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燕麦植物激素信号转导通路中响应干旱胁迫的关键基因
被引量：
4
1
作者
崔思宇
张志芬
+2 位作者
付晓峰
刘俊青
杨海顺
《麦类作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第11期1384-1393,共10页
植物激素信号转导通路是响应胁迫的重要通路,该通路中基因的表达调控作物的抗旱性。为挖掘燕麦植物激素信号转导通路中响应干旱胁迫的关键基因,本研究对燕麦幼苗进行不同干旱胁迫处理,取叶片进行转录组测序,分析不同处理下基因的表达。...
植物激素信号转导通路是响应胁迫的重要通路,该通路中基因的表达调控作物的抗旱性。为挖掘燕麦植物激素信号转导通路中响应干旱胁迫的关键基因,本研究对燕麦幼苗进行不同干旱胁迫处理,取叶片进行转录组测序,分析不同处理下基因的表达。结果表明,与正常水分条件相比,轻度干旱胁迫(PEG 10%)诱导624个基因表达发生显著变化(DEGs),重度干旱胁迫(PEG 20%)诱导13063个。GO富集分析显示,重度干旱胁迫下,DEGs主要富集在对胁迫反应的调节;KEGG分析显示,轻度干旱胁迫下,植物激素信号转导通路中1个ARF和2个CRE1基因表达显著下调,表达量较高,可能为燕麦在该通路中响应轻度干旱胁迫的基因;而重度干旱胁迫下,植物激素信号转导通路富集169个DEGs,其中生长素和脱落酸信号转导过程DEGs较多,分别占植物激素信号转导通路总DEGs的20.7%和15.9%;在8条激素信号转导过程中筛选出12个表达量较高的基因,可能为燕麦在该通路中响应重度干旱胁迫的关键基因。本研究将为今后燕麦抗旱基因的克隆和验证提供依据。
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关键词
燕麦
植物激素信号转导
干旱胁迫
基因
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职称材料
黑胫病对大宁晒烟转录组和代谢组的影响
2
作者
祁诗晴
首安发
+5 位作者
田梦强
石保峰
杨盟权
刘国顺
殷全玉
余金恒
《山东农业科学》
北大核心
2025年第6期37-46,63,共11页
大宁晒烟是广西贺州的优质晒黄烟,是制作卷烟的优良原料,而其对黑胫病的抗性极低。本研究通过转录组和代谢组分析比较大宁晒烟健康烟叶和感染黑胫病烟叶的差异表达基因和差异代谢物,探究大宁晒烟对黑胫病的响应机制。结果表明,转录组分...
大宁晒烟是广西贺州的优质晒黄烟,是制作卷烟的优良原料,而其对黑胫病的抗性极低。本研究通过转录组和代谢组分析比较大宁晒烟健康烟叶和感染黑胫病烟叶的差异表达基因和差异代谢物,探究大宁晒烟对黑胫病的响应机制。结果表明,转录组分析共筛选获得7 194个显著差异表达基因,代谢组分析共鉴定出198个显著差异代谢物。通过转录组和代谢组联合分析发现:①大宁晒烟在防御黑胫病侵染过程中,植物激素信号转导和苯丙烷类生物合成途径发挥了重要作用;②推测氨酰基-tRNA生物合成,氰基氨基酸代谢,缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸降解,半胱氨酸和蛋氨酸代谢,精氨酸和脯氨酸代谢等代谢途径与大宁晒烟响应黑胫病胁迫相关。本研究揭示了大宁晒烟响应烟草黑胫病侵染的主要基因转录调控网络和代谢途径,可为提高大宁晒烟黑胫病抗性研究提供理论依据。
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关键词
大宁晒烟
黑胫病
转录组
代谢组
植物激素信号转导
苯丙烷类生物合成
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职称材料
硒处理下冰菜的转录组响应及相关基因功能分析
被引量：
1
3
作者
姚运法
练冬梅
+2 位作者
林碧珍
赖正锋
洪建基
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2021年第12期2737-2747,共11页
【目的】探索外源硒对冰菜转录组相应机制影响及相关功能基因挖掘。【方法】利用高通量测序技术,构建冰菜硒响应转录组数据库。【结果】硒处理对冰菜植物激素信号转导途径影响:除油菜素类固醇外,其它7个激素代谢途径均产生重要影响。硒...
