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植物转录因子分类、预测和数据库构建
被引量：
25
1
作者
靳进朴
郭安源
+5 位作者
何坤
张禾
朱其慧
陈新
高歌
罗静初
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第11期68-77,共10页
转录因子在植物生长发育和应对胁迫等过程中具有重要调控作用,基因组水平上系统预测植物转录因子是研究其功能和演化的基础。通过深入全面的文献调研,总结了一套完整的植物转录因子家族分类规则,开发了转录因子预测流程,构建了转录因子...
转录因子在植物生长发育和应对胁迫等过程中具有重要调控作用,基因组水平上系统预测植物转录因子是研究其功能和演化的基础。通过深入全面的文献调研,总结了一套完整的植物转录因子家族分类规则,开发了转录因子预测流程,构建了转录因子预测平台。基于该流程,从83种绿色植物中预测到129 288个转录因子,分属58个家族。对预测到的转录因子,从家族和个体两个层次进行了详尽注释,构建了植物转录因子数据库Plant TFDB(http://planttfdb.cbi.pku.edu.cn)。Plant TFDB提供了覆盖绿色植物主要谱系的转录因子,其中大部分为具有重要经济价值的单子叶和双子叶植物,已成为植物转录因子功能和演化研究的重要信息资源和分析平台。
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关键词
转录
因子
转录
因子
家族分类
转录
因子
预测
植物转录因子数据库
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题名
植物转录因子分类、预测和数据库构建
被引量：
25
1
作者
靳进朴
郭安源
何坤
张禾
朱其慧
陈新
高歌
罗静初
机构
北京大学生命科学学院北京大学蛋白质与植物基因研究重点实验室北京大学生物信息中心
华中科技大学生命科学与技术学院
孟山都公司
密歇根大学
杰克森基因组医学实验室
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第11期68-77,共10页
基金
国家自然科学基金项目(31071160
31171242
+2 种基金
31470330)
博士后科学基金项目(2014M560017
2015T80015)
文摘
转录因子在植物生长发育和应对胁迫等过程中具有重要调控作用,基因组水平上系统预测植物转录因子是研究其功能和演化的基础。通过深入全面的文献调研,总结了一套完整的植物转录因子家族分类规则,开发了转录因子预测流程,构建了转录因子预测平台。基于该流程,从83种绿色植物中预测到129 288个转录因子,分属58个家族。对预测到的转录因子,从家族和个体两个层次进行了详尽注释,构建了植物转录因子数据库Plant TFDB(http://planttfdb.cbi.pku.edu.cn)。Plant TFDB提供了覆盖绿色植物主要谱系的转录因子,其中大部分为具有重要经济价值的单子叶和双子叶植物,已成为植物转录因子功能和演化研究的重要信息资源和分析平台。
关键词
转录
因子
转录
因子
家族分类
转录
因子
预测
植物转录因子数据库
Keywords
transcription factor
classification of transcription factor
prediction of transcription factor
plant transcription factor database
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
植物转录因子分类、预测和数据库构建
靳进朴
郭安源
何坤
张禾
朱其慧
陈新
高歌
罗静初
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
25
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