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陆地棉果胶甲酯酶GhPME6的克隆及功能分析
1
作者
王琳
商海红
+7 位作者
李俊文
王少干
刘爱英
石玉真
龚举武
巩万奎
陈婷婷
袁有禄
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2014年第5期438-444,共7页
结合陆地棉SSH-cDNA文库的测序结果,与棉花EST数据库进行序列比对和分析,获得1条在棉纤维次生壁加厚期特异表达的EST序列,该序列编码果胶甲酯酶(PME)。利用RACE技术获得其全长cDNA序列,命名为GhPME6。基因结构分析表明,GhPME6包含1个长...
结合陆地棉SSH-cDNA文库的测序结果,与棉花EST数据库进行序列比对和分析,获得1条在棉纤维次生壁加厚期特异表达的EST序列,该序列编码果胶甲酯酶(PME)。利用RACE技术获得其全长cDNA序列,命名为GhPME6。基因结构分析表明,GhPME6包含1个长度为1560 bp的开放阅读框、2个外显子和1个内含子,编码含有519个氨基酸的蛋白。其氨基酸序列具有PMEI和Pectinesterase两个保守结构域。通过对不同棉属基因组中的PME6基因进行比对分析,发现PME6在进化过程中具有高度保守性。qRT-PCR分析显示,GhPME6在纤维发育次生壁加厚期大量表达,推测该基因可能对棉纤维比强度有重要影响。构建GhPME6基因的大肠杆菌表达体系,获得与预期大小一致的目的蛋白,为深入研究GhPME6对棉纤维比强度的影响奠定了基础。
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关键词
棉纤维
次生壁加厚
果胶甲酯酶
比强度
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职称材料
题名
陆地棉果胶甲酯酶GhPME6的克隆及功能分析
1
作者
王琳
商海红
李俊文
王少干
刘爱英
石玉真
龚举武
巩万奎
陈婷婷
袁有禄
机构
华中农业大学生命科学技术学院
中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室
出处
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2014年第5期438-444,共7页
基金
国家自然科学基金(31000732)
国家973计划(2010CB126006)
文摘
结合陆地棉SSH-cDNA文库的测序结果,与棉花EST数据库进行序列比对和分析,获得1条在棉纤维次生壁加厚期特异表达的EST序列,该序列编码果胶甲酯酶(PME)。利用RACE技术获得其全长cDNA序列,命名为GhPME6。基因结构分析表明,GhPME6包含1个长度为1560 bp的开放阅读框、2个外显子和1个内含子,编码含有519个氨基酸的蛋白。其氨基酸序列具有PMEI和Pectinesterase两个保守结构域。通过对不同棉属基因组中的PME6基因进行比对分析,发现PME6在进化过程中具有高度保守性。qRT-PCR分析显示,GhPME6在纤维发育次生壁加厚期大量表达,推测该基因可能对棉纤维比强度有重要影响。构建GhPME6基因的大肠杆菌表达体系,获得与预期大小一致的目的蛋白,为深入研究GhPME6对棉纤维比强度的影响奠定了基础。
关键词
棉纤维
次生壁加厚
果胶甲酯酶
比强度
Keywords
cotton fiber
secondary cell wall thickening
pectin methylesterases
fiber strength
分类号
S562 [农业科学—作物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
陆地棉果胶甲酯酶GhPME6的克隆及功能分析
王琳
商海红
李俊文
王少干
刘爱英
石玉真
龚举武
巩万奎
陈婷婷
袁有禄
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2014
0
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