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基于作用机制的氨基恶唑啉呫吨类BACE1抑制剂的分子设计
被引量：
1
1
作者
吴倩
高庆平
+3 位作者
李丹
刘莉
李燕
杨凌
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第7期740-746,共7页
天冬氨酰蛋白酶(β-site amyloid precursor protein cleaving enzyme 1,BACE1)作为治疗阿尔兹海默症的潜在靶点,其抑制剂的开发已成为医学领域的重要研究方向。本文以59个氨基恶唑啉呫吨类BACE1抑制剂为研究对象,运用比较分子相似性指...
天冬氨酰蛋白酶(β-site amyloid precursor protein cleaving enzyme 1,BACE1)作为治疗阿尔兹海默症的潜在靶点,其抑制剂的开发已成为医学领域的重要研究方向。本文以59个氨基恶唑啉呫吨类BACE1抑制剂为研究对象,运用比较分子相似性指数(comparative molecular similarity index,Co MSIA)和分子对接方法,深入挖掘影响抑制剂活性的特征结构,以及抑制剂与BACE1间的结合模式和作用力类型,并以此为基础设计新型抑制剂并预测其活性。Co MSIA模拟结果表明,由立体场、静电场、疏水场和氢键供体场4个场组合建立的构效关系模型具有较强的预测能力,交叉验证相关系数Q2=0.48,非交叉验证相关系数Rncv2=0.94,外部预测相关系数Rpre2=0.85;通过分子对接,发现抑制剂占据了靶标的S3、S1和S2'位点,与BACE1之间的结合主要是通过氢键作用力和π-π堆积作用实现的;占据S2'位点的R取代基是立体场、静电场和疏水场影响的敏感区域,氨基恶唑啉核心官能团是氢键供体场的敏感区域。基于以上分析获得的抑制剂特征结构信息及其与蛋白质受体的作用机制,成功设计出了新的分子并预测了抑制活性。实验所得模型和信息,为后续新型BACE1抑制剂的结构优化和改造提供了重要理论依据。
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关键词
氨基恶唑啉呫吨类衍生物
BACE1抑制剂
特征结构
相互作用机制
分子设计
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职称材料
氨基酸N-羧酸内酸酐与胺反应的位阻效应
被引量：
1
2
作者
黄世俊
黄种宾
+2 位作者
张方建
郑剑峰
靳立人
《厦门大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第4期511-514,共4页
研究了α-氨基酸的N-羧酸内酸酐(4-烷基-2,5-二氧代噁唑啉)与胺缩合反应.用L-苯丙氨酸,L-缬氨酸,L-亮氨酸制得相应的N-羧酸内酸酐,并分别与二乙胺,叔丁胺,异丙胺,正丁胺反应.正丁胺与N-羧酸内酸酐仅分离得到酰胺,而叔丁胺或异丙胺得到...
研究了α-氨基酸的N-羧酸内酸酐(4-烷基-2,5-二氧代噁唑啉)与胺缩合反应.用L-苯丙氨酸,L-缬氨酸,L-亮氨酸制得相应的N-羧酸内酸酐,并分别与二乙胺,叔丁胺,异丙胺,正丁胺反应.正丁胺与N-羧酸内酸酐仅分离得到酰胺,而叔丁胺或异丙胺得到的是脲酸和酰胺的混合物.二乙胺与N-羧酸内酸酐反应则仅得到脲酸衍生物,产率大于80%,具有制备价值.发现N-羧酸内酸酐4位取代基的位阻效应对反应的区域选择性具有一定的导向作用,大位阻基团导致产物中脲衍生物比例增加.
