比较蛋白质组学揭示茉莉酸甲酯诱导的雷公藤甲素生物合成

1

作者 张逸风 赵瑜君 +4 位作者 苏平 吴晓毅 夏梦 高伟 黄璐琦 《中国现代中药》 CAS 2024年第2期316-327,共12页

目的:探索雷公藤甲素生物合成途径,以提高其产量或用于合成生物学异源生产。方法:使用无标记(lable-free)比较蛋白质组学对茉莉酸甲酯(MeJA)诱导的雷公藤悬浮细胞进行测序,通过京都基因与基因组百科全书(KEGG)、基因本体(GO)分析等方法... 目的:探索雷公藤甲素生物合成途径,以提高其产量或用于合成生物学异源生产。方法:使用无标记(lable-free)比较蛋白质组学对茉莉酸甲酯(MeJA)诱导的雷公藤悬浮细胞进行测序,通过京都基因与基因组百科全书(KEGG)、基因本体(GO)分析等方法,结合基因转录表达分析和基因体内功能研究,逐步筛选参与雷公藤甲素生物合成的功能基因。结果:MeJA诱导不同时间的样品组鉴定得到376个差异蛋白质,包括8个细胞色素P450酶(CYP450)、3个转录因子(TF)和2-氧戊二酸依赖的双加氧酶(2ODD)。其中CYP71BE89、CYP82AQ2和Tw2ODD基因在MeJA诱导及植物不同组织部位中,均与已知参与雷公藤甲素母核环化的二萜合酶TwTPS7(v2)和TwTPS27(v2)基因具有相似的表达模式,表明其可能与雷公藤甲素生物合成相关。进一步利用植物细胞体内功能研究,验证了CYP71BE89、CYP82AQ2和Tw2ODD基因干扰使雷公藤甲素积累分别降低了24.1%、41.4%和71.4%,表明了3个基因与雷公藤甲素生物合成直接相关。结论:利用比较蛋白质组学技术揭示了几种与雷公藤甲素生物合成相关的蛋白,进一步表征了雷公藤甲素生物合成与外源激素刺激之间的关系,并为发掘中药活性成分生物合成途径提供了一种有效方法。 展开更多

关键词 雷公藤 比较蛋白质组学 雷公藤甲素 细胞色素P450酶 2-氧戊二酸依赖的双加氧酶

在线阅读 下载PDF 职称材料

比较蛋白质组学研究进展 被引量：1

2

作者 刘燕 韦强 +1 位作者 鲍国连 季权安 《动物医学进展》 CSCD 2007年第11期58-61,共4页

以双向电泳、生物质谱及生物信息学为主要技术支撑的蛋白质组学是蛋白研究强有力的技术手段。比较蛋白质组学在生物医学方面的研究重点在于对疾病的发病机制、早期诊断及治疗,对致病微生物的致病机理、耐药性及发现新的抗生素,揭示疫苗... 以双向电泳、生物质谱及生物信息学为主要技术支撑的蛋白质组学是蛋白研究强有力的技术手段。比较蛋白质组学在生物医学方面的研究重点在于对疾病的发病机制、早期诊断及治疗,对致病微生物的致病机理、耐药性及发现新的抗生素,揭示疫苗候选和免疫原性成分。文章对比较蛋白质组学相关研究技术方法与特点及其在生物医学研究中的应用进行综述。 展开更多

关键词 比较蛋白质组学 生物医学研究 双向电泳

在线阅读 下载PDF 职称材料

比较蛋白质组学研究技术进展及其在营养代谢病研究中的应用前景 被引量：2

3

作者 郝贵增 徐闯 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2007年第2期378-379,共2页

