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正常与退变椎间盘纤维环细胞相关基因的差异表达
被引量：
6
1
作者
叶冬平
梁伟国
+2 位作者
戴丽冰
沈雁
陈鸿辉
《中国病理生理杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第1期168-172,共5页
目的:研究人正常和退变椎间盘纤维环细胞椎间盘退变相关基因表达量的差异,探讨这些相关基因与椎间盘退变的关系,筛选明显差异基因作为退变纤维环细胞体外刺激因子,逆转椎间盘退变。方法:实时荧光定量PCR(real-time qRT-PCR,SYBR Green)...
目的:研究人正常和退变椎间盘纤维环细胞椎间盘退变相关基因表达量的差异,探讨这些相关基因与椎间盘退变的关系,筛选明显差异基因作为退变纤维环细胞体外刺激因子,逆转椎间盘退变。方法:实时荧光定量PCR(real-time qRT-PCR,SYBR Green)技术检测人正常和退变纤维环细胞TGF-β、IGF-1、bFGF、IL-1、TIMP-1、COL1A1、BMP-14、PDGF、aggrecan、COL2A1、SOX 9、BMP-2、iNOS、EGF、MMP3、BMP-4和BMP-7mRNA表达水平。结果:与正常纤维环细胞相比,退变纤维环细胞TGF-β、IL-1、PDGF和IGF-1 mRNA表达量降低(P<0.01,P<0.05);bFGF、TIMP-1、BMP-14和COL1A1 mRNA表达升量高(P<0.01);正常纤维环细胞aggrecan和BMP-2 mRNA高表达,退变纤维环细胞两者表达阴性;COL2A1、iNOS和MMP3在正常纤维环细胞mR-NA有表达,在退变纤维环细胞表达阴性;EGF在正常纤维环细胞mRNA表达阴性,而在退变纤维环细胞有表达。Sox-9、BMP-4和BMP-7在正常和退变纤维环细胞mRNA表达均为阴性。结论:椎间盘纤维环退变与TGF-β、IL-1、PDGF、IGF-1、aggrecan和BMP-2 mRNA低表达,bFGF、TIMP-1、BMP-14和COL1A1 mRNA高表达相关;BMP-2、TGF-β、PDGF和IGF-1可作为退变纤维环细胞体外刺激因子,用于逆转椎间盘退变的研究;bFGF、TIMP-1和BMP-14可能是椎间盘纤维环细胞退变的标志物。
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关键词
正常纤维环细胞
退
变
纤维环细胞
差异表达
椎间盘
退
变
相关
基因
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职称材料
山羊椎间盘退变相关基因Sox9密码子偏爱性分析
2
作者
马建青
吴占勇
+4 位作者
李祥龙
孔建军
吴春富
徐增年
于晶晶
《家畜生态学报》
北大核心
2019年第12期14-21,共8页
为了明确Sox9基因密码子的使用特征,揭示山羊和其他物种Sox9基因的进化规律,为建立骨科腰椎间盘退变动物模型提供基础研究试验依据,此研究利用生物信息学软件CodonW、Usage Codon和DNAMAN分析山羊Sox9基因完全编码区密码子偏爱性,比较...
为了明确Sox9基因密码子的使用特征,揭示山羊和其他物种Sox9基因的进化规律,为建立骨科腰椎间盘退变动物模型提供基础研究试验依据,此研究利用生物信息学软件CodonW、Usage Codon和DNAMAN分析山羊Sox9基因完全编码区密码子偏爱性,比较不同物种Sox9基因密码子偏爱指标,基于完整编码区序列生成了亲缘关系进化聚类图,计算出每个物种Sox9基因的总变异值。分析显示山羊Sox9基因中有26个偏好使用密码子以G/C为第三位碱基;夜猴、家犬、原鸡、大猩猩、人、恒河猴、小家鼠、家兔、绵羊、黑猩猩、婆罗洲猩猩和褐家鼠等12个物种在密码子使用上与山羊Sox9基因基本相似,但是在编码丙氨酸、脯氨酸和苏氨酸等个别氨基酸时,原鸡和小家鼠及褐家鼠与其他物种的密码子偏爱性存在差异。Sox9基因偏好使用以G/C结尾的密码子。亲缘关系进化聚类图和不同物种RSCU值显示Sox9基因密码子偏好性与亲缘关系的远近存在关联性。
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关键词
山羊
椎间盘退变基因
SOX9
基因
密码子偏好性
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职称材料
题名
正常与退变椎间盘纤维环细胞相关基因的差异表达
被引量：
6
1
作者
叶冬平
梁伟国
戴丽冰
沈雁
陈鸿辉
机构
暨南大学医学院第四附属医院
广州市红十字会医院广州市创伤外科研究所
出处
《中国病理生理杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第1期168-172,共5页
基金
