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基于比对相似度动态矩阵聚类算法在基因序列中的应用
被引量:
1
1
作者
张白妮
骆嘉伟
汤德佑
《计算机应用》
CSCD
北大核心
2004年第8期35-37,共3页
基于BAG图的聚类算法 ,利用聚类单元引导类的分割 ,保证聚类结果不会产生过多的类碎片 ,但其相似分数阈值Cutoff初始值和最长公共子串最小长度阈值Threshold如何确定并没有明确给出。提出基于比对相似度动态矩阵的聚类算法 ,并在此基础...
基于BAG图的聚类算法 ,利用聚类单元引导类的分割 ,保证聚类结果不会产生过多的类碎片 ,但其相似分数阈值Cutoff初始值和最长公共子串最小长度阈值Threshold如何确定并没有明确给出。提出基于比对相似度动态矩阵的聚类算法 ,并在此基础上明确给出了确定cutoff初始值和Threshold阈值的方法。实验结果表明该算法可以获得较好的聚类正确率。
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关键词
生物序列
聚类
最长公共子串
比对相似度动态矩阵
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职称材料
题名
基于比对相似度动态矩阵聚类算法在基因序列中的应用
被引量:
1
1
作者
张白妮
骆嘉伟
汤德佑
机构
湖南大学计算机与通信学院
出处
《计算机应用》
CSCD
北大核心
2004年第8期35-37,共3页
基金
湖南省自然科学基金项目 (0 3JJY30 95)
文摘
基于BAG图的聚类算法 ,利用聚类单元引导类的分割 ,保证聚类结果不会产生过多的类碎片 ,但其相似分数阈值Cutoff初始值和最长公共子串最小长度阈值Threshold如何确定并没有明确给出。提出基于比对相似度动态矩阵的聚类算法 ,并在此基础上明确给出了确定cutoff初始值和Threshold阈值的方法。实验结果表明该算法可以获得较好的聚类正确率。
关键词
生物序列
聚类
最长公共子串
比对相似度动态矩阵
Keywords
biology sequences
clustering
longest common child string
SZDM(Similar Zscores Dynamic Matrix)
分类号
TP391.4 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
基于比对相似度动态矩阵聚类算法在基因序列中的应用
张白妮
骆嘉伟
汤德佑
《计算机应用》
CSCD
北大核心
2004
1
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