【目的】探索外源硒对冰菜转录组相应机制影响及相关功能基因挖掘。【方法】利用高通量测序技术,构建冰菜硒响应转录组数据库。【结果】硒处理对冰菜植物激素信号转导途径影响:除油菜素类固醇外,其它7个激素代谢途径均产生重要影响。硒处理浓度的增加,能够促进生长素信号转导,激活下游基因表达;细胞分裂素信号转导途径中,AHP对硒处理敏感,A-ARR受硒处理呈显著上调作用,但均对硒浓度变化不敏感;硒处理浓度增加,使得赤霉素信号转导下游TF得到激活;脱落酸信号转导途径中,低硒处理(10 mmol/L)导致SnRK2表达量显著降低,抑制气孔关闭,导致冰菜易脱水;硒处理(100 mmol/L)SnRK2蛋白表达量显著恢复;乙烯信号转导途径中ETR和ERF1/2表达量随着硒处理浓度的提高而降低;硒处理(10 mmol/L)促进茉莉酸信号途径中JAZ和MYC2表达量上调,调节硒对冰菜的逆境胁迫,硒处理(10 mmol/L)对JAZ和MYC2表达量影响不显著;水杨酸信号转导途径中TGA和PR-1在硒处理(10 mmol/L)表达量无上下调表达,硒处理(100 mmol/L)TGA表达量下调,PR-1表达量上调,激活冰菜硒响应能力。经实时定量PCR分析,7个DEGs相对表达量与转录组表达谱分析趋势完全一致。【结论】本研究为冰菜硒关键基因挖掘和遗传育种奠定了一定基础。
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关键词
冰菜
转录组
差异表达基因
植物激素信号转导
途径
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职称材料
题名
燕麦植物激素信号转导通路中响应干旱胁迫的关键基因
被引量：
4
1
作者
崔思宇
张志芬
付晓峰
刘俊青
杨海顺
机构
内蒙古自治区农牧业科学院特色作物研究所
出处
《麦类作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第11期1384-1393,共10页
基金
内蒙古自治区科技重大专项(2021SZD0017)
内蒙古农牧业创新基金(2022CXJJN04)
国家燕麦荞麦产业技术体系(CARS-07-A)。
文摘
植物激素信号转导通路是响应胁迫的重要通路,该通路中基因的表达调控作物的抗旱性。为挖掘燕麦植物激素信号转导通路中响应干旱胁迫的关键基因,本研究对燕麦幼苗进行不同干旱胁迫处理,取叶片进行转录组测序,分析不同处理下基因的表达。结果表明,与正常水分条件相比,轻度干旱胁迫(PEG 10%)诱导624个基因表达发生显著变化(DEGs),重度干旱胁迫(PEG 20%)诱导13063个。GO富集分析显示,重度干旱胁迫下,DEGs主要富集在对胁迫反应的调节;KEGG分析显示,轻度干旱胁迫下,植物激素信号转导通路中1个ARF和2个CRE1基因表达显著下调,表达量较高,可能为燕麦在该通路中响应轻度干旱胁迫的基因;而重度干旱胁迫下,植物激素信号转导通路富集169个DEGs,其中生长素和脱落酸信号转导过程DEGs较多,分别占植物激素信号转导通路总DEGs的20.7%和15.9%;在8条激素信号转导过程中筛选出12个表达量较高的基因,可能为燕麦在该通路中响应重度干旱胁迫的关键基因。本研究将为今后燕麦抗旱基因的克隆和验证提供依据。
关键词
燕麦
植物激素信号转导
干旱胁迫
基因
Keywords
Oat
Plant hormone signal transduction
Drought stress
Gene
分类号
S512.6 [农业科学—作物学]
S330 [农业科学—作物遗传育种]
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职称材料
题名
黑胫病对大宁晒烟转录组和代谢组的影响
2
作者
祁诗晴
首安发
田梦强
石保峰
杨盟权
刘国顺
殷全玉
余金恒
机构
河南农业大学烟草学院
中国烟草总公司广西区公司
出处
《山东农业科学》
北大核心
2025年第6期37-46,63,共11页
基金
国家自然科学基金项目(32400218)
中国烟草总公司广西壮族自治区公司科技项目(202245000024085,202345100024261)
+1 种基金
河南省科技攻关项目(242102110240)
河南农业大学高层次人才专项支持基金项目(30501474)。
文摘