广东省自然科学基金资助项目(No.10151022001000005
No.S2011010000910)
+1 种基金
广州市医药卫生科技重点项目(No.2008-ZDi-15
No.2009-ZDi-04)
文摘
目的:研究人正常和退变椎间盘纤维环细胞椎间盘退变相关基因表达量的差异,探讨这些相关基因与椎间盘退变的关系,筛选明显差异基因作为退变纤维环细胞体外刺激因子,逆转椎间盘退变。方法:实时荧光定量PCR(real-time qRT-PCR,SYBR Green)技术检测人正常和退变纤维环细胞TGF-β、IGF-1、bFGF、IL-1、TIMP-1、COL1A1、BMP-14、PDGF、aggrecan、COL2A1、SOX 9、BMP-2、iNOS、EGF、MMP3、BMP-4和BMP-7mRNA表达水平。结果:与正常纤维环细胞相比,退变纤维环细胞TGF-β、IL-1、PDGF和IGF-1 mRNA表达量降低(P<0.01,P<0.05);bFGF、TIMP-1、BMP-14和COL1A1 mRNA表达升量高(P<0.01);正常纤维环细胞aggrecan和BMP-2 mRNA高表达,退变纤维环细胞两者表达阴性;COL2A1、iNOS和MMP3在正常纤维环细胞mR-NA有表达,在退变纤维环细胞表达阴性;EGF在正常纤维环细胞mRNA表达阴性,而在退变纤维环细胞有表达。Sox-9、BMP-4和BMP-7在正常和退变纤维环细胞mRNA表达均为阴性。结论:椎间盘纤维环退变与TGF-β、IL-1、PDGF、IGF-1、aggrecan和BMP-2 mRNA低表达,bFGF、TIMP-1、BMP-14和COL1A1 mRNA高表达相关;BMP-2、TGF-β、PDGF和IGF-1可作为退变纤维环细胞体外刺激因子,用于逆转椎间盘退变的研究;bFGF、TIMP-1和BMP-14可能是椎间盘纤维环细胞退变的标志物。
关键词
正常纤维环细胞
退
变
纤维环细胞
差异表达
椎间盘
退
变
相关
基因
Keywords
Normal annulus fibrosus cells
Degenerative annulus fibrosus cells
Differential expression
Intervertebral disc degeneration-related genes
分类号
R363 [医药卫生—病理学]
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职称材料
题名
山羊椎间盘退变相关基因Sox9密码子偏爱性分析
2
作者
马建青
吴占勇
李祥龙
孔建军
吴春富
徐增年
于晶晶
机构
冀中能源邢台矿业集团总医院动物实验室
邢台市骨科研究所动物实验室
河北农业大学动物科技学院
河北医科大学实验动物学部
邢台市第三医院腺体外科
出处
《家畜生态学报》
北大核心
2019年第12期14-21,共8页
基金
邢台市科技支撑计划项目(2018ZC121)
文摘
为了明确Sox9基因密码子的使用特征,揭示山羊和其他物种Sox9基因的进化规律,为建立骨科腰椎间盘退变动物模型提供基础研究试验依据,此研究利用生物信息学软件CodonW、Usage Codon和DNAMAN分析山羊Sox9基因完全编码区密码子偏爱性,比较不同物种Sox9基因密码子偏爱指标,基于完整编码区序列生成了亲缘关系进化聚类图,计算出每个物种Sox9基因的总变异值。分析显示山羊Sox9基因中有26个偏好使用密码子以G/C为第三位碱基;夜猴、家犬、原鸡、大猩猩、人、恒河猴、小家鼠、家兔、绵羊、黑猩猩、婆罗洲猩猩和褐家鼠等12个物种在密码子使用上与山羊Sox9基因基本相似,但是在编码丙氨酸、脯氨酸和苏氨酸等个别氨基酸时,原鸡和小家鼠及褐家鼠与其他物种的密码子偏爱性存在差异。Sox9基因偏好使用以G/C结尾的密码子。亲缘关系进化聚类图和不同物种RSCU值显示Sox9基因密码子偏好性与亲缘关系的远近存在关联性。
关键词
山羊
椎间盘退变基因
SOX9
基因
密码子偏好性
Keywords
Capra hircus
intervertebral disc degeneration related gene
Sox9 gene
codon bias
分类号
S811.5 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
正常与退变椎间盘纤维环细胞相关基因的差异表达
叶冬平
梁伟国
戴丽冰
沈雁
陈鸿辉
《中国病理生理杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2012
6
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职称材料
2
山羊椎间盘退变相关基因Sox9密码子偏爱性分析
马建青
吴占勇
李祥龙
孔建军
吴春富
徐增年
于晶晶
《家畜生态学报》
北大核心
2019
0
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