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关键词
位阻效应
氨基
酸
酸酐
羧酸
L-苯丙氨酸
L-缬氨酸
L-亮氨酸
区域选择性
缩合反应
脲
衍生物
导向作用
正丁胺
异丙胺
叔丁胺
二乙胺
噁唑
啉
二氧代
混合物
取代基
酰胺
分离
产物
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职称材料
题名
基于作用机制的氨基恶唑啉呫吨类BACE1抑制剂的分子设计
被引量：
1
1
作者
吴倩
高庆平
李丹
刘莉
李燕
杨凌
机构
潍坊学院化学化工与环境工程学院化工教研室
潍坊职业学院化学工程学院化工教研室
大连理工大学化工与环境生命学部材料科学与化工系
中国科学院大连化学物理研究所药物资源开发研究组
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第7期740-746,共7页
基金
国家自然科学基金(No.11201049)
山东省自然科学基金(No.ZR2016BQ40)
潍坊学院博士科研基金(No.2018BS07)资助~~
文摘
天冬氨酰蛋白酶(β-site amyloid precursor protein cleaving enzyme 1,BACE1)作为治疗阿尔兹海默症的潜在靶点,其抑制剂的开发已成为医学领域的重要研究方向。本文以59个氨基恶唑啉呫吨类BACE1抑制剂为研究对象,运用比较分子相似性指数(comparative molecular similarity index,Co MSIA)和分子对接方法,深入挖掘影响抑制剂活性的特征结构,以及抑制剂与BACE1间的结合模式和作用力类型,并以此为基础设计新型抑制剂并预测其活性。Co MSIA模拟结果表明,由立体场、静电场、疏水场和氢键供体场4个场组合建立的构效关系模型具有较强的预测能力,交叉验证相关系数Q2=0.48,非交叉验证相关系数Rncv2=0.94,外部预测相关系数Rpre2=0.85;通过分子对接,发现抑制剂占据了靶标的S3、S1和S2'位点,与BACE1之间的结合主要是通过氢键作用力和π-π堆积作用实现的;占据S2'位点的R取代基是立体场、静电场和疏水场影响的敏感区域,氨基恶唑啉核心官能团是氢键供体场的敏感区域。基于以上分析获得的抑制剂特征结构信息及其与蛋白质受体的作用机制,成功设计出了新的分子并预测了抑制活性。实验所得模型和信息,为后续新型BACE1抑制剂的结构优化和改造提供了重要理论依据。
关键词
氨基恶唑啉呫吨类衍生物
BACE1抑制剂
特征结构
相互作用机制
分子设计
Keywords
aminooxazoline xanthene derivatives
BACE1 inhibitors
structural features
interaction mechanism
molecular design
分类号
Q67 [生物学—生物物理学]
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职称材料
题名
氨基酸N-羧酸内酸酐与胺反应的位阻效应
被引量：
1
2
作者
黄世俊
黄种宾
张方建
郑剑峰
靳立人
机构
厦门大学化学系
出处
《厦门大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第4期511-514,共4页
基金
国家自然科学基金(29772029)
福建省自然科学基金(C991002)
厦门市科研基金资助
文摘
研究了α-氨基酸的N-羧酸内酸酐(4-烷基-2,5-二氧代噁唑啉)与胺缩合反应.用L-苯丙氨酸,L-缬氨酸,L-亮氨酸制得相应的N-羧酸内酸酐,并分别与二乙胺,叔丁胺,异丙胺,正丁胺反应.正丁胺与N-羧酸内酸酐仅分离得到酰胺,而叔丁胺或异丙胺得到的是脲酸和酰胺的混合物.二乙胺与N-羧酸内酸酐反应则仅得到脲酸衍生物,产率大于80%,具有制备价值.发现N-羧酸内酸酐4位取代基的位阻效应对反应的区域选择性具有一定的导向作用,大位阻基团导致产物中脲衍生物比例增加.
关键词
位阻效应
氨基
酸
酸酐
羧酸
L-苯丙氨酸
L-缬氨酸
L-亮氨酸
区域选择性
缩合反应
脲
衍生物
导向作用
正丁胺
异丙胺
叔丁胺
二乙胺
噁唑
啉
二氧代
混合物
取代基
酰胺
分离
产物
Keywords
N-Carboxyanhydride
uramidoacide
amino acid
steric-effect
分类号
TQ323.5 [化学工程—合成树脂塑料工业]
X132 [环境科学与工程—环境科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于作用机制的氨基恶唑啉呫吨类BACE1抑制剂的分子设计
吴倩
高庆平
李丹
刘莉
李燕
杨凌
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
1
在线阅读
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职称材料
2
氨基酸N-羧酸内酸酐与胺反应的位阻效应
黄世俊
黄种宾
张方建
郑剑峰
靳立人
《厦门大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2005
1
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职称材料
已选择
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