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高效液相色谱-串联质谱法结合稳定同位素标记肽段同时测定稻米及其制品中3种过敏蛋白质
被引量:
5
1
作者
杨欢
曹赵云
+1 位作者
马有宁
陈铭学
《色谱》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第12期1314-1323,共10页
基于稳定同位素标记特征肽段和液相色谱-质谱联用仪建立稻米及制品中3种过敏蛋白质的同时定量方法。稻米及制品样品经盐溶液提取,赖氨酰基内切酶(Lys-C)和胰蛋白酶依次水解,C18-SD柱净化后,采用纳升高效液相色谱-线性离子阱-静电场轨道...
基于稳定同位素标记特征肽段和液相色谱-质谱联用仪建立稻米及制品中3种过敏蛋白质的同时定量方法。稻米及制品样品经盐溶液提取,赖氨酰基内切酶(Lys-C)和胰蛋白酶依次水解,C18-SD柱净化后,采用纳升高效液相色谱-线性离子阱-静电场轨道阱(NanoLC-LTQ-Orbitrap)采集和Protein Discovery软件鉴定,NCBI和Uniprot数据库的基本局部搜索比对工具(BLAST)筛选验证,最终获得表征稻米及制品中α-淀粉酶/胰蛋白酶抑制剂类蛋白质(seed allergenic protein RAG2,RAG2)、乙二醛酶Ⅰ活性蛋白(glyoxalaseⅠ)和α-球蛋白(19 kDa globulin)3种过敏蛋白质的特异性肽段。3个特异性肽段经液相色谱梯度洗脱,在Poroshell色谱柱上实现完全分离,由三重四极杆质谱仪分析。实验通过优化多反应监测(MRM)质谱参数,比较不同溶剂体系、水解酶种类和酶量等酶解条件,结合内标法定量,实现对稻米及制品中3种蛋白质的绝对定量。实验结果表明,当酶解溶剂中含1 g/L十二烷基硫酸钠,采用Lys-C和胰蛋白酶组合消化策略,可有效提高3种蛋白质的酶切效率至65.7%~97.3%。该方法在1~200 nmol/L范围内线性关系良好,相关系数均大于0.9972,3种蛋白质的检出限和定量限分别为3 mg/kg和10 mg/kg。3种蛋白质在空白稻米制品基质中3个水平下的加标回收率为80.6%~103.7%,日间和日内精密度均小于11.5%。该方法稳定性好,检测灵敏度高,操作简便,在分析各类稻米及制品中3种过敏蛋白质含量具有广泛的应用前景。
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关键词
液相色谱-串联质谱
特异性肽
段
稳定同位素
标记
肽
段
酶解条件
过敏蛋白质
稻米
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职称材料
一种基于连通域标记的纸病检测算法
被引量:
9
2
作者
赵晓
何立风
+2 位作者
姚斌
高启航
杨云
《中国造纸学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第2期51-56,共6页
提出了一种基于段的连通域标记处理算法,同时对纸病区域进行连通域标记和形状特征值提取,旨在提高纸病检测的准确率和效率。该算法利用纸病区域为简单连通图像的特点,采用段技术实现了纸病区域的标记处理,探讨了在标记处理同时快速统计...
提出了一种基于段的连通域标记处理算法,同时对纸病区域进行连通域标记和形状特征值提取,旨在提高纸病检测的准确率和效率。该算法利用纸病区域为简单连通图像的特点,采用段技术实现了纸病区域的标记处理,探讨了在标记处理同时快速统计与形状特征值计算有关的中间参数的方法,利用标记结果及形状特征值实现了纸病的快速检测。该算法优化了标记处理与形状特征值提取的过程,减少了纸病图像的扫描次数。结果表明,该算法达到了准确、快速的纸病检测效果,且易于扩展到实际的纸病检测系统中。
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关键词
连通域
标记
段标记
形状特征提取
纸病检测
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职称材料
毛细管反相液相色谱-串联质谱用于肽的鉴定和相对定量分析
被引量:
3
3
作者
厉欣
江新宁
邹汉法
《色谱》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第2期189-194,共6页
建立了一种基于毛细管反相液相色谱-串联质谱联用技术和质谱峰强度数据处理的肽段鉴定和相对定量分析方法。该方法无需对样品中的肽进行化学标记,在对样品进行反相色谱分离和串联质谱分析后,将二级质谱扫描数据进行蛋白质数据库搜索,获...
