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东北虎豹国家公园植物DNA微条形码数据库
被引量：
2
1
作者
吴峰
温佩颖
+5 位作者
唐志珍
李青鉴
朱頔
王天明
葛剑平
王红芳
《北京师范大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期623-628,共6页
DNA宏条形码技术已成为环境DNA分析的常用手段,选择合适的引物并建立本地微条形码数据库,对于环境DNA结果的进一步探究十分重要.本文通过数字模拟PCR技术,对食草动物环境DNA研究中常用的3个微条形码进行比较,发现psbCL具有最高或略低于...
DNA宏条形码技术已成为环境DNA分析的常用手段,选择合适的引物并建立本地微条形码数据库,对于环境DNA结果的进一步探究十分重要.本文通过数字模拟PCR技术,对食草动物环境DNA研究中常用的3个微条形码进行比较,发现psbCL具有最高或略低于最高的覆盖度和分辨率,在环境DNA分析中推荐优先使用.利用psbCL建立了东北虎豹国家公园本地微条形码库,同时利用psbCL扩增梅花鹿粪便中的进食物种,以比较本地微条形码库和公共数据库在物种鉴别能力方面的差异.结果表明,本地数据库在属和种水平均提高了鉴别能力.因此,本研究推荐环境DNA分析中建立本地微条形码库,以提高研究的精度,本研究所建立的东北虎豹国家公园植物DNA微条形码数据库也将为未来高精度的环境DNA分析提供基础.
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关键词
植物dna微条形码
环境
dna
dna
宏
条形码
条形码
数据库
psbCL
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职称材料
题名
东北虎豹国家公园植物DNA微条形码数据库
被引量：
2
1
作者
吴峰
温佩颖
唐志珍
李青鉴
朱頔
王天明
葛剑平
王红芳
机构
生物多样性与生态工程教育部重点实验室
出处
《北京师范大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期623-628,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(32071494)。
文摘
DNA宏条形码技术已成为环境DNA分析的常用手段,选择合适的引物并建立本地微条形码数据库,对于环境DNA结果的进一步探究十分重要.本文通过数字模拟PCR技术,对食草动物环境DNA研究中常用的3个微条形码进行比较,发现psbCL具有最高或略低于最高的覆盖度和分辨率,在环境DNA分析中推荐优先使用.利用psbCL建立了东北虎豹国家公园本地微条形码库,同时利用psbCL扩增梅花鹿粪便中的进食物种,以比较本地微条形码库和公共数据库在物种鉴别能力方面的差异.结果表明,本地数据库在属和种水平均提高了鉴别能力.因此,本研究推荐环境DNA分析中建立本地微条形码库,以提高研究的精度,本研究所建立的东北虎豹国家公园植物DNA微条形码数据库也将为未来高精度的环境DNA分析提供基础.
关键词
植物dna微条形码
环境
dna
dna
宏
条形码
条形码
数据库
psbCL
Keywords
plant
dna
mini-barcode
environmental
dna
dna
metabarcoding
barcode libraries
psbCL
分类号
Q943 [生物学—植物学]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
东北虎豹国家公园植物DNA微条形码数据库
吴峰
温佩颖
唐志珍
李青鉴
朱頔
王天明
葛剑平
王红芳
《北京师范大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2023
2
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