对经典的比较蛋白质组学研究通路所涉及的各个技术环节的研究进展、改进、提高进行了综述,最后阐述比较蛋白质组学在营养代谢病研究中的应用前景。

关键词 比较蛋白质组学 营养代谢病

在线阅读 下载PDF 职称材料

利用iTRAQ技术对2型糖尿病模型大鼠与正常大鼠的肝脏进行比较蛋白质组学研究 被引量：1

4

作者 秦崇涛 张捷平 +2 位作者 刘如玉 吴世代 施红 《北方药学》 2014年第12期108-109,共2页

目的:研究2型糖尿病模型大鼠与正常大鼠肝脏蛋白表达差异。方法:采用相对和绝对定量同位素标记法(i TRAQ)进行比较蛋白质组学研究。结果:检测到模型组和空白对照组有161个蛋白差异,其中上调的61种,下调的100种。结论:i TRAQ法可以比较2... 目的:研究2型糖尿病模型大鼠与正常大鼠肝脏蛋白表达差异。方法:采用相对和绝对定量同位素标记法(i TRAQ)进行比较蛋白质组学研究。结果:检测到模型组和空白对照组有161个蛋白差异,其中上调的61种,下调的100种。结论:i TRAQ法可以比较2型糖尿病模型大鼠与正常大鼠的肝脏蛋白表达的差异,为后续研究打下基础。 展开更多

关键词 2型糖尿病 比较蛋白质组学研究

在线阅读 下载PDF 职称材料

基于在线二维色谱的不同生长时期鹿茸的比较蛋白质组分析 被引量：7

5

作者 高亮 乔晓强 +3 位作者 梁振 张丽华 霍玉书 张玉奎 《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期146-151,共6页

建立了基于在线二维弱阴离子交换色谱-反相液相色谱(2D-WAX-RPLC)的蛋白质分离系统,并用于不同生长时期鹿茸的比较蛋白质组分析。以5种标准蛋白质的混合物为样品,考察了系统的重现性。通过改变标准蛋白质之间的浓度比,研究了该系统进行... 建立了基于在线二维弱阴离子交换色谱-反相液相色谱(2D-WAX-RPLC)的蛋白质分离系统,并用于不同生长时期鹿茸的比较蛋白质组分析。以5种标准蛋白质的混合物为样品,考察了系统的重现性。通过改变标准蛋白质之间的浓度比,研究了该系统进行蛋白质相对定量的能力。在此基础上,针对4个不同生长时期的鹿茸样品,分别采用5种不同的方法进行蛋白质提取,经2D-WAX-RPLC分离后,收集各生长时期对应蛋白质的峰高最大比超过2的组分。酶解后,采用微柱反相液相色谱-串联质谱(μRPLC-MS/MS)进行肽段的分离鉴定;共从9个差异蛋白质峰中鉴定到了22个差异蛋白质。研究结果表明,利用基于蛋白质水平的在线二维液相色谱分离技术找寻差异蛋白质,具有重现性好、自动化程度高等优点,可用于开展比较蛋白质组学的研究。 展开更多

关键词 在线二维液相色谱 鹿茸 蛋白质组 不同生长时期 比较蛋白质组学

在线阅读 下载PDF 职称材料

比较蛋白质组学及其在辐射损伤生物效应研究中的应用

6

作者 王放 王仲文 左雅慧 《辐射防护通讯》 2007年第3期23-26,共4页

比较蛋白质组学是蛋白质组学的主要研究内容之一,近年来已应用到辐射损伤生物效应领域。本文介绍了比较蛋白质组学的基本概念,适用于比较蛋白质组学研究的几种主要方法及其优缺点,以及在辐射损伤生物效应研究领域中的应用。

关键词 蛋白质组学 比较蛋白质组学 辐射损伤效应

在线阅读 下载PDF 职称材料

感染牛布鲁菌544A的巨噬细胞蛋白质组学分析 被引量：2

7

作者 赵永坤 杨艳玲 +5 位作者 孙春晖 郎需龙 王秀然 王景龙 张瑞 王兴龙 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2012年第5期47-51,共5页