建立了一种基于毛细管反相液相色谱-串联质谱联用技术和质谱峰强度数据处理的肽段鉴定和相对定量分析方法。该方法无需对样品中的肽进行化学标记,在对样品进行反相色谱分离和串联质谱分析后,将二级质谱扫描数据进行蛋白质数据库搜索,获得所鉴定肽段的序列、保留时间、质荷比、带电荷数等定性信息;再以此为定位依据,在全扫描质谱数据中提取该肽段对应的离子峰并以该离子峰的峰强度作为定量信息,从而实现对不同样品中的共有肽段进行差异比较分析。以标准蛋白酶解混合肽段为实验对象,以肽段相对强度的相对标准偏差为指标,考察了该方法用于肽段相对定量分析的重现性、检测动态范围以及浓度标准曲线等,为将该方法用于生物样品中内源性肽的差异分析奠定了基础。
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关键词
液相色谱-质谱联用
无
标记
肽
段
定量
蛋白质组学
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职称材料
题名
高效液相色谱-串联质谱法结合稳定同位素标记肽段同时测定稻米及其制品中3种过敏蛋白质
被引量:
5
1
作者
杨欢
曹赵云
马有宁
陈铭学
机构
农业农村部稻米及制品监督检验测试中心
江西农业大学
出处
《色谱》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第12期1314-1323,共10页
基金
稻米质量安全高通量检测技术研究(CPSIBRF-CNRRI-202128)
国家水稻产业技术体系(CARS-01-47)
中国农业科学院科技创新工程协同创新任务(CAAS-XTCX2019024).
文摘
基于稳定同位素标记特征肽段和液相色谱-质谱联用仪建立稻米及制品中3种过敏蛋白质的同时定量方法。稻米及制品样品经盐溶液提取,赖氨酰基内切酶(Lys-C)和胰蛋白酶依次水解,C18-SD柱净化后,采用纳升高效液相色谱-线性离子阱-静电场轨道阱(NanoLC-LTQ-Orbitrap)采集和Protein Discovery软件鉴定,NCBI和Uniprot数据库的基本局部搜索比对工具(BLAST)筛选验证,最终获得表征稻米及制品中α-淀粉酶/胰蛋白酶抑制剂类蛋白质(seed allergenic protein RAG2,RAG2)、乙二醛酶Ⅰ活性蛋白(glyoxalaseⅠ)和α-球蛋白(19 kDa globulin)3种过敏蛋白质的特异性肽段。3个特异性肽段经液相色谱梯度洗脱,在Poroshell色谱柱上实现完全分离,由三重四极杆质谱仪分析。实验通过优化多反应监测(MRM)质谱参数,比较不同溶剂体系、水解酶种类和酶量等酶解条件,结合内标法定量,实现对稻米及制品中3种蛋白质的绝对定量。实验结果表明,当酶解溶剂中含1 g/L十二烷基硫酸钠,采用Lys-C和胰蛋白酶组合消化策略,可有效提高3种蛋白质的酶切效率至65.7%~97.3%。该方法在1~200 nmol/L范围内线性关系良好,相关系数均大于0.9972,3种蛋白质的检出限和定量限分别为3 mg/kg和10 mg/kg。3种蛋白质在空白稻米制品基质中3个水平下的加标回收率为80.6%~103.7%,日间和日内精密度均小于11.5%。该方法稳定性好,检测灵敏度高,操作简便,在分析各类稻米及制品中3种过敏蛋白质含量具有广泛的应用前景。
关键词
液相色谱-串联质谱
特异性肽
段
稳定同位素
标记
肽
段
酶解条件
过敏蛋白质
稻米
Keywords
liquid chromatography-tandem mass spectrometry(LC-MS/MS)
signature peptide
stable isotope-labeled peptide
digest condition
allergenic protein
rice
分类号
O658 [理学—分析化学]
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职称材料
题名
一种基于连通域标记的纸病检测算法
被引量:
9
2
作者
赵晓
何立风
姚斌
高启航
杨云
机构
陕西科技大学电气与信息工程学院人工智能研究所
爱知县立大学信息科学学院
出处
