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题名一株鹅源细小病毒的分离鉴定与遗传进化分析
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作者
彭珊
王超
朱婉君
张济培
陈济铛
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机构
佛山大学动物科技学院
佛山天牧生物科技有限公司
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出处
《广东畜牧兽医科技》
2025年第4期94-104,共11页
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基金
广东省普通高校科研项目重点领域专项(2020ZDZX1018)
佛山天牧生物科技有限公司技术开发项目(KH22275)
佛山万牧洲生物科技有限公司技术开发项目(KH23279)。
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文摘
小鹅瘟是由鹅细小病毒(Goose parvovirus,GPV)引发的传染病,20日龄内雏鹅具有高致死性,而青年鹅常表现为隐性感染,易被忽视。2024年11月,广东揭阳某地养鹅场青年鹅群(56日龄)急性发病,为明确病因,针对送检的病死鹅进行剖检并无菌采集肝、脾和肠组织样本,通过PCR/RT-PCR方法对常见鹅病毒性传染病病原核酸进行检测。将GPV阳性组织样本研磨处理后接种至鹅胚,随后对PCR阳性尿囊液样本进行全基因组克隆测序,并基于获得的序列数据开展系统发育与分子进化分析。结果显示,送检组织样品中鹅细小病毒核酸呈阳性,鹅圆环病毒(Goose circovirus,GoCV)、鹅星状病毒(Goose astrovirus,GoAstV)、新城疫病毒(Newcastle Disease Virus,NDV)和坦布苏病毒(Tembusu virus,TMUV)核酸均为阴性。阳性病料组织悬液接种鹅胚后,鹅胚死亡且胚体严重出血,鹅胚尿囊液PCR检测为GPV阳性。测序结果显示,毒株基因组全长为5028 bp,由ITR区域和NS、VP基因构成,将该毒株命名为GPV/GD/3121/2024株。相似性分析显示,该分离株与DY16株的NS1和VP1基因相似性最高,分别达到99.4%和95.9%。GPV/GD/3121/2024株与国内近年GPV分离株(DY16株、RC16株和HB-2019株)全基因序列相似性高达97.5%。基于全基因组序列、非结构蛋白NS1和结构蛋白VP1序列的遗传演化分析均显示,分离株与欧洲疫苗株(VG32/1)、中国大陆疫苗株(GDaGPV、SYG61v)和台湾疫苗株(82-0321V)均同属一个大分支,遗传关系较近。此外,与经典GPV毒株相比,GPV/GD/3121/2024株VP1基因含有3个特有的碱基突变位点,分别为A2496T、G2515C、A2772G,这些突变导致VP1结构蛋白发生V38L、S178T和Y491H氨基酸位点改变。该研究确定了该场青年鹅发病致死系感染GPV所致,并对毒株进行分离鉴定和遗传进化分析,同时简要比较了国内GPV的分子特征,为该病毒的生物学特性研究和科学防控提供了参考信息。
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关键词
鹅细小病毒
全基因
遗传进化分析
氨基酸序列比对
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Keywords
Goose Parvovirus
Complete gene
Genetic evolutionary analysis
Amino Acid Sequence Alignment
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分类号
S852.659.2
[农业科学—基础兽医学]
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题名定点突变提高碱性果胶酶热稳定性
被引量：4
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作者
刘松
汪明星
堵国成
陈坚
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机构
工业生物技术教育部重点实验室
江南大学生物工程学院
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出处
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第9期1-6,共6页
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基金
国家自然科学基金:融合自组装双亲短肽提高Pseudomonas aeruginosa脂肪氧合酶热稳定性机制的研究
国家高技术研究发展计划(863计划):重要食品酶微生物发酵生产与高效制备关键技术
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文摘
碱性果胶酶(PGL,E.C.4.2.2.2)是一种重要的工业酶,在碱性条件下催化聚半乳糖醛酸的α-1,4糖苷键裂解,广泛应用于食品、纺织和造纸等行业。为提高酶热稳定性,将Bacillus sp.WSHB04-02 PGL与3种耐热酶进行氨基酸序列比对,确定7个在耐热酶中保守但在PGL中不保守的位点(158、N189、G191、S229、K314、S315和I325)作为改造的目标位点,单独突变为耐热酶中的保守氨基酸。酶学性质分析显示,PGL突变体热稳定性均有提高。与野生酶相比,N189E、S229K和I325F的55℃半衰期分别提高2.32倍、2.11倍和1.89倍;I58V和K314M 55℃半衰期分别提高19.4%和38.9%,比酶活分别提高65%和91%。结构分析显示,除S315G外的PGL突变体的分子内的多种作用力数量均发生改变。上述结果表明,定点突变能有效提高PGL热稳定性,分子间作用力的变化可能是酶学性质变化的重要原因之一。
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关键词
碱性果胶酶
氨基酸序列比对
定点突变
热稳定性
作用力
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Keywords
alkaline polygalacturonate lyase
alignment of amino acid sequence
site-directed mutagenesis
thermal stability
interaction
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分类号
TS201.25
[轻工技术与工程—食品科学]
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