布鲁菌在巨噬细胞内寄生改变了巨噬细胞的很多结构和功能,对牛布鲁菌强毒株544A感染的巨噬细胞和未感染的巨噬细胞全细胞蛋白进行比较蛋白质组学分析,质谱鉴定和生物学信息检索,结果显示,共有13个差异蛋白点,代表了12种蛋白质,这些蛋白... 布鲁菌在巨噬细胞内寄生改变了巨噬细胞的很多结构和功能,对牛布鲁菌强毒株544A感染的巨噬细胞和未感染的巨噬细胞全细胞蛋白进行比较蛋白质组学分析,质谱鉴定和生物学信息检索,结果显示,共有13个差异蛋白点,代表了12种蛋白质,这些蛋白主要参与细胞的代谢,细胞骨架合成,蛋白损伤修复以及基因的转录调控等生物过程。这些蛋白的发现将为进一步研究布鲁菌的感染与致病机制提示方向,同时也为深入探讨病原菌与宿主的相互作用模式奠定了基础。 展开更多

关键词 布鲁菌 小鼠巨噬细胞 比较蛋白质组学 双向电泳 质谱鉴定

在线阅读 下载PDF 职称材料

成年克隆巴马小型猪心脏差异蛋白的鉴定与生物信息学分析 被引量：1

8

作者 张树山 戴建军 +2 位作者 吴彩凤 张廷宇 张德福 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期508-513,共6页

本研究旨在探索体细胞核移植(克隆)操作对克隆巴马小型猪心脏发育的影响。分别提取3头成年克隆猪和3头繁殖猪的心脏蛋白,利用双向电泳-质谱体系的比较蛋白质组学技术进行分离和鉴定,并结合生物信息学手段对部分差异蛋白进行功能分析。... 本研究旨在探索体细胞核移植(克隆)操作对克隆巴马小型猪心脏发育的影响。分别提取3头成年克隆猪和3头繁殖猪的心脏蛋白,利用双向电泳-质谱体系的比较蛋白质组学技术进行分离和鉴定,并结合生物信息学手段对部分差异蛋白进行功能分析。结果表明,与对照猪相比,克隆巴马小型猪的心脏蛋白共有11个差异蛋白,其中5个为上调蛋白,6个为下调蛋白。本试验在蛋白质水平上证实:3头克隆巴马小型猪的心脏均存在一定程度的功能失调。 展开更多

关键词 巴马小型猪 体细胞核移植 心脏 比较蛋白质组学

在线阅读 下载PDF 职称材料

Acidianus manzaensis菌硫氧化相关膜蛋白基因的筛选及鉴定

9

作者 朱薇 马亚龙 杨云 《包装学报》 2018年第1期67-75,共9页

基于比较蛋白质组学的方法,筛选和鉴定了嗜酸热古菌A.manzaensis中与硫氧化相关的膜蛋白。首先利用温度诱导Triton X-114两相分离萃取技术分别对以单质硫(S0)和亚铁(Fe2+)为能源底物生长的A.manzaensis菌的膜蛋白进行选择性分离,再用聚... 基于比较蛋白质组学的方法,筛选和鉴定了嗜酸热古菌A.manzaensis中与硫氧化相关的膜蛋白。首先利用温度诱导Triton X-114两相分离萃取技术分别对以单质硫(S0)和亚铁(Fe2+)为能源底物生长的A.manzaensis菌的膜蛋白进行选择性分离,再用聚丙烯酰胺凝胶电泳和双向电泳对所提取的膜蛋白作进一步分析,最后利用基质辅助激光解吸附电离飞行时间串联质谱对以S0为能源底物下的差异表达膜蛋白斑点进行鉴定,并通过实时荧光定量PCR(RT-q PCR)技术进行初步验证。实验结果表明:A.manzaensis菌在2种不同能源底物下生长时所提取的膜蛋白存在明显的差异,并发现8个与S0氧化相关的膜蛋白,其中,一个未知功能的膜蛋白富含巯基(—SH)及—CXXC—功能域,该膜蛋白可能通过巯基对S0进行键和并生成Pr—SSnH(n≥2)化合物,以协助S0跨膜转运;实验还筛选得到了硫醌氧化还原酶、电子传递蛋白、转录激活蛋白和与细胞生长相关的蛋白,这些膜蛋白在嗜热古菌A.manzaensis氧化S0的过程中起重要作用。 展开更多

