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题名概率决策树在生物信息数据库中的一个应用
被引量:1
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作者
彭政
鲁鸣鸣
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机构
复旦大学计算机科学与工程系
复旦大学智能信息处理实验室
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出处
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2004年第25期167-170,共4页
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基金
国家自然科学基金项目(编号:60273045)
科学技术部基础研究重大项目前期研究项目(编号:2001CCA0300)
上海市科技发展基金项目(编号:025115032)资助
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文摘
GO(GeneOntology)是个标准化的生物信息本体库,被广泛地用来注释基因数据库,然而由于GO结构设计上的缺陷以及目前对基因数据库注释方法多采用手工方式,再加上基因的许多特性尚未发现,使得这种注释还不完全。该文尝试用概率决策树的方法来学习得到基因和GO本体的内在联系,进而预测基因的本体注释情况,也就是预测基因的未知特性,这样就可以引导基因数据库管理员去完善,修正基因数据库的本体注释,并指导生物学家有针对性地设计试验。作为一个应用,用MGI基因数据数据库做试验,分析表明用该方法得到的预测结果准确性比较高。
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关键词
机器学习
概率决策树
本体
生物信息
基因
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Keywords
machine learning,probabilistic decision tree,Ontology,bioinformatics,Gene
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分类号
TP311.13
[自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
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