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一种模糊相似关系的基因表达数据聚类方法
被引量：
2
1
作者
姜永森
陆媛
杨慧中
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2011年第8期236-238,共3页
对于时间序列的基因表达数据,传统的聚类算法都是以距离为相似性度量标准,没有考虑基因随时间变化的相似趋势。从基因变化的趋势出发,构造了一种新的模糊相似关系矩阵,提出了改进的基于模糊相似关系的聚类算法,并以该算法计算FCM的初始...
对于时间序列的基因表达数据,传统的聚类算法都是以距离为相似性度量标准,没有考虑基因随时间变化的相似趋势。从基因变化的趋势出发,构造了一种新的模糊相似关系矩阵,提出了改进的基于模糊相似关系的聚类算法,并以该算法计算FCM的初始聚类中心。将该方法应用在酵母菌基因表达数据中,实验结果表明该算法不仅克服了FCM算法易陷入局部极小值、对初值敏感的缺点,而且能够发现一些表达模式变化趋势相似的共调控基因。
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关键词
模糊相似关系矩阵
聚类中心
模糊
C均值聚类(FCM)算法
时序基因表达数据
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职称材料
题名
一种模糊相似关系的基因表达数据聚类方法
被引量：
2
1
作者
姜永森
陆媛
杨慧中
机构
北华大学科研处
江南大学物联网工程学院
出处
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2011年第8期236-238,共3页
基金
国家自然科学基金(No.60674029)~~
文摘
对于时间序列的基因表达数据,传统的聚类算法都是以距离为相似性度量标准,没有考虑基因随时间变化的相似趋势。从基因变化的趋势出发,构造了一种新的模糊相似关系矩阵,提出了改进的基于模糊相似关系的聚类算法,并以该算法计算FCM的初始聚类中心。将该方法应用在酵母菌基因表达数据中,实验结果表明该算法不仅克服了FCM算法易陷入局部极小值、对初值敏感的缺点,而且能够发现一些表达模式变化趋势相似的共调控基因。
关键词
模糊相似关系矩阵
聚类中心
模糊
C均值聚类(FCM)算法
时序基因表达数据
Keywords
fuzzy similar relation matrix cluster centers Fuzzy C-Means（FCM） algorithm time series gene expression data
分类号
TP391 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一种模糊相似关系的基因表达数据聚类方法
姜永森
陆媛
杨慧中
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2011
2
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引证文献
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