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胶州湾浮游植物遗传多样性及其季节变化研究
被引量：
6
1
作者
刘永健
杨官品
+1 位作者
管晓菁
门荣新
《海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第5期103-111,共9页
分别于春、夏、秋三季提取了胶州湾浮游生物总DNA,用PCR方法扩增了浮游植物核酮糖1,5-二磷酸羧化/氧化酶大亚基(rbcL)基因片段,构建了三季节rbcL基因片段质粒文库.随机从各文库中选择约50个克隆,测定了这些克隆的序列.以氨基酸序列相同...
分别于春、夏、秋三季提取了胶州湾浮游生物总DNA,用PCR方法扩增了浮游植物核酮糖1,5-二磷酸羧化/氧化酶大亚基(rbcL)基因片段,构建了三季节rbcL基因片段质粒文库.随机从各文库中选择约50个克隆,测定了这些克隆的序列.以氨基酸序列相同为标准,共获得59个分类操作单元(OTUs),其中春季特有的21个,夏季特有的13个,秋季特有的23个.有两个OTUs为春、夏季表层海水共有.基于OTU丰度计算的香农氏指数能反映遗传多样性水平.胶州湾春、夏、秋三季的香农氏指数分别为2.69,2.44和2.76,表明秋季胶州湾浮游植物遗传多样性最丰富.春、夏、秋三季浮游植物群落组成差异显著.除夏秋季有两个OTUs相同外,其他OTUs在季节间完全不同.表层海水浮游植物群落结构是动态的,随时间、空间的不同而变化.
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关键词
浮游植物
核酮糖1
5-二磷酸羧化
氧化酶大亚基基因
群落结构
季节变化
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职称材料
海州湾条斑紫菜养殖对浮游藻类群落结构及遗传多样性的影响
被引量：
3
2
作者
王洪斌
李信书
+3 位作者
宋秀梅
吴言
李士虎
阎斌伦
《海洋科学》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第12期103-109,共7页
为了研究条斑紫菜(Porphyra yezoensis)养殖对江苏海州湾浮游藻类群落结构及遗传多样性的影响,于江苏省海州湾条斑紫菜养殖及非养殖海区各设置4个采样位点,采集表层海水,提取海水中浮游藻类的总DNA,PCR扩增浮游藻类核酮糖1,5-二磷酸羧化...
为了研究条斑紫菜(Porphyra yezoensis)养殖对江苏海州湾浮游藻类群落结构及遗传多样性的影响,于江苏省海州湾条斑紫菜养殖及非养殖海区各设置4个采样位点,采集表层海水,提取海水中浮游藻类的总DNA,PCR扩增浮游藻类核酮糖1,5-二磷酸羧化/氧化酶大亚基(rbc L)基因片段,构建了养殖及非养殖海区rbc L片段质粒文库。在文库中随机选择50个阳性克隆并测序。经比对分析,在条斑紫菜非养殖区发现8种海洋微藻,隐鞭藻占总克隆数22%,海链藻和骨条藻分别占6%和2%;养殖海区发现10种微藻,其中异丝藻占总克隆数22%,优势度明显,仅3种微藻为二海区共有(骨条藻、隐鞭藻及小球藻),表明紫菜养殖及非养殖区浮游藻类群落组成差异显著。条斑紫菜非养殖区及养殖区的浮游藻类香农指数均值分别为3.273和3.654,均匀度指数均值分别为1.090和1.040,显示养殖区浮游藻类遗传多样性较丰富,而群落的成熟度与稳定性非养殖区高。研究证实,表层海水浮游藻类群落结构及组成是动态的,条斑紫菜的养殖行为形成浮游藻类群落结构及遗传多样性较大差异性。
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关键词
条斑紫菜(Porphyra
yezoensis)
浮游藻类
核酮糖l
5-二磷酸羧化/
氧化酶大亚基基因
遗传多样性
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职称材料
胶州湾浮游植物分子遗传多样性初步研究
被引量：
5
3
作者
刘永健
杨官品
门荣新
《青岛海洋大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2003年第6期907-916,共10页
用聚合酶链式反应扩增海洋浮游植物总体的核酮糖 1 ,5 -二磷酸羧化 /氧化酶大亚基基因(rbc L)片段 ,建立该基因变异类型文库 ,并随机测定了 38个 rbc L大亚基基因片段序列 ,初步分析了海洋浮游植物分子遗传多样性。将≥ 97%的氨基酸序...
