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题名不同马铃薯耐盐性转录组比较及耐盐基因的挖掘
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作者
王亚玲
江应红
孙慧
刘易
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机构
新疆维吾尔自治区农业科学院乌鲁木齐综合试验站
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出处
《新疆农业科学》
北大核心
2025年第5期1121-1130,共10页
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基金
新疆维吾尔自治区自然科学青年基金项目“基于转录组测序马铃薯耐盐基因的挖掘”(2021D01B69)
新疆维吾尔自治区重点研发任务专项“新疆马铃薯产业提质增效关键技术研究”(2022B02044)
国家马铃薯产业技术体系-乌鲁木齐综合试验站(CARS-09-ES36)。
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文摘
【目的】研究与马铃薯耐盐性相关的候选基因,为马铃薯耐盐性鉴定与评价和耐盐基因的挖掘提供理论依据。【方法】以耐盐品种晋薯16号及盐敏感品种冀张薯12号为试材,采用0%、0.5%、1%和1.5%NaCl溶液进行盐胁迫处理,在第8 d时,分析植株表型和生理生化指标,随后选择1%的盐浓度处理,分析2个品种进行转录组测序和生物信息学。【结果】相较于冀张薯12号,晋薯16号在盐胁迫条件下,具有较低的丙二醛含量。植物激素信号转导途径和类黄酮代谢途径在2个马铃薯品种中显示出明显的差异。【结论】筛选出与植物激素信号转导和类黄酮代谢相关的差异表达基因。
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关键词
马铃薯
盐胁迫
转录组测序
植物激素信号途径
类黄酮代谢途径
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Keywords
potato
salt stress
transcriptome sequencing
plant hormone signaling pathways
flavonoids metabolic pathways
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分类号
S532
[农业科学—作物学]
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题名硒处理下冰菜的转录组响应及相关基因功能分析
被引量：1
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作者
姚运法
练冬梅
林碧珍
赖正锋
洪建基
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机构
福建省农业科学院亚热带农业研究所
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出处
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2021年第12期2737-2747,共11页
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基金
福建省公益类项目(2019R1030-2)
漳州市自然科学基金(ZZ2019J21)。
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文摘
【目的】探索外源硒对冰菜转录组相应机制影响及相关功能基因挖掘。【方法】利用高通量测序技术,构建冰菜硒响应转录组数据库。【结果】硒处理对冰菜植物激素信号转导途径影响:除油菜素类固醇外,其它7个激素代谢途径均产生重要影响。硒处理浓度的增加,能够促进生长素信号转导,激活下游基因表达;细胞分裂素信号转导途径中,AHP对硒处理敏感,A-ARR受硒处理呈显著上调作用,但均对硒浓度变化不敏感;硒处理浓度增加,使得赤霉素信号转导下游TF得到激活;脱落酸信号转导途径中,低硒处理(10 mmol/L)导致SnRK2表达量显著降低,抑制气孔关闭,导致冰菜易脱水;硒处理(100 mmol/L)SnRK2蛋白表达量显著恢复;乙烯信号转导途径中ETR和ERF1/2表达量随着硒处理浓度的提高而降低;硒处理(10 mmol/L)促进茉莉酸信号途径中JAZ和MYC2表达量上调,调节硒对冰菜的逆境胁迫,硒处理(10 mmol/L)对JAZ和MYC2表达量影响不显著;水杨酸信号转导途径中TGA和PR-1在硒处理(10 mmol/L)表达量无上下调表达,硒处理(100 mmol/L)TGA表达量下调,PR-1表达量上调,激活冰菜硒响应能力。经实时定量PCR分析,7个DEGs相对表达量与转录组表达谱分析趋势完全一致。【结论】本研究为冰菜硒关键基因挖掘和遗传育种奠定了一定基础。
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关键词
冰菜
转录组
差异表达基因
植物激素信号转导途径
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Keywords
Ice plant
Transcriptome
Function annotation
DEGs
Plant hormone signal transduction pathway
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分类号
S641.9
[农业科学—蔬菜学]
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