;单链RNA分子与蛋白质发生相互作用时对氨基酸残基的偏好性和双链RNA分子差异不显著;氨基酸的极性大小及方向在决定其是否与核酸分子形成范德华力作用具有重要贡献,氨基酸侧链形成的空间位阻会阻碍其与核酸分子形成氢键作用;蛋白质-DNA复合物结构氢键/范德华力作用位点上残基间空间协同作用时对氨基酸类型的选择与蛋白质-RNA复合物结构间存在显著差异.
关键词
蛋白质-核酸复合物
氢键作用位点
范德华力作用位点
偏好性
氨基酸极性
协同作用
Keywords
protein-nucleic acid complexes
hydrogen bonding interfaces
van del Waals contacting interfaces
propensity
polarity of amino acids
cooperative interaction
分类号
Q527.2 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
蛋白质-核酸复合物中氢键和范德华力作用位点偏好性分析
5
作者
吴建盛
晏善成
武灵芝
汤丽华
机构
南京邮电大学地理与生物信息学院
东南大学生物电子学国家重点实验室生物科学与医学工程学院
出处
《南京邮电大学学报(自然科学版)》
2011年第4期138-144,共7页
基金
南京邮电大学科研启动基金项目(NY209027)资助项目
文摘
对蛋白质-核酸复合物结构中氢键/范德华力作用位点氨基酸与核苷酸的偏好性(即相对使用频率)进行了统计分析。发现:(1)在蛋白质-DNA复合物结构中,范德华力作用对与氢键数量相当;而在蛋白质-RNA复合物结构中,范德华力作用对数量要远多于氢键;(2)复合物结构中氢键和范德华力作用位点上对氨基酸的偏好性差异显著;(3)氨基酸的极性大小及方向在决定它是否与DNA/RNA分子形成氢键/范德华力相互作用时起到重要的作用。
关键词
蛋白质-核酸复合物
氢键
范德华力
偏好性
氨基酸极性
Keywords
protein-nucleic acid complex
hydrogen bonds
van der Waals contacts
binding propensity
polarity of amino acids
分类号
Q527.2 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
色氨酸在家禽生产上的应用研究进展
6
作者
罗玲
韩奇鹏
曲湘勇
陈继发
机构
湖南农业大学动物科学技术学院
出处
《广东饲料》
2015年第10期30-32,共3页
文摘
1色氨酸的生物学功能1.1色氨酸的理化性质色氨酸又名α-氨基-β-吲哚丙酸,是一种芳香族、杂环、非极性氨基酸,分子式:C11H12N2O2,分子量:204.23,有DL型、D型和L型3种异构体,天然存在的只有L-色氨酸(刘锁珠,2007),呈白色或略带黄色叶片状结晶或粉末,无臭味或微臭,微苦。
关键词
吲哚丙酸
家禽生产
非
极性
氨基酸
叶片状
黄羽肉鸡
日采食量
肉种鸡
饲料添加剂
繁殖性能
色胺
分类号
S816.7 [农业科学—饲料科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
FT-SERS研究非极性R侧链氨基酸在银胶体系中的吸附状态
黎司
周光明
杨大成
虞丹尼
彭红军
伍辛军
王宁
《光谱学与光谱分析》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2007
11
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职称材料
2
自组装双亲短肽氨基酸组成及连接肽对其融合酶表达量的影响
赵伟欣
刘松
刘立明
陈坚
堵国成
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2017
2
在线阅读
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职称材料
3
序列上下文氨基酸与其蛋白质二级结构的关系
马寿勇
王联结
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2011
4
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职称材料
4
蛋白质-核酸复合物氢键与范德华力作用位点分析
吴建盛
胡栋
晏善成
马昕
谢建明
孙啸
《东南大学学报(自然科学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2011
3
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职称材料
5
蛋白质-核酸复合物中氢键和范德华力作用位点偏好性分析
吴建盛
晏善成
武灵芝
汤丽华
《南京邮电大学学报(自然科学版)》
2011
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
6
色氨酸在家禽生产上的应用研究进展
罗玲
韩奇鹏
曲湘勇
陈继发
《广东饲料》
2015
0
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职称材料
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