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一株海洋杆菌属新菌种XAAS-72^(T)的植物促生功能分析及ACC脱氨酶蛋白结构预测
1
作者
王慧楠
朱静
+4 位作者
谢文文
何子璇
柏晓玉
朱艳蕾
张志东
《新疆农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第7期1778-1785,共8页
【目的】研究海洋杆菌属新菌种XAAS-72的植物促生功能,挖掘其潜在功能基因。【方法】通过对菌株全基因组测序,分析相关功能基因组成,挖掘ACC脱氨酶合成相关的候选基因,并进行功能预测。【结果】海洋杆菌属新种Pontibacter kalidii XAAS...
【目的】研究海洋杆菌属新菌种XAAS-72的植物促生功能,挖掘其潜在功能基因。【方法】通过对菌株全基因组测序,分析相关功能基因组成,挖掘ACC脱氨酶合成相关的候选基因,并进行功能预测。【结果】海洋杆菌属新种Pontibacter kalidii XAAS-72菌悬液处理可显著提高盆栽小麦麦苗生长,其基因组长度为5054860 bp,含1个环形质粒,总GC含量为54.52%,注释的基因数目为4391个,编码蛋白数4261个,具有多种抗逆和促生相关基因。其与Pontibacter sp.BAB1700的ACC脱氨酶(1-aminoeyclopropane-1-earboxylate-deaminase)相似度最高为72.48%。该蛋白属于不稳定亲水性蛋白,不具备跨膜结构,且无信号肽结构。【结论】海洋杆菌属新种XAAS-72蕴藏着丰富的抗逆和植物促生相关基因。
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关键词
海洋杆菌属
植物促生特性
ACC脱氨酶
结构预测
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题名
一株海洋杆菌属新菌种XAAS-72^(T)的植物促生功能分析及ACC脱氨酶蛋白结构预测
1
作者
王慧楠
朱静
谢文文
何子璇
柏晓玉
朱艳蕾
张志东
机构
新疆师范大学生命科学学院
新疆农业科学院微生物应用研究所/新疆特殊环境微生物实验室
新疆大学生命科学与技术学院
出处
《新疆农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第7期1778-1785,共8页
基金
新疆维吾尔自治区自然科学基金项目“杰出青年基金”(2022D01E19)
新疆农业科学院科技创新重点培育专项(xjkcpy-2022004)
新疆农业科学院农业科技创新稳定支持专项(xjnkywdzc-2023005)。
文摘
【目的】研究海洋杆菌属新菌种XAAS-72的植物促生功能,挖掘其潜在功能基因。【方法】通过对菌株全基因组测序,分析相关功能基因组成,挖掘ACC脱氨酶合成相关的候选基因,并进行功能预测。【结果】海洋杆菌属新种Pontibacter kalidii XAAS-72菌悬液处理可显著提高盆栽小麦麦苗生长,其基因组长度为5054860 bp,含1个环形质粒,总GC含量为54.52%,注释的基因数目为4391个,编码蛋白数4261个,具有多种抗逆和促生相关基因。其与Pontibacter sp.BAB1700的ACC脱氨酶(1-aminoeyclopropane-1-earboxylate-deaminase)相似度最高为72.48%。该蛋白属于不稳定亲水性蛋白,不具备跨膜结构,且无信号肽结构。【结论】海洋杆菌属新种XAAS-72蕴藏着丰富的抗逆和植物促生相关基因。
关键词
海洋杆菌属
植物促生特性
ACC脱氨酶
结构预测
Keywords
Pontibacter
plant growth-promoting character
ACC deaminase
structure prediction
分类号
S188 [农业科学—农业基础科学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一株海洋杆菌属新菌种XAAS-72^(T)的植物促生功能分析及ACC脱氨酶蛋白结构预测
王慧楠
朱静
谢文文
何子璇
柏晓玉
朱艳蕾
张志东
《新疆农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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