大宁晒烟是广西贺州的优质晒黄烟,是制作卷烟的优良原料,而其对黑胫病的抗性极低。本研究通过转录组和代谢组分析比较大宁晒烟健康烟叶和感染黑胫病烟叶的差异表达基因和差异代谢物,探究大宁晒烟对黑胫病的响应机制。结果表明,转录组分析共筛选获得7 194个显著差异表达基因,代谢组分析共鉴定出198个显著差异代谢物。通过转录组和代谢组联合分析发现:①大宁晒烟在防御黑胫病侵染过程中,植物激素信号转导和苯丙烷类生物合成途径发挥了重要作用;②推测氨酰基-tRNA生物合成,氰基氨基酸代谢,缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸降解,半胱氨酸和蛋氨酸代谢,精氨酸和脯氨酸代谢等代谢途径与大宁晒烟响应黑胫病胁迫相关。本研究揭示了大宁晒烟响应烟草黑胫病侵染的主要基因转录调控网络和代谢途径,可为提高大宁晒烟黑胫病抗性研究提供理论依据。
关键词
大宁晒烟
黑胫病
转录组
代谢组
植物激素信号转导
苯丙烷类生物合成
Keywords
Daning sun-cured tobacco
Black shank disease
Transcriptome
Metabolome
Plant hor-mone signal transduction
Phenylpropanoid biosynthesis
分类号
S435.72 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
硒处理下冰菜的转录组响应及相关基因功能分析
被引量：
1
3
作者
姚运法
练冬梅
林碧珍
赖正锋
洪建基
机构
福建省农业科学院亚热带农业研究所
出处
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2021年第12期2737-2747,共11页
基金
福建省公益类项目(2019R1030-2)
漳州市自然科学基金(ZZ2019J21)。
文摘
【目的】探索外源硒对冰菜转录组相应机制影响及相关功能基因挖掘。【方法】利用高通量测序技术,构建冰菜硒响应转录组数据库。【结果】硒处理对冰菜植物激素信号转导途径影响:除油菜素类固醇外,其它7个激素代谢途径均产生重要影响。硒处理浓度的增加,能够促进生长素信号转导,激活下游基因表达;细胞分裂素信号转导途径中,AHP对硒处理敏感,A-ARR受硒处理呈显著上调作用,但均对硒浓度变化不敏感;硒处理浓度增加,使得赤霉素信号转导下游TF得到激活;脱落酸信号转导途径中,低硒处理(10 mmol/L)导致SnRK2表达量显著降低,抑制气孔关闭,导致冰菜易脱水;硒处理(100 mmol/L)SnRK2蛋白表达量显著恢复;乙烯信号转导途径中ETR和ERF1/2表达量随着硒处理浓度的提高而降低;硒处理(10 mmol/L)促进茉莉酸信号途径中JAZ和MYC2表达量上调,调节硒对冰菜的逆境胁迫,硒处理(10 mmol/L)对JAZ和MYC2表达量影响不显著;水杨酸信号转导途径中TGA和PR-1在硒处理(10 mmol/L)表达量无上下调表达,硒处理(100 mmol/L)TGA表达量下调,PR-1表达量上调,激活冰菜硒响应能力。经实时定量PCR分析,7个DEGs相对表达量与转录组表达谱分析趋势完全一致。【结论】本研究为冰菜硒关键基因挖掘和遗传育种奠定了一定基础。
关键词
冰菜
转录组
差异表达基因
植物激素信号转导
途径
Keywords
Ice plant
Transcriptome
Function annotation
DEGs
Plant hormone signal transduction pathway
分类号
S641.9 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
燕麦植物激素信号转导通路中响应干旱胁迫的关键基因
崔思宇
张志芬
付晓峰
刘俊青
杨海顺
《麦类作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
4
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
黑胫病对大宁晒烟转录组和代谢组的影响
祁诗晴
首安发
田梦强
石保峰
杨盟权
刘国顺
殷全玉
余金恒
《山东农业科学》
北大核心
2025
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
硒处理下冰菜的转录组响应及相关基因功能分析
姚运法
练冬梅
林碧珍
赖正锋
洪建基
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2021
1
在线阅读
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职称材料
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