采用比较分子力场分析(Comparative Molecular Field Analysis,CoMFA)和比较分子相似性指数分析(Comparative Molecular Similarity Indices Analysis,CoMSIA),对36种酰肼类及部分磷酸类润滑油添加剂的抗磨性能进行摩擦学三维定量构效...采用比较分子力场分析(Comparative Molecular Field Analysis,CoMFA)和比较分子相似性指数分析(Comparative Molecular Similarity Indices Analysis,CoMSIA),对36种酰肼类及部分磷酸类润滑油添加剂的抗磨性能进行摩擦学三维定量构效关系的研究,在静电场和立体场分别建立添加剂的CoMSIA模型,对比分析2种模型的稳定性和预测能力。结果表明:在静电场构建的CoMSIA模型的预测能力较好,表明分子静电场对该类型类化合物的抗磨性能影响最大;基于该模型构建的三维等高线图可较为直观地解释静电场对化合物抗磨性能的影响,即当官能团或原子的电负性和所在区域性质一致时,抗磨性能最好。因此在特定区域引入带有正电荷或负电荷的基团或原子将有助于提高化合物的抗磨效果。展开更多
利用分子力场分析法(comparative molecular field analysis,CoMFA)、比较分子相似性指数法(comparative molecular similarity indices analysis,CoMSIA)和分子对接方法对一系列喹唑啉类TNKS抑制剂进行三维定量构效关系研究。构建的CoM...利用分子力场分析法(comparative molecular field analysis,CoMFA)、比较分子相似性指数法(comparative molecular similarity indices analysis,CoMSIA)和分子对接方法对一系列喹唑啉类TNKS抑制剂进行三维定量构效关系研究。构建的CoMFA(q^(2)=0.578,r^(2)=0.998,r^(2)_(pred)=0.815)和CoMSIA(q^(2)=0.624,r^(2)=0.929,r^(2)_(pred)=0.747)模型具有良好的鲁棒性、预测能力和机制可解释能力。分子对接实验结果表明:Ser1221和Gly1185是影响这些抑制剂活性的主要氨基酸。研究对设计新型TNKS抑制剂具有参考意义。展开更多
文摘组蛋白去乙酰化酶抑制剂(histone deacetylase inhibitor,HDACi)是近年来治疗癌症的重要靶向药物,其中羟氨酸类,苯甲酰胺类多种药物已进入临床试验阶段,但对于亲电酮类HDACi还有待于进一步研究,本研究应用比较分子力场分析法(comparative molecular field analysis,CoMFA),比较分子相似性指数法(compara-tive similarity indices analysis,CoMSIA)对29个亲电酮类HDAC抑制剂分子进行了定量构效关系分析,CoMFA模型的q2=0.668,r2=0.999;CoMSIA模型的q2=0.686,r2=0.995,所建模型预测能力较好。分子对接(sur-flex-dock)研究也进一步揭示出抑制剂分子与蛋白酶的作用模式,结合其作用模式比较合理地探讨了这类抑制剂的活性原因,为设计新型高效的亲电酮类HDACi提供了理论依据。
文摘采用比较分子力场分析(Comparative Molecular Field Analysis,CoMFA)和比较分子相似性指数分析(Comparative Molecular Similarity Indices Analysis,CoMSIA),对36种酰肼类及部分磷酸类润滑油添加剂的抗磨性能进行摩擦学三维定量构效关系的研究,在静电场和立体场分别建立添加剂的CoMSIA模型,对比分析2种模型的稳定性和预测能力。结果表明:在静电场构建的CoMSIA模型的预测能力较好,表明分子静电场对该类型类化合物的抗磨性能影响最大;基于该模型构建的三维等高线图可较为直观地解释静电场对化合物抗磨性能的影响,即当官能团或原子的电负性和所在区域性质一致时,抗磨性能最好。因此在特定区域引入带有正电荷或负电荷的基团或原子将有助于提高化合物的抗磨效果。
文摘利用分子力场分析法(comparative molecular field analysis,CoMFA)、比较分子相似性指数法(comparative molecular similarity indices analysis,CoMSIA)和分子对接方法对一系列喹唑啉类TNKS抑制剂进行三维定量构效关系研究。构建的CoMFA(q^(2)=0.578,r^(2)=0.998,r^(2)_(pred)=0.815)和CoMSIA(q^(2)=0.624,r^(2)=0.929,r^(2)_(pred)=0.747)模型具有良好的鲁棒性、预测能力和机制可解释能力。分子对接实验结果表明:Ser1221和Gly1185是影响这些抑制剂活性的主要氨基酸。研究对设计新型TNKS抑制剂具有参考意义。
