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带有分子轨道能量的3D-QSAR对N-氨基咪唑的研究(英文)
1
作者
乔颖欣
周家驹
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2006年第2期209-214,共6页
N-氨基咪唑(NAIMs)能通过三种不同的作用方式抑制HIV-1的复制.用比较分子场(CoMFA)方法对一系列有共同骨架的NAIM分子建立3D-QSAR模型.与以往模型不同的是,在偏最小二乘(PLS)分析中尝试引入分子轨道能量的信息来研究生物活性与分子轨道...
N-氨基咪唑(NAIMs)能通过三种不同的作用方式抑制HIV-1的复制.用比较分子场(CoMFA)方法对一系列有共同骨架的NAIM分子建立3D-QSAR模型.与以往模型不同的是,在偏最小二乘(PLS)分析中尝试引入分子轨道能量的信息来研究生物活性与分子轨道能量的关系.结果得到了几个模型,分子轨道能量对模型的贡献能为21.7%,轨道HOMO5对模型的贡献最大.
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关键词
N-氨基咪唑
抑制HIV-1复制
三维定量构效关系
分子
轨道能量
比较分子场方法
MOPAC6/PM3
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职称材料
3D-QSAR和分子对接研究吲哚咔唑类细胞周期蛋白激酶抑制剂的选择性
被引量:
3
2
作者
孙倪悦
陆涛
+3 位作者
陈亚东
郝兰虎
许岩
李瑞君
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2009年第4期645-654,共10页
细胞周期蛋白激酶(cyclin-dependent kinases,CDKs)是近年来治疗肿瘤的重要靶标.由于大多数激酶ATP结合位点的保守性,CDK选择性激酶抑制剂的开发成为当前的研发难点和热点.针对吲哚咔唑类CDK抑制剂,我们采用比较分子力场分析方法(CoMFA...
细胞周期蛋白激酶(cyclin-dependent kinases,CDKs)是近年来治疗肿瘤的重要靶标.由于大多数激酶ATP结合位点的保守性,CDK选择性激酶抑制剂的开发成为当前的研发难点和热点.针对吲哚咔唑类CDK抑制剂,我们采用比较分子力场分析方法(CoMFA)建立了CDK2-QSAR(quantitative structure-activity relationship)和CDK4-QSSR(quantitative structure-selectivity relationship)模型.所建模型的交叉验证系数q2分别为0.722和0.703;非交叉验证系数r2分别为0.977和0.946,表明其具有较好的预测能力.同时,用分子对接的方法分析了这类化合物与CDK4同源模建结构的作用模式,根据这两个模型发现,吲哚咔唑类化合物的R5和R6位长链取代对CDK4的选择性具有一定的影响,而且结合其作用模式比较合理地解释了这类抑制剂的选择性原因,这对CDKs的选择性研究具有一定的指导意义.
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关键词
细胞周期蛋白激酶
吲哚咔唑衍生物
3D-QSAR
3D-QSSR
比较
分子
力
场
分析
方法
分子
对接
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职称材料
部分苯酚化合物对梨型四膜虫毒性的三维定量构效关系
3
作者
刘红艳
刘树深
《桂林工学院学报》
北大核心
2006年第4期538-542,共5页
采用比较分子力场分析描述子表征了133个苯酚类化合物对梨型四膜虫的毒性,从133个化合物中随机选取113个作为训练集建立CoMFA模型,其余的20个化合物作为检验集用于评价模型的预测能力,毒性与立体场和静电场的相互关系用三维等高线图直...
采用比较分子力场分析描述子表征了133个苯酚类化合物对梨型四膜虫的毒性,从133个化合物中随机选取113个作为训练集建立CoMFA模型,其余的20个化合物作为检验集用于评价模型的预测能力,毒性与立体场和静电场的相互关系用三维等高线图直观显示,结果表明苯环上取代基给电子能力的大小和取代基团体积的大小对化合物的毒性均有直接影响.模型的交互验证相关系数(q2)为0.660,相关系数(R2)和标准偏差分别为0.924和0.215,最佳主成分数PC为8,F统计值为158.960,具有较好的预测能力.