《中国造纸学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第2期51-56,共6页
基金
国家自然基金项目(61601271
61471227
+2 种基金
61603234)
陕西省科技项目(2016SF-444)
陕西省教育厅科研项目(16JK1087)
文摘
提出了一种基于段的连通域标记处理算法,同时对纸病区域进行连通域标记和形状特征值提取,旨在提高纸病检测的准确率和效率。该算法利用纸病区域为简单连通图像的特点,采用段技术实现了纸病区域的标记处理,探讨了在标记处理同时快速统计与形状特征值计算有关的中间参数的方法,利用标记结果及形状特征值实现了纸病的快速检测。该算法优化了标记处理与形状特征值提取的过程,减少了纸病图像的扫描次数。结果表明,该算法达到了准确、快速的纸病检测效果,且易于扩展到实际的纸病检测系统中。
关键词
连通域
标记
段标记
形状特征提取
纸病检测
Keywords
connected-component labeling
run-based method
shape feature extraction
paper defect detection
分类号
TP39 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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职称材料
题名
毛细管反相液相色谱-串联质谱用于肽的鉴定和相对定量分析
被引量:
3
3
作者
厉欣
江新宁
邹汉法
机构
中国科学院大连化学物理研究所国家色谱研究分析中心
出处
《色谱》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第2期189-194,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(No.20675081)
文摘
建立了一种基于毛细管反相液相色谱-串联质谱联用技术和质谱峰强度数据处理的肽段鉴定和相对定量分析方法。该方法无需对样品中的肽进行化学标记,在对样品进行反相色谱分离和串联质谱分析后,将二级质谱扫描数据进行蛋白质数据库搜索,获得所鉴定肽段的序列、保留时间、质荷比、带电荷数等定性信息;再以此为定位依据,在全扫描质谱数据中提取该肽段对应的离子峰并以该离子峰的峰强度作为定量信息,从而实现对不同样品中的共有肽段进行差异比较分析。以标准蛋白酶解混合肽段为实验对象,以肽段相对强度的相对标准偏差为指标,考察了该方法用于肽段相对定量分析的重现性、检测动态范围以及浓度标准曲线等,为将该方法用于生物样品中内源性肽的差异分析奠定了基础。
关键词
液相色谱-质谱联用
无
标记
肽
段
定量
蛋白质组学
Keywords
liquid chromatography-tandem mass spectrometry(LC-MS/MS)
label-free peptide quantification
proteomics
分类号
O658 [理学—分析化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
高效液相色谱-串联质谱法结合稳定同位素标记肽段同时测定稻米及其制品中3种过敏蛋白质
杨欢
曹赵云
马有宁
陈铭学
《色谱》
CAS
CSCD
北大核心
2021
5
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职称材料
2
一种基于连通域标记的纸病检测算法
赵晓
何立风
姚斌
高启航
杨云
《中国造纸学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
9
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
毛细管反相液相色谱-串联质谱用于肽的鉴定和相对定量分析
厉欣
江新宁
邹汉法
《色谱》
CAS
CSCD
北大核心
2008
3
在线阅读
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职称材料
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