用聚合酶链式反应扩增海洋浮游植物总体的核酮糖 1 ,5 -二磷酸羧化 /氧化酶大亚基基因(rbc L)片段 ,建立该基因变异类型文库 ,并随机测定了 38个 rbc L大亚基基因片段序列 ,初步分析了海洋浮游植物分子遗传多样性。将≥ 97%的氨基酸序列相似性定义为种内变异 ,38个片段分别代表1 3个不同的物种 ,或称为不同的操作分类单元。与数据库序列比较发现 ,PPJZ0 1 ,PPJZ1 1和 PPJZ2 0可能是已报道的 rbc L基因序列代表的物种 ,其它克隆在数据库中没有对应的近缘物种序列存在。系统学分析表明分离的克隆分别属于隐藻门、硅藻门、绿藻门和 streptophyta等的浮游植物 ,极少数克隆来源于异鞭毛藻类、定鞭藻纲和原细菌。根据各操作分类单元克隆数计算得胶州湾浮游植物分子遗传多样性指数为 1 .97。研究结果为利用分子生物学方法剖分海洋浮游植物群落结构。
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关键词
胶州湾
浮游植物
分子遗传多样性
核酮糖1
5-二磷酸羧化/
氧化酶大亚基基因
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职称材料
题名
胶州湾浮游植物遗传多样性及其季节变化研究
被引量：
6
1
作者
刘永健
杨官品
管晓菁
门荣新
机构
中国海洋大学海洋生命学院
出处
《海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第5期103-111,共9页
基金
国家自然科学基金资助项目(40176028).
文摘
分别于春、夏、秋三季提取了胶州湾浮游生物总DNA,用PCR方法扩增了浮游植物核酮糖1,5-二磷酸羧化/氧化酶大亚基(rbcL)基因片段,构建了三季节rbcL基因片段质粒文库.随机从各文库中选择约50个克隆,测定了这些克隆的序列.以氨基酸序列相同为标准,共获得59个分类操作单元(OTUs),其中春季特有的21个,夏季特有的13个,秋季特有的23个.有两个OTUs为春、夏季表层海水共有.基于OTU丰度计算的香农氏指数能反映遗传多样性水平.胶州湾春、夏、秋三季的香农氏指数分别为2.69,2.44和2.76,表明秋季胶州湾浮游植物遗传多样性最丰富.春、夏、秋三季浮游植物群落组成差异显著.除夏秋季有两个OTUs相同外,其他OTUs在季节间完全不同.表层海水浮游植物群落结构是动态的,随时间、空间的不同而变化.