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关键词
梨型四膜虫
毒性
比较
分子
力
场
分析
方法
三维定量构效关系
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职称材料
三噁二环辛烷类及相关化合物的CoMFA研究
4
作者
许凌风
郝艳丽
巨修练
《武汉工程大学学报》
CAS
2008年第2期18-23,共6页
为了更好地了解昆虫与哺乳动物GABA受体非竞争性拮抗剂印防己苦毒素位点的结构信息,采用比较分子场分析方法(CoMFA)研究了GABA受体非竞争性拮抗剂三噁二环辛烷类及相关化合物的三维定量构效关系,针对家蝇和大鼠GABA受体,分别得到CoMFA...
为了更好地了解昆虫与哺乳动物GABA受体非竞争性拮抗剂印防己苦毒素位点的结构信息,采用比较分子场分析方法(CoMFA)研究了GABA受体非竞争性拮抗剂三噁二环辛烷类及相关化合物的三维定量构效关系,针对家蝇和大鼠GABA受体,分别得到CoMFA模型的交叉验证相关系q2为0.540和0.738,非交叉验证相关系数r2为0.999和0.924.CoMFA结果表明,家蝇与大鼠GABA受体存在一定的异同点,三噁二环辛烷1位取代基的体积和负电性增加不利于化合物对家蝇GABA受体活性的提高,而三噁二环辛烷4位取代基体积和正电性的增加有利于化合物对大鼠GABA受体活性的提高.
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关键词
GABA受体
拮抗剂
三维定量构效关系研究
比较
分子
场
分析
方法
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职称材料
新型噻唑-2-乙胺类HAT抑制剂的QSAR研究
5
作者
段家喜
赵赛
+1 位作者
易忠胜
聂瑾芳
《桂林理工大学学报》
CAS
北大核心
2018年第3期529-536,共8页
采用VSMVI变量筛选方法从大量描述符中筛选最优子集,再由MLR回归方法建立了83个噻唑-2-乙胺类化合物与非洲人类锥虫病(HAT)抑制活性之间的二维定量结构-活性相关(2D-QSAR)模型,最优模型的拟合相关系数(r^2=0. 889 2)和交叉验证相关系数(...
采用VSMVI变量筛选方法从大量描述符中筛选最优子集,再由MLR回归方法建立了83个噻唑-2-乙胺类化合物与非洲人类锥虫病(HAT)抑制活性之间的二维定量结构-活性相关(2D-QSAR)模型,最优模型的拟合相关系数(r^2=0. 889 2)和交叉验证相关系数(q^2=0. 857 4)表明模型具有良好的稳健性、拟合能力和预测能力。模型的描述符在一定程度上反映了分子的二维结构和疏水性对抑制活性具有重要影响。同时采用基于CoMFA和CoMSIA方法的三维定量结构-活性相关(3D-QSAR)建立了相关性显著、预测能力强的定量模型(CoMFA:r^2=0. 924,q^2=0. 516; CoMSIA:r^2=0. 944,q^2=0. 531),其中CoMSIA的疏水场贡献率最高,说明了分子的疏水作用对抑制活性的重要影响。
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关键词
噻唑-2-乙胺类化合物
非洲人类锥虫病(HAT)
二维定量结构-活性相关(2D-QSAR)
基于变量相互作用的变量筛选
方法
(VSMVI)
比较
分子
场
分析
方法
(CoMFA)
比较
分子
相似性指数分析法(CoMSIA)
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职称材料
题名
带有分子轨道能量的3D-QSAR对N-氨基咪唑的研究(英文)
1
作者
乔颖欣
周家驹
机构
中国科学院过程工程研究所
中国科学院研究生院
出处
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2006年第2期209-214,共6页
文摘
N-氨基咪唑(NAIMs)能通过三种不同的作用方式抑制HIV-1的复制.用比较分子场(CoMFA)方法对一系列有共同骨架的NAIM分子建立3D-QSAR模型.与以往模型不同的是,在偏最小二乘(PLS)分析中尝试引入分子轨道能量的信息来研究生物活性与分子轨道能量的关系.结果得到了几个模型,分子轨道能量对模型的贡献能为21.7%,轨道HOMO5对模型的贡献最大.
