采用比较分子场分析法(comparative molecular field analysis,CoMFA)和比较分子相似性指数分析法(comparative similarity indices analysis,CoMSIA),系统研究了57个CDK4酶抑制剂的三维定量结构-活性关系.所建立CoMFA和CoMSIA模型的交...采用比较分子场分析法(comparative molecular field analysis,CoMFA)和比较分子相似性指数分析法(comparative similarity indices analysis,CoMSIA),系统研究了57个CDK4酶抑制剂的三维定量结构-活性关系.所建立CoMFA和CoMSIA模型的交叉验证系数q2值分别为0.656和0.811,非交叉验证相关系数r2分别为0.954和0.969,都具有较好的预测能力.CoMFA和CoMSIA模型的三维等值图直观地解释了化合物的构效关系,为进一步研究提供了重要依据.展开更多
文摘组蛋白去乙酰化酶抑制剂(histone deacetylase inhibitor,HDACi)是近年来治疗癌症的重要靶向药物,其中羟氨酸类,苯甲酰胺类多种药物已进入临床试验阶段,但对于亲电酮类HDACi还有待于进一步研究,本研究应用比较分子力场分析法(comparative molecular field analysis,CoMFA),比较分子相似性指数法(compara-tive similarity indices analysis,CoMSIA)对29个亲电酮类HDAC抑制剂分子进行了定量构效关系分析,CoMFA模型的q2=0.668,r2=0.999;CoMSIA模型的q2=0.686,r2=0.995,所建模型预测能力较好。分子对接(sur-flex-dock)研究也进一步揭示出抑制剂分子与蛋白酶的作用模式,结合其作用模式比较合理地探讨了这类抑制剂的活性原因,为设计新型高效的亲电酮类HDACi提供了理论依据。
文摘采用比较分子场分析法(comparative molecular field analysis,CoMFA)和比较分子相似性指数分析法(comparative similarity indices analysis,CoMSIA),系统研究了57个CDK4酶抑制剂的三维定量结构-活性关系.所建立CoMFA和CoMSIA模型的交叉验证系数q2值分别为0.656和0.811,非交叉验证相关系数r2分别为0.954和0.969,都具有较好的预测能力.CoMFA和CoMSIA模型的三维等值图直观地解释了化合物的构效关系,为进一步研究提供了重要依据.