关键词
浮游植物
核酮糖1
5-二磷酸羧化
氧化酶大亚基基因
群落结构
季节变化
Keywords
phytoplankton
ribulose-1, 5-bisphosphate carboxynase/oxygenase large subunit gene （rbcL）
community structure
seasonal variation
分类号
Q178.53 [生物学—水生生物学]
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职称材料
题名
海州湾条斑紫菜养殖对浮游藻类群落结构及遗传多样性的影响
被引量：
3
2
作者
王洪斌
李信书
宋秀梅
吴言
李士虎
阎斌伦
机构
淮海工学院海洋学院
江苏省海洋生物技术重点实验室
出处
《海洋科学》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第12期103-109,共7页
基金
江苏省科技支撑-社会发展项目(BE2011719)
江苏高校优势学科建设工程资助项目
国家级高等学校大学生创新创业训练计划项目(201311641002z)
文摘
为了研究条斑紫菜(Porphyra yezoensis)养殖对江苏海州湾浮游藻类群落结构及遗传多样性的影响,于江苏省海州湾条斑紫菜养殖及非养殖海区各设置4个采样位点,采集表层海水,提取海水中浮游藻类的总DNA,PCR扩增浮游藻类核酮糖1,5-二磷酸羧化/氧化酶大亚基(rbc L)基因片段,构建了养殖及非养殖海区rbc L片段质粒文库。在文库中随机选择50个阳性克隆并测序。经比对分析,在条斑紫菜非养殖区发现8种海洋微藻,隐鞭藻占总克隆数22%,海链藻和骨条藻分别占6%和2%;养殖海区发现10种微藻,其中异丝藻占总克隆数22%,优势度明显,仅3种微藻为二海区共有(骨条藻、隐鞭藻及小球藻),表明紫菜养殖及非养殖区浮游藻类群落组成差异显著。条斑紫菜非养殖区及养殖区的浮游藻类香农指数均值分别为3.273和3.654,均匀度指数均值分别为1.090和1.040,显示养殖区浮游藻类遗传多样性较丰富,而群落的成熟度与稳定性非养殖区高。研究证实,表层海水浮游藻类群落结构及组成是动态的,条斑紫菜的养殖行为形成浮游藻类群落结构及遗传多样性较大差异性。
关键词
条斑紫菜(Porphyra
yezoensis)
浮游藻类
核酮糖l
5-二磷酸羧化/
氧化酶大亚基基因
遗传多样性
Keywords
Porphyra yezoensis
Phytoplankton
Ribulose 1, 5-bisphosphate carboxylase/xidase large subunit gene
Genetic diversity
分类号
Q178.53 [生物学—水生生物学]
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职称材料
题名
胶州湾浮游植物分子遗传多样性初步研究
被引量：
5
3
作者
刘永健
杨官品
门荣新
机构
中国海洋大学海洋生命学院
出处
《青岛海洋大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2003年第6期907-916,共10页
基金
国家自然科学基金项目 (4 0 1 76 0 2 8)
文摘
用聚合酶链式反应扩增海洋浮游植物总体的核酮糖 1 ,5 -二磷酸羧化 /氧化酶大亚基基因(rbc L)片段 ,建立该基因变异类型文库 ,并随机测定了 38个 rbc L大亚基基因片段序列 ,初步分析了海洋浮游植物分子遗传多样性。将≥ 97%的氨基酸序列相似性定义为种内变异 ,38个片段分别代表1 3个不同的物种 ,或称为不同的操作分类单元。与数据库序列比较发现 ,PPJZ0 1 ,PPJZ1 1和 PPJZ2 0可能是已报道的 rbc L基因序列代表的物种 ,其它克隆在数据库中没有对应的近缘物种序列存在。系统学分析表明分离的克隆分别属于隐藻门、硅藻门、绿藻门和 streptophyta等的浮游植物 ,极少数克隆来源于异鞭毛藻类、定鞭藻纲和原细菌。根据各操作分类单元克隆数计算得胶州湾浮游植物分子遗传多样性指数为 1 .97。研究结果为利用分子生物学方法剖分海洋浮游植物群落结构。
关键词
胶州湾
浮游植物
分子遗传多样性
核酮糖1
5-二磷酸羧化/
氧化酶大亚基基因
Keywords
phytoplankton
Ribulose 1, 5 bisphosphate carboxynase/oxygenase large subunit gene
molecular genetic diversity
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
Q344 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
胶州湾浮游植物遗传多样性及其季节变化研究
刘永健
杨官品
管晓菁
门荣新
《海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2005
6
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职称材料
2
海州湾条斑紫菜养殖对浮游藻类群落结构及遗传多样性的影响
王洪斌
李信书
宋秀梅
吴言
李士虎
阎斌伦
《海洋科学》
CAS
CSCD
北大核心
2014
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
胶州湾浮游植物分子遗传多样性初步研究
刘永健
杨官品
门荣新
《青岛海洋大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2003
5
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职称材料
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