关键词 Acidianus manzaensis 硫氧化 膜蛋白 比较蛋白质组学

在线阅读 下载PDF 职称材料

江山白菇F21品系菇根的生化特性分析

10

作者 程小华 汪莹 +3 位作者 戚琴芹 王娅妮 赖童飞 周婷 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2016年第17期90-95,共6页

以金属含量、氨基酸组成、差异表达蛋白以及抗氧化酶活性为指标对江山白菇F_(21)品系菇根的生化组成进行了分析。结果表明:与菇身相比,菇根中粗脂肪、铁、磷以及必需氨基酸中的亮氨酸和赖氨酸含量较低,而灰分、砷、钙和镁元素含量较高;... 以金属含量、氨基酸组成、差异表达蛋白以及抗氧化酶活性为指标对江山白菇F_(21)品系菇根的生化组成进行了分析。结果表明:与菇身相比,菇根中粗脂肪、铁、磷以及必需氨基酸中的亮氨酸和赖氨酸含量较低,而灰分、砷、钙和镁元素含量较高;通过菇根与菇身的比较蛋白质组学分析,共鉴定出9种差异表达蛋白,涉及双组分信号转导系统、乙酰辅酶A代谢、蛋白质合成、乙醛酸及二羧酸代谢、氮代谢多个生物学过程,同时菇根中的菇毒素含量显著低于菇身;货架期菇根中的抗氧化酶活性较低。 展开更多

关键词 江山白菇F21品系 菇根 氨基酸组成 比较蛋白质组学 抗氧化酶活性

在线阅读 下载PDF 职称材料

利用最小二乘法判断同位素标记肽的假阳性

11

作者 宋培明 张扬 +4 位作者 颜志国 骆建华 刘银坤 杨芃原 陈先 《上海交通大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2009年第1期15-18,24,共5页

提出了1种判别标记肽假阳性的方法,根据同位素分布的概率原理计算出不同标记效率下的理论同位素分布,利用最小二乘法拟合得到标记肽的标记效率,根据标记肽的假阳性阈值来判断标记肽的假阳性,并使用本方法判断了比较蛋白质组试验中的3个... 提出了1种判别标记肽假阳性的方法,根据同位素分布的概率原理计算出不同标记效率下的理论同位素分布,利用最小二乘法拟合得到标记肽的标记效率,根据标记肽的假阳性阈值来判断标记肽的假阳性,并使用本方法判断了比较蛋白质组试验中的3个标记肽.结果表明,在这3个标记肽中有2个阳性标记肽结果,1个假阳性标记肽,说明此方法简单可靠,可用于判定标记肽的假阳性,衡量标记肽和正常肽之间的相似性,判断质谱峰型的变化,排除标记肽假阳性对蛋白质定量的影响. 展开更多

关键词 最小二乘法 同位素分布 比较蛋白质组 氨基酸同位素标记定量

在线阅读 下载PDF 职称材料

中国科学家发现中药治疗糖尿病相关认知疾病靶分子

12

《中国现代中药》 CAS 2012年第5期25-25,共1页

近日，《糖尿病学》（Diabetologia）发表了大连医科大学附属第二医院教授战丽彬研究团队关于《中药复方滋补脾阴方药对糖尿病相关认知下降大鼠海马的影响》的文章。首次报道了糖尿病相关认知下降大鼠海马的比较蛋白质组学研究结果，发... 近日，《糖尿病学》（Diabetologia）发表了大连医科大学附属第二医院教授战丽彬研究团队关于《中药复方滋补脾阴方药对糖尿病相关认知下降大鼠海马的影响》的文章。首次报道了糖尿病相关认知下降大鼠海马的比较蛋白质组学研究结果，发现并鉴定了4个可能与发病密切相关的蛋白质及滋补脾阴方药的6个作用靶分子。因此成为该期的封面文章。 展开更多

关键词 糖尿病学 认知下降 靶分子 中国科学家 中药治疗 比较蛋白质组学 滋补脾阴方药 疾病

在线阅读 下载PDF 职称材料