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编码方式对蛋白质二级结构预测精度的影响
被引量:
12
1
作者
阮晓钢
孙海军
《北京工业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第3期229-235,共7页
为了比较在蛋白质二级结构预测中常用的氨基酸序列编码方式的优缺点,借助前向型BP神经网络对正交编码、5位编码、Codon(2种)编码和Profile编码5种氨基酸编码方式进行了对比分析.实验结果显示,用富含"生物进化信息"的Profile...
为了比较在蛋白质二级结构预测中常用的氨基酸序列编码方式的优缺点,借助前向型BP神经网络对正交编码、5位编码、Codon(2种)编码和Profile编码5种氨基酸编码方式进行了对比分析.实验结果显示,用富含"生物进化信息"的Profile编码方式可以得到较高的预测结果,同时也表明,充分利用生物本身所具有的生物信息对提高蛋白质二级结构预测精度是非常重要的.
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关键词
氨基酸序列编码
蛋白质二级结构
神经网络
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职称材料
题名
编码方式对蛋白质二级结构预测精度的影响
被引量:
12
1
作者
阮晓钢
孙海军
机构
北京工业大学电子信息和控制工程学院
出处
《北京工业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第3期229-235,共7页
基金
国家自然基金资助项目(60234020)
文摘
为了比较在蛋白质二级结构预测中常用的氨基酸序列编码方式的优缺点,借助前向型BP神经网络对正交编码、5位编码、Codon(2种)编码和Profile编码5种氨基酸编码方式进行了对比分析.实验结果显示,用富含"生物进化信息"的Profile编码方式可以得到较高的预测结果,同时也表明,充分利用生物本身所具有的生物信息对提高蛋白质二级结构预测精度是非常重要的.
关键词
氨基酸序列编码
蛋白质二级结构
神经网络
Keywords
amino acid sequence encode
protein secondary structure prediction
neural network
分类号
Q518.1 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
编码方式对蛋白质二级结构预测精度的影响
阮晓钢
孙海军
《北京工业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2005
12
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