关键词
N-氨基咪唑
抑制HIV-1复制
三维定量构效关系
分子
轨道能量
比较分子场方法
MOPAC6/PM3
Keywords
N-aminoimidazoles, Inhibit the replication of HIV-1, 3D-QSAR, Energy of molecular orbitalsCoMFA, MOPAC6/PM3
分类号
O621.13 [理学—有机化学]
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职称材料
题名
3D-QSAR和分子对接研究吲哚咔唑类细胞周期蛋白激酶抑制剂的选择性
被引量:
3
2
作者
孙倪悦
陆涛
陈亚东
郝兰虎
许岩
李瑞君
机构
中国药科大学基础部
出处
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2009年第4期645-654,共10页
文摘
细胞周期蛋白激酶(cyclin-dependent kinases,CDKs)是近年来治疗肿瘤的重要靶标.由于大多数激酶ATP结合位点的保守性,CDK选择性激酶抑制剂的开发成为当前的研发难点和热点.针对吲哚咔唑类CDK抑制剂,我们采用比较分子力场分析方法(CoMFA)建立了CDK2-QSAR(quantitative structure-activity relationship)和CDK4-QSSR(quantitative structure-selectivity relationship)模型.所建模型的交叉验证系数q2分别为0.722和0.703;非交叉验证系数r2分别为0.977和0.946,表明其具有较好的预测能力.同时,用分子对接的方法分析了这类化合物与CDK4同源模建结构的作用模式,根据这两个模型发现,吲哚咔唑类化合物的R5和R6位长链取代对CDK4的选择性具有一定的影响,而且结合其作用模式比较合理地解释了这类抑制剂的选择性原因,这对CDKs的选择性研究具有一定的指导意义.
关键词
细胞周期蛋白激酶
吲哚咔唑衍生物
3D-QSAR
3D-QSSR
比较
分子
力
场
分析
方法
分子
对接
Keywords
Cyclin-dependent kinase
Indolocarbazole derivatives
3D-QSAR
3D-QSSR
CoMFA
Molecular docking
分类号
R91 [医药卫生—药学]
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职称材料
题名
部分苯酚化合物对梨型四膜虫毒性的三维定量构效关系
3
作者
刘红艳
刘树深
机构
桂林工学院材料与化学工程系
出处
《桂林工学院学报》
北大核心
2006年第4期538-542,共5页
基金
广西高校百名中青年学科带头人资助计划项目(桂教人2003[97])
广西"新世纪十百千人才工程"专项资助项目(2003208)
全国优秀博士学位论文作者基金(200355)
文摘
采用比较分子力场分析描述子表征了133个苯酚类化合物对梨型四膜虫的毒性,从133个化合物中随机选取113个作为训练集建立CoMFA模型,其余的20个化合物作为检验集用于评价模型的预测能力,毒性与立体场和静电场的相互关系用三维等高线图直观显示,结果表明苯环上取代基给电子能力的大小和取代基团体积的大小对化合物的毒性均有直接影响.模型的交互验证相关系数(q2)为0.660,相关系数(R2)和标准偏差分别为0.924和0.215,最佳主成分数PC为8,F统计值为158.960,具有较好的预测能力.
关键词
梨型四膜虫
毒性
比较
分子
力
场
分析
方法
三维定量构效关系
Keywords
tetrahymena pyriformis
toxicity
CoMFA
3D-QSAR
分类号
O6-04 [理学—化学]
X13 [环境科学与工程—环境科学]
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职称材料
题名
三噁二环辛烷类及相关化合物的CoMFA研究
4
作者
许凌风
郝艳丽
巨修练
机构
湖北省农药检定管理所
武汉工程大学化工与制药学院湖北省新型反应器与绿色化学工艺重点实验室
出处
《武汉工程大学学报》
CAS
2008年第2期18-23,共6页
文摘
为了更好地了解昆虫与哺乳动物GABA受体非竞争性拮抗剂印防己苦毒素位点的结构信息,采用比较分子场分析方法(CoMFA)研究了GABA受体非竞争性拮抗剂三噁二环辛烷类及相关化合物的三维定量构效关系,针对家蝇和大鼠GABA受体,分别得到CoMFA模型的交叉验证相关系q2为0.540和0.738,非交叉验证相关系数r2为0.999和0.924.CoMFA结果表明,家蝇与大鼠GABA受体存在一定的异同点,三噁二环辛烷1位取代基的体积和负电性增加不利于化合物对家蝇GABA受体活性的提高,而三噁二环辛烷4位取代基体积和正电性的增加有利于化合物对大鼠GABA受体活性的提高.
