-
题名Ca^(2+)处理对胡麻种子萌发影响的转录组分析
- 1
-
-
作者
郭秀娟
冯宇
吴瑞香
王利琴
杨建春
-
机构
山西农业大学高寒区作物研究所
山西农业大学农学院
-
出处
《生物技术通报》
北大核心
2025年第7期139-149,共11页
-
基金
山西农业大学科技创新提升工程(CXGC2023077)
山西省现代农业产业技术体系建设专项(2024CYJSTX05-16)
山西农业大学生物育种工程(YZGC076)。
-
文摘
【目的】探究Ca^(2+)对胡麻种子萌发特性的影响,揭示其调控机制,为胡麻种子萌发提供理论支持,拓展对Ca^(2+)作用机制的理解。【方法】用0.5%的氯化钙溶液对晋亚10号胡麻种子进行浸种处理,晾干后,进行萌发试验。利用生物信息学方法分析其在5、10和15 h的Ca^(2+)处理前后基因的表达情况。【结果】Ca^(2+)处理的胡麻种子露白率和出芽的时间明显地提前。通过对胡麻种子进行不同时间(5、10、15 h)的Ca^(2+)处理,并结合转录组测序分析其基因表达变化,在Ca^(2+)处理5 h后,与对照组相比,筛选出1357个差异基因,其中上调基因558个,下调基因799个。随着处理时间延长,差异基因数量显著减少。在10 h时,差异基因减少至641个(上调385个,下调256个);至15 h时,仅剩168个差异基因(上调151个,下调17个)。此外,进一步通过基因共表达网络分析,筛选出各组中最相关的模块及核心基因。【结论】在Ca^(2+)处理胡麻种子5 h组(H5)中,显著相关的Meblue模块包含147个基因,主要富集于碳代谢通路、植物激素信号转导通路及光合生物中的碳固定通路。而在15 h组(H15)中,显著相关的Mebrown模块包含141个基因,主要富集于碳代谢通路、类苯基丙烷生物合成通路和亚麻酸代谢通路。此外,本研究重点筛选出35个与植物激素信号转导通路相关的差异表达基因。
-
关键词
转录组
亚麻
种子发育
钙离子
差异基因表达
核心基因
表型变化
植物激素信号通路
-
Keywords
transcriptome
flax
seed germination
Ca^(2+)
differentially expressed gene
core gene
phenotypic change
plant hormone signaling pathway
-
分类号
S565.9
[农业科学—作物学]
-