关键词
GABA受体
拮抗剂
三维定量构效关系研究
比较
分子
场
分析
方法
Keywords
GABAA receptor
antagonist
three-dimensional quantitative structure-activity relationships (3D-QSAR)
comparative molecular field analysis(CoMFA)
分类号
O641 [理学—物理化学]
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职称材料
题名
新型噻唑-2-乙胺类HAT抑制剂的QSAR研究
5
作者
段家喜
赵赛
易忠胜
聂瑾芳
机构
桂林理工大学化学与生物工程学院
桂林理工大学广西高校食品安全与检测重点实验室
桂林理工大学岩溶地区水污染控制与用水安全保障协同创新中心
出处
《桂林理工大学学报》
CAS
北大核心
2018年第3期529-536,共8页
基金
国家自然科学基金项目(21267008
21467006)
+1 种基金
广西自然科学基金项目(2014GXNSFAA118034)
广西高等学校高水平创新团队及卓越学者计划项目(桂教人[2014]49)
文摘
采用VSMVI变量筛选方法从大量描述符中筛选最优子集,再由MLR回归方法建立了83个噻唑-2-乙胺类化合物与非洲人类锥虫病(HAT)抑制活性之间的二维定量结构-活性相关(2D-QSAR)模型,最优模型的拟合相关系数(r^2=0. 889 2)和交叉验证相关系数(q^2=0. 857 4)表明模型具有良好的稳健性、拟合能力和预测能力。模型的描述符在一定程度上反映了分子的二维结构和疏水性对抑制活性具有重要影响。同时采用基于CoMFA和CoMSIA方法的三维定量结构-活性相关(3D-QSAR)建立了相关性显著、预测能力强的定量模型(CoMFA:r^2=0. 924,q^2=0. 516; CoMSIA:r^2=0. 944,q^2=0. 531),其中CoMSIA的疏水场贡献率最高,说明了分子的疏水作用对抑制活性的重要影响。
关键词
噻唑-2-乙胺类化合物
非洲人类锥虫病(HAT)
二维定量结构-活性相关(2D-QSAR)
基于变量相互作用的变量筛选
方法
(VSMVI)
比较
分子
场
分析
方法
(CoMFA)
比较
分子
相似性指数分析法(CoMSIA)
Keywords
amide and urea derivatives of thiazol-2-ethylamines
VSMVI
HAT
2D-QSAR
CoMFA
CoMSIA
分类号
R917 [医药卫生—药物分析学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
带有分子轨道能量的3D-QSAR对N-氨基咪唑的研究(英文)
乔颖欣
周家驹
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2006
0
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职称材料
2
3D-QSAR和分子对接研究吲哚咔唑类细胞周期蛋白激酶抑制剂的选择性
孙倪悦
陆涛
陈亚东
郝兰虎
许岩
李瑞君
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2009
3
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职称材料
3
部分苯酚化合物对梨型四膜虫毒性的三维定量构效关系
刘红艳
刘树深
《桂林工学院学报》
北大核心
2006
0
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职称材料
4
三噁二环辛烷类及相关化合物的CoMFA研究
许凌风
郝艳丽
巨修练
《武汉工程大学学报》
CAS
2008
0
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职称材料
5
新型噻唑-2-乙胺类HAT抑制剂的QSAR研究
段家喜
赵赛
易忠胜
聂瑾芳
《桂林理工大学学报》
CAS
北大核心
2018
0
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